「青蓮聚焦」DIA/PRM產(chǎn)品相關(guān)問(wèn)題蛋白產(chǎn)品相關(guān)問(wèn)題(六)
蛋白質(zhì)組學(xué)(英語(yǔ):proteomics,又譯作蛋白質(zhì)體學(xué)),是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。這個(gè)概念最早是在1994年,由Marc Wikins首先提出的新名詞。
上次分享了蛋白產(chǎn)品相關(guān)問(wèn)題(五),本周二將分享蛋白產(chǎn)品相關(guān)問(wèn)題(六)~
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26.全息掃描DIA與label free的優(yōu)缺點(diǎn)分析?
答案:兩者都可用于差異較大的樣本(不同物種、不同組織部位),“有無(wú)”蛋白比較,不需要同位素標(biāo)記,成本相對(duì)低;樣本不受限制,應(yīng)用范圍廣;
LFQ確定是數(shù)據(jù)重復(fù)性稍差,缺失值較多;
全息掃描DIA?的重現(xiàn)性較高,所有離子信息都能采集,缺點(diǎn)是需要預(yù)先建立數(shù)據(jù)庫(kù),數(shù)據(jù)分析較LFQ復(fù)雜
27.?靶標(biāo)定量蛋白組學(xué)(PRM/MRM)技術(shù)原理是什么?
答案:PRM技術(shù)是在多反應(yīng)監(jiān)測(cè)(multiple reaction monitoring, MRM)技術(shù)的基礎(chǔ)上演化而來(lái)的。它基于高分辨、高精度質(zhì)譜(如Orbitrap系列),首先利用四級(jí)桿質(zhì)量分析器的選擇檢測(cè)能力,在一級(jí)質(zhì)譜中選擇性地檢測(cè)目標(biāo)肽段的母離子信息;隨后在collision cell中對(duì)母離子進(jìn)行碎裂;最后利用高分辨、高質(zhì)量精度分析器在二級(jí)質(zhì)譜中檢測(cè)所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片的信息。
28.什么時(shí)候會(huì)用到PRM這種技術(shù)?
答案:PRM可對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)、目標(biāo)肽段(如發(fā)生翻譯后修飾的肽段)進(jìn)行選擇性檢測(cè),從而實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段的靶向驗(yàn)證和相對(duì)或絕對(duì)定量。用于廣篩之后的驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)。
本周的FAQ就到此結(jié)束啦~
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