生物化學(xué) 藥立波 b站視頻配套 第二十章:常用分子生物學(xué)技術(shù)的原理及其應(yīng)用
第二十章:常用分子生物學(xué)技術(shù)的原理及其應(yīng)用
第一節(jié):分子雜交與印跡技術(shù)
分子雜交技術(shù):利用DNA變性與復(fù)性這一基本性質(zhì),結(jié)合印跡技術(shù)和探針技術(shù),可進(jìn)行DNA和rna定性或定量分析。
(一)印跡技術(shù)
將瓊脂糖電泳分離的DNA片段在膠中變性使其變成單鏈,然后將硝酸纖維素膜放在膠上,將膠中的DNA轉(zhuǎn)移到nc膜上,使之成為固相化分子。將載有DNA單鏈分子的nc膜放在雜交反應(yīng)溶液中,溶液中具有互補(bǔ)序列的DNA或rna單鏈分子就可以結(jié)合到存在于nc膜上的DNA分子上。
(二)探針技術(shù)
探針:指的是帶有特殊可檢測標(biāo)記的核酸片段,它具有特定的序列,能夠與待測的核酸片段互補(bǔ)結(jié)合,因此可以用于檢測核酸樣品中存在的特定基因。
二:印跡技術(shù)的類別及應(yīng)用
印跡技術(shù)可以分為DNA印跡、rna印跡和蛋白質(zhì)印跡三大類。
(一)DNA印跡
DNA印跡=southern印跡:dna樣品經(jīng)限制性內(nèi)切酶消化后進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,將含有DNA區(qū)帶的凝膠在變性溶液中處理后,再將膠中的DNA分子轉(zhuǎn)移到nc膜上并使DNA固定在nc膜上,即可用于雜交反應(yīng)。DNA印跡技術(shù)主要用于基因組DNA的定性和定量分析。
步驟:
(二)rna印跡
Rna印跡=northern:其技術(shù)原理與DNA印跡相同,但rna分子較小,轉(zhuǎn)移前無需進(jìn)行限制性內(nèi)切酶切割。Rna印跡技術(shù)主要用于檢測某一組織或細(xì)胞中已知的特異mrna的表達(dá)水平,也可比較不同組織和細(xì)胞中的同一基因的表達(dá)情況。
(三)蛋白質(zhì)印跡
蛋白質(zhì)印跡=免疫印跡=western:先將混合蛋白質(zhì)用聚丙烯酰胺凝膠電泳按分子大小分開,再將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到nc膜上,首先用第一抗體與轉(zhuǎn)移膜上相應(yīng)的蛋白質(zhì)分子結(jié)合,然后用堿性磷酸酶標(biāo)記的第二抗體與之結(jié)合,反應(yīng)之后用放射自顯影來檢測蛋白質(zhì)區(qū)帶的信號,蛋白質(zhì)印跡技術(shù)用于檢測樣品中特異性蛋白質(zhì)的存在、細(xì)胞中特異蛋白質(zhì)的半定量分析以及蛋白質(zhì)分子的相互作用研究等。
第二節(jié):pcr技術(shù)的原理與應(yīng)用
一:pcr技術(shù)的工作原理
Pcr=聚合酶鏈反應(yīng):以擬擴(kuò)增的DNA分子為模板,在引物和DNA聚合酶作用下,依半保留機(jī)制沿模板鏈延伸直至完成2條新鏈合成。重復(fù)這一過程,即可使目的DNA片段得到擴(kuò)增。
反應(yīng)步驟:
1.變性:將反應(yīng)體系加熱至94度,使模板DNA完全變性稱為單鏈
2.退火:將溫度下降至適宜溫度,使引物與模板DNA結(jié)合
3.延伸:將溫度升至72度,DNA聚合酶以dntp為底物催化DNA的合成反應(yīng)。
上述三個步驟為一個循環(huán),新合成的DNA分子繼續(xù)作為下一輪合成的模板,經(jīng)多次循環(huán)后即可達(dá)到擴(kuò)增DNA片段的目的。
二:pcr技術(shù)的主要用途
(一)目的基因的克隆
(二)基因的體外突變
(三)DNA和rna的微量分析
(四)DNA序列測定
(五)基因突變分析
三:幾種重要的pcr衍生技術(shù)
(一)逆轉(zhuǎn)錄pcr技術(shù)
(二)原位pcr技術(shù)
(三)實(shí)時pcr技術(shù)
第三節(jié):基因文庫
基因文庫:指的是一個包含了某一生物體全部DNA序列的克隆載體。基因文庫可分為基因組DNA文庫和cDNA文庫
一:基因組DNA文庫
基因組DNA文庫:以DNA片段的形式儲存著某一生物的全部基因組DNA信息。
二:cDNA文庫
cDNA文庫:包含某一組織細(xì)胞在一定條件下所表達(dá)的全部mrna經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄而合成的cDNA序列的克隆群體,它以cDNA片段的形式貯存這該組織細(xì)胞的基因表達(dá)信息。
第四節(jié):生物芯片技術(shù)
一:基因芯片技術(shù)
基因芯片:是指將許多特定的DNA片段有規(guī)律得緊密排列固定于單位面積的支持物上,然后與待測的熒光標(biāo)記樣品進(jìn)行雜交,雜交后用熒光檢測系統(tǒng)等對芯片進(jìn)行掃描,通過計(jì)算機(jī)系統(tǒng)對每一位點(diǎn)的熒光信號做出檢測,比較和分析,從而迅速得出定性和定量的結(jié)果。
二:蛋白質(zhì)芯片
蛋白質(zhì)芯片:將高度密集排列的蛋白質(zhì)分子作為探針點(diǎn)陣固定在固相支持物上,當(dāng)與待測蛋白質(zhì)樣品反應(yīng)時,可捕獲樣品中的靶蛋白,再經(jīng)檢測系統(tǒng)對靶蛋白進(jìn)行定性和定量分析的一種技術(shù)。
第五節(jié):生物大分子相互作用研究技術(shù)
一:蛋白質(zhì)相互作用研究技術(shù)
(一)標(biāo)簽蛋白沉淀
(二)酵母雙雜交技術(shù)的原理和用途
二:DNA-蛋白質(zhì)相互作用分析技術(shù)
(一)電泳遷移率變動分析
染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)