前面兩篇推文小編給大家介紹了不會(huì)編程的研究人員也可以通過Excel、文本編輯器和dos腳本命令進(jìn)行數(shù)據(jù)處理，完成部分生

但Excel、文本編輯器和腳本命令等只能完成基礎(chǔ)的生信數(shù)據(jù)處理，對于更高級的生信分析（如生信特異的火山圖、富集分析的氣泡圖、趨勢分析等）就無能為力了。這些分析目前一般采用R語言實(shí)現(xiàn)。

雖然現(xiàn)在不少生物學(xué)研究人員也逐漸開始學(xué)習(xí)使用R語言編寫簡單的程序進(jìn)行數(shù)據(jù)分析，但在利用R語言進(jìn)行數(shù)據(jù)分析的時(shí)候，也因?yàn)閿?shù)據(jù)格式等問題需要花費(fèi)不少時(shí)間進(jìn)行前期數(shù)據(jù)處理等。

因此，為了加速生物學(xué)科研人員進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和可視化，我們推出了BioLadder云平臺，使得不會(huì)編程或不想編程的研究人員能利用生物學(xué)的常用數(shù)據(jù)格式，必要時(shí)進(jìn)行簡單的編輯，就能直接進(jìn)行相關(guān)的數(shù)據(jù)分析。

BioLadder涵蓋30+模塊

BioLadder目前上線了生物學(xué)分析最常用的30多個(gè)模塊，主要包括以下四類：

• 數(shù)據(jù)可視化：箱線圖，南丁格爾玫瑰圖，韋恩圖，UpSet圖，餅圖，詞云圖，核密度圖，小提琴圖，弦圖等

• 組學(xué)數(shù)據(jù)分析：序列的多重比對，表達(dá)數(shù)據(jù)的CV曲線圖，PCA，T-SNE，熱圖，相關(guān)性熱圖等，趨勢分析的mFuzz，差異分析的火山圖，富集分析的氣泡圖，修飾位點(diǎn)上下游模體分析的seqLogo，Motif熱圖等

• 功能分析：GOPlot，相互作用網(wǎng)絡(luò)圖

• 數(shù)據(jù)預(yù)處理：長寬表互換等

BioLadder的使用方法

好了，介紹了那么多，那BioLadder到底該怎么用呢?從BioLadder主頁進(jìn)去后，點(diǎn)擊“一鍵作圖”即可跳轉(zhuǎn)到各個(gè)分析模塊的頁面，點(diǎn)擊想進(jìn)行的分析模塊，每個(gè)模塊的基本操作都只需要輕松三步就能搞定整個(gè)分析過程：1，上傳數(shù)據(jù)2，調(diào)整參數(shù)3，提交查看詳細(xì)的說明，可以移步到BioLadder的使用教程界面（https://www.bioladder.cn/web/#/pro/help），那里你可以找到更加詳細(xì)的幫助文檔。

BioLadder特色展示

BioLadder除了功能上提供了目前生物數(shù)據(jù)分析常用的模塊外，各個(gè)模塊在設(shè)計(jì)的時(shí)候也兼顧以下特色：

01輕松設(shè)置個(gè)性化顏色

1.配色方案

部分模塊，我們預(yù)設(shè)了像Lancet，JAMA，Nature等期刊常用的顏色方案供您選擇。幫助您畫出絢麗多彩的圖形。

2.調(diào)色板調(diào)色：

??可彈出調(diào)色板，自由方便進(jìn)行顏色調(diào)整。顏色高度自定義。

02人性化幫助

在常用參數(shù)旁邊增加問號懸浮窗。在不理解參數(shù)含義和操作方法時(shí)，直接把鼠標(biāo)懸浮到問號上就可以彈出幫助，不需要再翻閱冗長的說明書了。此外還在上傳控件旁邊提供了“下載示例”，當(dāng)您不清楚上傳文件的格式時(shí)，可以一鍵下載demo數(shù)據(jù)查看。

03支持常用的生物學(xué)數(shù)據(jù)直接繪圖

R語言有些模塊需要特定的輸入格式，我們提供的“長寬表互換”即是為了滿足R語言的需求進(jìn)行的一些轉(zhuǎn)換。為了生物學(xué)研究人員的方便，我們在多個(gè)模塊內(nèi)部設(shè)置了自動(dòng)的格式轉(zhuǎn)換，以方便研究人員直接上傳手上的數(shù)據(jù)即可進(jìn)行分析。

我們以韋恩圖為例，常規(guī)的畫韋恩圖，需要輸入每組的蛋白名稱才能繪圖。如果我們想對一個(gè)定量表進(jìn)行分析，將定量值為0的認(rèn)為沒有鑒定到，我們需要逐列篩選，貼到網(wǎng)站上畫圖，費(fèi)時(shí)費(fèi)力。為此我們的韋恩圖模塊除了常規(guī)的數(shù)據(jù)輸入外，還支持直接上傳生物學(xué)數(shù)據(jù)最常見的定量矩陣表的格式，減去了格式轉(zhuǎn)換的繁瑣。上傳定量表后，程序會(huì)自動(dòng)的將其轉(zhuǎn)換為韋恩圖的格式，且轉(zhuǎn)換完的數(shù)據(jù)支持下載。

04下載參數(shù)可調(diào)，隨意獲取需要的大小、分辨率和格式

分析模塊中的主要參數(shù)便捷可調(diào)，點(diǎn)擊提交后即可得到繪圖結(jié)果。繪圖結(jié)果可以用右鍵另存，也可以在“圖片存盤參數(shù)”中設(shè)置不同的格式和參數(shù)下載需要的圖片。

我們的初衷是搭建一個(gè)專業(yè)的生物信息在線分析和可視化平臺，為廣大的科研工作者提供方便、快捷的數(shù)據(jù)處理、功能分析和可視化作圖服務(wù)。目前上線的模塊能完成生物學(xué)研究中最常見的分析，對各模塊的精心設(shè)計(jì)使得研究人員能最方便使用各模塊快速完成數(shù)據(jù)分析和繪圖。BioLadder是由北京青蓮百奧生物科技有限公司和國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心·北京聯(lián)合出品。已于8月2日公測上線，免費(fèi)注冊，注冊后免費(fèi)使用所有功能。我們歡迎您以任何方式提出您的優(yōu)化意見，使BioLadder平臺成為廣大科研工作者的生物信息分析平臺！此外，如果您熱衷于生物信息分析或數(shù)據(jù)可視化，我們歡迎您成為BioLadder的開發(fā)者之一，您可以通過關(guān)注公眾號與平臺開發(fā)者溝通，共同開發(fā)出更多好用且好看的可視化工具！BioLadder與您共同成長，陪伴長久，不可或缺。