Pattern Recognition （PCA OPLS-DA HCA）操作說明

Simcap 14.0

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數據要求：

列在Excel表：

組別：Observations（eg。產地，年份）作為Rows。

變量：Variables （成分，活性的Values）作為Columns。

分析的Values：峰面積，含量，豐度，表達量等。

Step1：

步驟如下：建立project

File>New project>open excel數據

或者cancel之后，File>New spreadsheet>from file(準備好excel數據) or Blank（可以自己復制，粘貼數據）

Step2：定義Column和Raw的ID, Column和Raw只能定義一個primary ID，其他的label可以作為secondary ID，空白區(qū)域的 Column和Raw選擇exclude>finish>保存在合適位置，后綴名usp.

Step3：PCA analysis：

Finish后默認PCA>Autofit即可

各種PCA下的各種圖

修改模型參數（如定義分組）right click空白區(qū)域（project window）>edict Model,在advanced mode下修改

Class可以定義分組

右Click圖形區(qū)域>Format Plot 修改圖形參數

PCA下的HCA：菜單欄analysis>HCA 參數設置（分類參數，顏色）right click圖形空白>properties

Step4： PCA模型修改為OPLS-DA模型：

right click空白區(qū)域（project window）>New as model>next

genj

Class：對組別進行分類>next

選擇PLS模型

Change Type可以修改為需要的正交模型OPLS-DA

其他圖形Score Plot參數和如PCA，VIP值在Favorites>PLS plots 選擇。