小云帶你學(xué)繪圖之相關(guān)性分析ggcor包
不管你是苦逼的醫(yī)學(xué)生、還是更苦逼農(nóng)學(xué)、生物學(xué)生,相信相關(guān)性分析一定是你科研路上要攻克的重要分析之一。相較于方差分析、聚類分析,相關(guān)性分析原理較為簡單,這里小云就不再贅述了。今天的重點是繪圖,話不多說,泡上一杯枸杞,代碼開擼。
說起相關(guān)性分析,就不得不提相關(guān)性神包:corrplot(膜拜魏太云老師),盡管corrplot有著絕美的默認配色,唯美的畫風(fēng),勞模般的更新速度。但終究是被顯著性打倒。Corrplot不能在相關(guān)性r值的右上角增加顯著性標(biāo)識,這一點注定了corrplot的圖不能用于發(fā)paper。那么問題來了,有什么包可以在r值右上角增加顯著性標(biāo)識嗎?有請我們今天的主角:linkET。
曾幾何時ggcor也是江湖上響當(dāng)當(dāng)?shù)腞包,但目前ggcor已經(jīng)停更,好在github還有備份的ggcor,接下來就由小云帶大家學(xué)習(xí)一下ggcor包吧。
首先是下載ggcor包,不能直接install.packages,需要用devtools安裝

ggcor是基于ggplot2開發(fā)的包,把ggplot2一起導(dǎo)入了準(zhǔn)沒錯

接下來掌聲有請我們的老演員之mtcars數(shù)據(jù)集閃亮登場


效果還可以,再把r值和顯著性標(biāo)記圖層填充上去


完美,再修改下顏色字體字號什么的,這妥妥的發(fā)表級相關(guān)性圖嘛。



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