在這個里面還有一個經(jīng)常用到的文獻(xiàn)檢索數(shù)據(jù)庫：PubMed : https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ 。所以這幾天就好好的講解一下關(guān)于 PubMed 的使用方法。今天主要講一下關(guān)于 PubMed 的關(guān)鍵詞檢索方面的內(nèi)容。

以下使用教程主要來自于。PubMed User Guide: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/help/? 。有興趣的可以閱讀使用手冊。

文件檢索方法

PubMed 提供了三種基本的檢索方法：

1.直接檢索：在檢索界面，直接輸入想要檢索的內(nèi)容即可。比如"mutation"。

2.高級檢索： 點擊主頁的Advanced就可以進行高級檢索。在高級就檢索當(dāng)中可以選擇在哪個類型當(dāng)中進行檢索。比如在題目當(dāng)中檢索 mutation。就可以選擇好標(biāo)題區(qū)域之后進行輸入“mutation”。

3.標(biāo)簽檢索: 標(biāo)簽檢索和高級檢索是一樣的。只不過高級檢索可以通過鼠標(biāo)來選擇想要檢索的類型。而標(biāo)簽則以在檢索內(nèi)容后面添加標(biāo)簽的方式來規(guī)定檢索范圍。pubmed 當(dāng)中支持的標(biāo)簽一共有下面這么多種。

在上面的例子當(dāng)中，輸入"mutation[TI]"就得到相同的結(jié)果

ATM 搜索系統(tǒng)

我們熟悉的搜索引擎基本上是根據(jù)輸入的內(nèi)容返回和輸入內(nèi)容完全匹配的信息。而 PubMed 則不是這樣的。PubMed 的檢索是基于自動術(shù)語映射 (Automatic Term Mapping, ATM) 系統(tǒng)來進行檢索的。

在 ATM 系統(tǒng)中，輸入的內(nèi)容不會直接進行檢索。而是先在一個包含 [[Mesh-主題詞查詢數(shù)據(jù)庫]], 雜志名以及作者信息的“詞典” 當(dāng)中進行匹配。尋找和關(guān)鍵詞類似的術(shù)語。然后利用匹配到術(shù)語進行檢索。

例如"mutation (突變)"這個關(guān)鍵詞。在輸入到 PubMed 之后，利用 ATM 系統(tǒng)，會找到很多和 mutaion 有關(guān)的詞語。最終檢索的其實是下面的內(nèi)容

關(guān)鍵詞檢索

在知道如何避免之前還是需要了解 PubMed 檢索的相關(guān)基礎(chǔ)知識

和百度一樣，在 PubMed 當(dāng)中只需要輸入想要檢索的關(guān)鍵詞就返回結(jié)果。所以一些基本的檢索方法還是通用的。

1.輸入關(guān)鍵詞檢索：例如想要檢索"mutation"。就直接輸入即可。

2.布爾符連接：如果有多個關(guān)鍵詞，且關(guān)鍵詞之間有一些邏輯關(guān)系。那么就可以通過布爾值 (AND, OR, NOT) 來進行連接。例如：想要檢索突變和腫瘤。那就可以輸入: "mutation AND cancer"

3.大小寫忽略：在英文檢索當(dāng)中涉及到字母大小寫的情況。PubMed 會忽略大小寫來進行檢索。例如: "mutation", "Mutation"以及"MUTATION“檢索的結(jié)果是一樣的。

4.符號轉(zhuǎn)換：除了大小寫轉(zhuǎn)換，一些沒意義的符號例如，逗號，等于號等等。在輸入之后也會被強制性的轉(zhuǎn)換為空格。例如"mutation = snp"和"mutation snp“檢索的結(jié)果是一樣的。

除了上面常見的輸入方式。PubMed 也可以進行詞組檢索。這個也是可以避免之前說的過多匹配的方法。

詞組檢索

詞組檢索會強制 PubMed 只匹配完全一致的內(nèi)容。而不會擴展到相近的詞語。詞組檢索的方式有三種：

1.檢索詞加雙引號;

2.檢索詞加標(biāo)簽；

3.使用- 鏈接檢索詞 (這個只適用于多個關(guān)鍵詞)

例如，我們還是檢索 mutation。詞組檢索和非詞組檢索的結(jié)果有很大的差別。

因此通過詞組檢索到方式，就可以去掉一些非檢索式的結(jié)果了。

多詞檢索

上面說的只是一個單詞檢索的情況。我們還會有輸入詞語檢索的情況。

詞語在字典中找到對應(yīng)術(shù)語

如果==不使用詞組檢索==，會拿對應(yīng)詞語術(shù)語在特定類型當(dāng)中進行檢索。同時也會把詞語拆成單個單詞進行檢索。例如: "INDEL Mutation"

如果==使用詞組檢索==的話，則只會在特定的范圍內(nèi)進行檢索。

詞語在字典中找不到對應(yīng)術(shù)語

如果==不使用詞組檢索==，則會把輸入的內(nèi)容拆成每個單詞，先在“詞典”中進行匹配然后 AND 合并。例如: "DNA PDCD1"和 "DNA AND PDCD1"的結(jié)果是一樣的。

而如果==使用""進行詞組檢索"==, 由于詞語找不到對應(yīng)術(shù)語，所以還是會拆開進行 ATM 系統(tǒng)檢索，最后 AND 在一起。但是也會提示原來的檢索是沒有結(jié)果。

如果==使用-進行詞組檢索==，在找不到對應(yīng)術(shù)語的情況下就返回 0 個檢索結(jié)果。

以上就是關(guān)于 PubMed 關(guān)鍵詞搜索當(dāng)中需要注意的內(nèi)容了。除了基本的檢索，上面也介紹了 PubMed 可以進行高級摸索。下一節(jié)關(guān)于 PubMed 高級檢索的內(nèi)容。