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原創(chuàng)?小果?生信果

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今天小果要帶大家再認(rèn)識(shí)一個(gè)好用的癌癥數(shù)據(jù)分析公共數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)：TCIA，那就和小果一起學(xué)起來(lái)吧！

什么是TCGA？

TCIA（The Cancer Imaging Archive）是一個(gè)公共數(shù)據(jù)庫(kù)，旨在為研究人員提供醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)以及相關(guān)的臨床數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)來(lái)源于國(guó)家癌癥研究所（NCI）的多個(gè)項(xiàng)目，包括美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院（NIH）的臨床中心和研究機(jī)構(gòu)。接下來(lái)小果將帶大家簡(jiǎn)單地學(xué)習(xí)TCIA數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站的具體使用方法：

訪問(wèn)TCIA官網(wǎng)

訪問(wèn)TCIA官方網(wǎng)站（https://tcia.at/home）后，我們可以注冊(cè)賬戶(hù)并登錄，成為正式用戶(hù)后我們可以使用個(gè)人賬戶(hù)搜索、下載和分享數(shù)據(jù)哦。

訪問(wèn)

在網(wǎng)站的主頁(yè)上，可以選擇不同的數(shù)據(jù)集進(jìn)行瀏覽和搜索。數(shù)據(jù)集包括各種類(lèi)型的醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)，如CT、MRI、PET等。我們也可以在網(wǎng)站上瀏覽TCIA的各種癌癥數(shù)據(jù)集，如Lung（肺癌），Breast（乳腺癌）等。

紅框中構(gòu)勾選的就是網(wǎng)站提供的癌癥分析數(shù)據(jù)，同學(xué)們可以選擇自己感興趣的癌癥分析數(shù)據(jù)自行查看哦！。

查看數(shù)據(jù)詳細(xì)信息

在數(shù)據(jù)集頁(yè)面上，我們可以查看該數(shù)據(jù)集的詳細(xì)信息，并下載相應(yīng)的數(shù)據(jù)。部分?jǐn)?shù)據(jù)集還提供了附加的臨床數(shù)據(jù)，例如患者的基本信息、治療記錄等。

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1.查看乳腺癌患者數(shù)據(jù)：

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? 2.查看單個(gè)患者的詳細(xì)數(shù)據(jù)：

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數(shù)據(jù)可視化分析

同時(shí)，我們還可以使用TCIA提供的工具進(jìn)行數(shù)據(jù)的可視化和分析哦。網(wǎng)站提供了多種分析工具，如DICOM影像查看器、圖像分割工具等。這些工具可以幫助用戶(hù)對(duì)醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)進(jìn)行可視化和處理，以便更好地理解和分析數(shù)據(jù)哦！

總之，TCIA是一個(gè)非常有用的醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)庫(kù)，可以為研究人員提供豐富的數(shù)據(jù)資源，并幫助他們進(jìn)行醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)的可視化、處理和分析。

???接下來(lái)小果帶大家看一個(gè)數(shù)據(jù)可視化的實(shí)例吧?。?/p>

1.選擇基因表達(dá)模塊：

2.選擇所有免疫細(xì)胞：

3.查看基因表達(dá)箱線圖：

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4.查看基因表達(dá)熱圖：

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總之，TCIA是一個(gè)非常有用的醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)庫(kù)，可以為研究人員提供豐富的數(shù)據(jù)資源，并幫助他們進(jìn)行醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)的可視化、處理和分析。怎么樣，這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)你學(xué)會(huì)了嗎？

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