青蓮百奧聯(lián)合國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心·北京生物信息平臺(tái)

打造BioLadder生信云平臺(tái)

今日正式上線(xiàn)

輕松驅(qū)散你的煩惱

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即刻享有30+模塊免費(fèi)使用權(quán)限

點(diǎn)擊進(jìn)入

https://www.bioladder.cn/

BioLadder涵蓋30+模塊

BioLadder目前上線(xiàn)了生物學(xué)分析最常用的30多個(gè)模塊，主要包括以下四類(lèi)：

• 數(shù)據(jù)可視化：箱線(xiàn)圖，南丁格爾玫瑰圖，韋恩圖，UpSet圖，餅圖，詞云圖，核密度圖，小提琴圖，弦圖等

• 組學(xué)數(shù)據(jù)分析：序列的多重比對(duì)，表達(dá)數(shù)據(jù)的CV曲線(xiàn)圖，PCA，T-SNE，熱圖，相關(guān)性熱圖等，趨勢(shì)分析的mFuzz，差異分析的火山圖，富集分析的氣泡圖，修飾位點(diǎn)上下游模體分析的seqLogo，Motif熱圖等

• 功能分析：GOPlot，相互作用網(wǎng)絡(luò)圖

• 數(shù)據(jù)預(yù)處理：長(zhǎng)寬表互換等

BioLadder特色展示

BioLadder除了功能上提供了目前生物數(shù)據(jù)分析常用的模塊外，各個(gè)模塊在設(shè)計(jì)的時(shí)候也兼顧以下特色：

01輕松設(shè)置個(gè)性化顏色

1.配色方案

部分模塊，我們預(yù)設(shè)了像Lancet，JAMA，Nature等期刊常用的顏色方案供您選擇。幫助您畫(huà)出絢麗多彩的圖形。

2.調(diào)色板調(diào)色：

??可彈出調(diào)色板，自由方便進(jìn)行顏色調(diào)整。顏色高度自定義。

02人性化幫助

在常用參數(shù)旁邊增加問(wèn)號(hào)懸浮窗。在不理解參數(shù)含義和操作方法時(shí)，直接把鼠標(biāo)懸浮到問(wèn)號(hào)上就可以彈出幫助，不需要再翻閱冗長(zhǎng)的說(shuō)明書(shū)了。此外還在上傳控件旁邊提供了“下載示例”，當(dāng)您不清楚上傳文件的格式時(shí)，可以一鍵下載demo數(shù)據(jù)查看。

03支持常用的生物學(xué)數(shù)據(jù)直接繪圖

R語(yǔ)言有些模塊需要特定的輸入格式，我們提供的“長(zhǎng)寬表互換”即是為了滿(mǎn)足R語(yǔ)言的需求進(jìn)行的一些轉(zhuǎn)換。為了生物學(xué)研究人員的方便，我們?cè)诙鄠€(gè)模塊內(nèi)部設(shè)置了自動(dòng)的格式轉(zhuǎn)換，以方便研究人員直接上傳手上的數(shù)據(jù)即可進(jìn)行分析。

我們以韋恩圖為例，常規(guī)的畫(huà)韋恩圖，需要輸入每組的蛋白名稱(chēng)才能繪圖。如果我們想對(duì)一個(gè)定量表進(jìn)行分析，將定量值為0的認(rèn)為沒(méi)有鑒定到，我們需要逐列篩選，貼到網(wǎng)站上畫(huà)圖，費(fèi)時(shí)費(fèi)力。為此我們的韋恩圖模塊除了常規(guī)的數(shù)據(jù)輸入外，還支持直接上傳生物學(xué)數(shù)據(jù)最常見(jiàn)的定量矩陣表的格式，減去了格式轉(zhuǎn)換的繁瑣。上傳定量表后，程序會(huì)自動(dòng)的將其轉(zhuǎn)換為韋恩圖的格式，且轉(zhuǎn)換完的數(shù)據(jù)支持下載。

04下載參數(shù)可調(diào)，隨意獲取需要的大小、分辨率和格式

分析模塊中的主要參數(shù)便捷可調(diào)，點(diǎn)擊提交后即可得到繪圖結(jié)果。繪圖結(jié)果可以用右鍵另存，也可以在“圖片存盤(pán)參數(shù)”中設(shè)置不同的格式和參數(shù)下載需要的圖片。

我們的初衷是搭建一個(gè)專(zhuān)業(yè)的生物信息在線(xiàn)分析和可視化平臺(tái)，為廣大的科研工作者提供方便、快捷的數(shù)據(jù)處理、功能分析和可視化作圖服務(wù)。目前上線(xiàn)的模塊能完成生物學(xué)研究中最常見(jiàn)的分析，對(duì)各模塊的精心設(shè)計(jì)使得研究人員能最方便使用各模塊快速完成數(shù)據(jù)分析和繪圖。BioLadder是由北京青蓮百奧生物科技有限公司和國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心·北京生物信息平臺(tái)聯(lián)合出品。并于今日公測(cè)上線(xiàn)，免費(fèi)注冊(cè)，注冊(cè)后免費(fèi)使用所有功能。我們歡迎您以任何方式提出您的優(yōu)化意見(jiàn)，使BioLadder平臺(tái)成為廣大科研工作者的生物信息分析平臺(tái)！此外，如果您熱衷于生物信息分析或數(shù)據(jù)可視化，我們歡迎您成為BioLadder的開(kāi)發(fā)者之一，您可以通過(guò)關(guān)注公眾號(hào)與平臺(tái)開(kāi)發(fā)者溝通，共同開(kāi)發(fā)出更多好用且好看的可視化工具！BioLadder與您共同成長(zhǎng)，陪伴長(zhǎng)久，不可或缺。