什么是DNA的限制性片段長度多態(tài)性?RFLP——一種典型的遺傳標記

DNA多態(tài)性主要表現(xiàn)在三個方面,它們分別是:反映限制性酶切位點變化的限制性片段長度多態(tài)性、反映重復單位拷貝數(shù)差異的串聯(lián)重復序列多態(tài)性,以及反映點突變的單核苷酸多態(tài)性。此外還有一些衍生的多態(tài)性和多態(tài)性分析,例如單鏈構象多態(tài)性(SSCP)、擴增片段長度多態(tài)性(AFLP)、隨機擴增多態(tài)性DNA(RAPD)等。

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今天咱們就先來說說限制性片段長度多態(tài)性。
1970年,Smith、Wilcox和Kelley從流感嗜血桿菌(H.influenzae)中分離到一種核酸內切酶HindⅡ,它識別并切割GTY·RAC序列(Y表示嘧啶,R表示嘌呤)。這類能通過識別特定DNA序列切割DNA的酶被統(tǒng)稱為限制性內切酶,限制性內切酶識別的序列被稱為限制性酶切位點。
DNA序列中存在著一些限制性酶切位點,用識別這些位點的限制性內切酶來消化DNA,就可以得到一組DNA片段,被稱為限制性片段(restriction fragment)。

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而對于一個個體而言,其DNA序列中限制性酶切位點的數(shù)目和分布是確定的,因而其限制性片段的種類和長度也是確定的,可以反映DNA分子的序列特征。
另一方面,同一物種不同個體基因組存在DNA多態(tài)性,且約10%多態(tài)性位點導致限制性酶切位點的形成或消失,因而所含限制性酶切位點的數(shù)目和分布不同,其限制性片段的種類和長度也就不同。

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因此,限制性片段具有多態(tài)性,這種多態(tài)性稱為限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)。RFLP存在廣泛,是一種典型的遺傳標記。
1980年,Bostein建立了RFLP分析技術,即通過限制性內切酶消化聯(lián)合DNA印跡法進行分析。該技術操作簡單、成本低廉,從而使RFLP被選為人類基因組計劃的第一代遺傳標記,用于基因圖譜繪制、DNA指紋分析、疾病易感性分析、基因診斷、親權鑒定等。

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