大家好！我是BioLadder生物信息在線可視化云平臺(tái)的工程師小宇，今天我來(lái)給大家分享怎樣用BioLadder畫出常用的詞云圖！

如果您反饋問(wèn)題，報(bào)告Bug，提出新的需求，請(qǐng)直接在公眾號(hào)內(nèi)發(fā)留言給我哦！為感謝您對(duì)BioLadder的認(rèn)可我們還有星爸爸同款收納包相贈(zèng)哦！小宇先謝謝大家嘍！

1.什么是詞云圖？

“詞云”由美國(guó)西北大學(xué)新聞學(xué)副教授、新媒體專業(yè)主任里奇·戈登于2006年最先使用。戈登做過(guò)編輯、記者，曾擔(dān)任邁阿密先驅(qū)報(bào)新媒體版的主任。他一直很關(guān)注網(wǎng)絡(luò)內(nèi)容發(fā)布的最新形式——即那些只有互聯(lián)網(wǎng)可以采用而報(bào)紙、廣播、電視等其它媒體都望塵莫及的傳播方式。通常，這些最新的、最適合網(wǎng)絡(luò)的傳播方式，也是最好的傳播方式。
?“詞云”就是通過(guò)形成“關(guān)鍵詞云層”或“關(guān)鍵詞渲染”，對(duì)文本中出現(xiàn)頻率較高的“關(guān)鍵詞”進(jìn)行視覺(jué)上的突出。詞云圖過(guò)濾掉大量的文本信息，使瀏覽者只要一眼掃過(guò)文本就可以領(lǐng)略文本的主旨。本文我們就來(lái)討論一下詞云圖是如何繪制的以及如何對(duì)其進(jìn)行解讀。

用BioLadder云平臺(tái)畫詞云圖

2.繪圖前的數(shù)據(jù)準(zhǔn)備

demo數(shù)據(jù)可以在

https://www.bioladder.cn/shiny/zyp/bioladder2/demoData/wordcloud/wordcloud.zip下載。

本工具支持兩種數(shù)據(jù)格式，一種是詞頻，另一種是一段話。

2.1 詞頻

必須要有列名，名稱自定義。第一列為名稱，第二列為名稱對(duì)應(yīng)的數(shù)量。

2.2?一段話

支持中文和英文，工具會(huì)自動(dòng)將其拆分為詞，并統(tǒng)計(jì)個(gè)數(shù)

3.BioLadder生信云平臺(tái)在線繪制詞云圖

不想寫代碼？可以用BioLadder生信云平臺(tái)在線繪制詞云圖。

免費(fèi)使用，登錄后暢享50+模塊

網(wǎng)址：https://www.bioladder.cn/web/#/chart/20

3.1?導(dǎo)入數(shù)據(jù)文件

1. 選擇導(dǎo)入文件的類型。文件類型說(shuō)明請(qǐng)參照之前的“繪圖前的數(shù)據(jù)準(zhǔn)備”。

2.在左下角的文本框粘入對(duì)應(yīng)類型的數(shù)據(jù)

3.2?調(diào)整參數(shù)

根據(jù)需求調(diào)整參數(shù)即可

??選擇圖案形狀：有圓形，四邊形，三角形，五角星圖案可供選擇

??選擇字體大?。涸O(shè)置字體大小，一般字體越小，圖案的輪廓越清晰

3.3?提交查看

上傳完數(shù)據(jù)，并調(diào)好參數(shù)后，點(diǎn)擊右上方“提交”按鈕，圖像會(huì)出現(xiàn)在左側(cè)。如果沒(méi)有上傳自己的數(shù)據(jù)，會(huì)使用默認(rèn)的demo數(shù)據(jù)繪圖。

3.4?下載

??點(diǎn)擊圖片下載中的下載按鈕，下載詞云圖

??點(diǎn)擊詞頻表格下載中的下載按鈕，下載生成的詞頻表格

4.?詞云圖結(jié)果解讀

詞云圖是通過(guò)使每個(gè)字的大小與其出現(xiàn)頻率成正比，顯示不同單詞在給定文本中的出現(xiàn)頻率，然后將所有的字詞排在一起，形成云狀圖案，可以以多種形狀排列，圓形，五角星或其他形狀。在詞云圖上使用顏色通常都是毫無(wú)意義的，主要是為了美觀。

5.BioLadder云平臺(tái)

網(wǎng)址：https://www.bioladder.cn/

BioLadder目前上線了生物學(xué)分析最常用的50多個(gè)模塊，主要包括以下四類：

數(shù)據(jù)可視化：箱線圖，南丁格爾玫瑰圖，韋恩圖，UpSet圖，餅圖，詞云圖，核密度圖，小提琴圖，弦圖，柱形圖等

組學(xué)數(shù)據(jù)分析：序列的多重比對(duì)，表達(dá)數(shù)據(jù)的CV曲線圖，PCA，T-SNE，熱圖，相關(guān)性熱圖等，趨勢(shì)分析的mFuzz，差異分析的火山圖，富集分析的氣泡圖，修飾位點(diǎn)上下游模體分析的seqLogo，Motif熱圖等

功能分析：GO弦圖，相互作用網(wǎng)絡(luò)圖，富集分析

數(shù)據(jù)預(yù)處理：歸一化，補(bǔ)值，F(xiàn)DR校正，長(zhǎng)寬表互換等

好了韋恩圖的繪制就到這里了，后續(xù)大家想要了解什么內(nèi)容可以給我們?cè)u(píng)論反饋，我們會(huì)根據(jù)大家的意見(jiàn)持續(xù)更新。我們歡迎您以任何方式提出您的優(yōu)化意見(jiàn)，使BioLadder平臺(tái)成為廣大科研工作者的生物信息分析首選平臺(tái)！

青蓮百奧可提供一站式蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、多組學(xué)聯(lián)合分析等科研服務(wù)。青蓮百奧在整體實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)方面經(jīng)驗(yàn)豐富，界內(nèi)最全的Bioactive Database、NeuroPedia Database，專業(yè)分析軟件Peaks，海歸坐鎮(zhèn)生信分析團(tuán)隊(duì)，助您在科研道路上乘風(fēng)破浪，沖擊高水平文章。

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