1.研發(fā)費用影響企業(yè)進(jìn)行高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定及后續(xù)管理

《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法》規(guī)定，研發(fā)費用是高企認(rèn)定的必要條件之一，被細(xì)化為研究開發(fā)費用占比、境內(nèi)研究開發(fā)費用占比和其他費用占比等具體指標(biāo)，只有同時滿足高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定的8個條件，方可向認(rèn)定機構(gòu)提出認(rèn)定申請，通過認(rèn)定的高新技術(shù)企業(yè)，3年的有效期內(nèi)的每年5月底前需要填報研發(fā)費用、經(jīng)營收入等數(shù)據(jù)，向認(rèn)定機構(gòu)報送企業(yè)年度發(fā)展情況報表。

2.研發(fā)費用影響企業(yè)計算研發(fā)費用加計扣除

《研發(fā)費用稅前加計扣除歸集范圍》規(guī)定的稅前加計扣除研發(fā)費用范圍與《加強研發(fā)費用財務(wù)管理的若干意見》規(guī)定的研發(fā)費用范圍、《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法》規(guī)定的研發(fā)費用范圍不同，稅前加計扣除口徑對研發(fā)費用進(jìn)行了嚴(yán)格的限定，如果歸集錯誤，將影響企業(yè)加計扣除基數(shù)的計算，進(jìn)而影響企業(yè)所得稅應(yīng)納稅額的計算。

3.研發(fā)費用影響企業(yè)享受小微企業(yè)普惠性稅收減免優(yōu)惠

研發(fā)費用歸集影響加計扣除，進(jìn)而影響企業(yè)所得稅應(yīng)納稅所得額的計算。高新技術(shù)企業(yè)在年度匯算時享受固定資產(chǎn)一次性稅前扣除和研發(fā)費用加計扣除優(yōu)惠政策后，只要應(yīng)納稅所得額不超過300萬同時資產(chǎn)總額不超過5000萬元、從業(yè)人數(shù)不超過300人的，可以選擇適用對自己更為有利的小微企業(yè)普惠性稅收減免政策，如果歸集錯誤，只能適用減按15%稅率征稅，不利于企業(yè)節(jié)約稅收成本。