易基因-單細(xì)胞甲基化&單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序
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易基因單細(xì)胞甲基化測序&單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序
高通量單細(xì)胞DNA甲基化測序簡介
單細(xì)胞DNA甲基化組學(xué)研究很大程度上受制于建庫技術(shù)，傳統(tǒng)的文庫構(gòu)建方法或類似于基因組DNA的單細(xì)胞擴(kuò)增技術(shù)很難應(yīng)用到甲基化實驗過程中。目前單細(xì)胞甲基化研究主要受限于檢測成本、不同細(xì)胞位點檢測共有性差異等。
高通量單細(xì)胞甲基化scRBS技術(shù)指標(biāo)：
起始量：單細(xì)胞；
高通量：上百成千個單細(xì)胞快速高通量甲基化檢測；
數(shù)據(jù)量：單細(xì)胞1G測序數(shù)據(jù)；
覆蓋度：每個單細(xì)胞覆蓋4-10M的CG位點；
重復(fù)性：不同單細(xì)胞CG位點覆蓋重復(fù)性可到達(dá)50%以上；
分辨率高：單堿基分辨率；
性價比高：單個細(xì)胞檢測費用低至千余元。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序（smart-seq2）簡介
Smart-seq2技術(shù)在單細(xì)胞水平對帶Poly（A）的RNA進(jìn)行全長轉(zhuǎn)錄組擴(kuò)增及高通量測序，能夠滿足高靈敏度、低偏好性的cDNA擴(kuò)增，得到全長轉(zhuǎn)錄本，實現(xiàn)高水平的序列模板轉(zhuǎn)換。
Smart-seq2技術(shù)有較好的覆蓋范圍，可檢測到稀有轉(zhuǎn)錄本，無需額外的專業(yè)設(shè)備，應(yīng)用范圍較廣，可以解決傳統(tǒng) RNA 定量技術(shù)在早期胚胎發(fā)育、干細(xì)胞、癌癥、免疫等研究領(lǐng)域中存在的樣品量極低或細(xì)胞異質(zhì)性的問題，是在單細(xì)胞水平研究基因表達(dá)強(qiáng)有力的工具，極大地拓展了RNA-seq 的應(yīng)用范圍。
技術(shù)優(yōu)勢：
起始量低：1-1000個細(xì)胞或10pg-10ng total RNA即可高效擴(kuò)增；
轉(zhuǎn)錄本覆蓋度高：通過雙端引物擴(kuò)增全長cDNA，獲得全轉(zhuǎn)錄組信息，避免3’端和5’端偏好性，產(chǎn)物完整性好；
檢測靈敏度高：大幅度增加了低表達(dá)基因的檢出量;
堿基分辨率高：可達(dá)單堿基分辨率，且可以定位到具體基因的具體轉(zhuǎn)錄本;
實驗可控：質(zhì)控點多，可從實驗的開端判斷細(xì)胞狀況。
