定量蛋白質(zhì)組學(xué)就是對(duì)系統(tǒng)中的不同蛋白質(zhì)進(jìn)行含量的精確鑒定，目前主要是根據(jù)基于質(zhì)譜的技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行含量鑒定。常用的蛋白質(zhì)定量技術(shù)如非標(biāo)記定量策略（Label Free）和標(biāo)記定量策略（iTRAQ、TMT、SILAC等），其基本原理都是將帶標(biāo)記的或未標(biāo)記的蛋白質(zhì)酶切消化成小分子肽段，再對(duì)小分子肽段進(jìn)行HPLC-MS/MS分析，通過對(duì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息學(xué)分析從而實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的定量鑒定。?

由此可見，基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)定量分析主要是基于質(zhì)譜圖所反映的肽段離子的理化性質(zhì)來實(shí)現(xiàn)的。4D定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)即利用4D質(zhì)譜分析技術(shù)對(duì)蛋白進(jìn)行定量分析，相比傳統(tǒng)的3D定量蛋白質(zhì)技術(shù)，4D質(zhì)譜分析方法通過新增的離子淌度（mobility）這一維度可根據(jù)肽段離子的形狀和碰撞面積（CCS）對(duì)其進(jìn)行分析，能夠檢測質(zhì)荷比（m/z）差值非常接近的肽段，對(duì)低豐度的肽段離子也能發(fā)揮很好的檢測作用，在檢測靈敏度以及準(zhǔn)確度方面都有很大的提升。?

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