看蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)如何助力草莓、甜瓜、桃子、榴蓮、荔枝發(fā)刊
要說科研界中的夏日水果圖鑒是什么?那不得不說運(yùn)用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、非靶向代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)等組學(xué)技術(shù)對(duì)于水果高產(chǎn)、高品及脅迫的研究啦~
本篇小鹿給大家整理了【五篇夏日科研水果圖鑒】助力您的科學(xué)研究,一起跟著我的腳步來看看吧~
您是否對(duì)以下研究方向感興趣?
突變體中類黃酮生物合成的潛在調(diào)控機(jī)制;
水果中病原菌感染的誘導(dǎo)抗性機(jī)制;
水果中的某類活性差異性相關(guān)代謝物;
果肉成熟過程中風(fēng)味相關(guān)初級(jí)代謝的動(dòng)態(tài)變化;
水果因外界誘導(dǎo)因素引起的生物學(xué)機(jī)制變化。
水果中病原菌感染的誘導(dǎo)抗性機(jī)制?
中文標(biāo)題:硅酸鈉通過調(diào)節(jié)線粒體能量代謝和活性氧的產(chǎn)生來啟動(dòng)收獲后甜瓜的防御機(jī)制
研究對(duì)象:甜瓜線粒體
發(fā)表期刊:Food chemistry
影響因子:9.231
合作單位:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)
運(yùn)用歐易/鹿明生物技術(shù):TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)
研究結(jié)果:
歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)畢陽教授課題組在Food chemistry期刊發(fā)表的研究成果。本研究通過TMT標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法表明,Si處理后的甜瓜果實(shí)線粒體通過調(diào)節(jié)被病原菌感染的甜瓜的能量代謝和ROS的產(chǎn)生,啟動(dòng)寄主對(duì)Trichothecium roseum侵染的抗性,從而降低了甜瓜的腐爛。
發(fā)現(xiàn)Si處理的甜瓜果實(shí)線粒體通過調(diào)節(jié)能量代謝和ROS生成,在抗病啟動(dòng)過程中發(fā)揮重要作用。為進(jìn)一步揭示水果對(duì)病原菌感染的誘導(dǎo)抗性機(jī)制提供了新的視角和信息。
突變體中類黃酮生物合成的潛在調(diào)控機(jī)制
文章標(biāo)題:基于轉(zhuǎn)錄組/代謝組聯(lián)合分析揭開高類黃酮含量草莓突變體中類黃酮生物合成的潛在調(diào)控機(jī)制
材料:草莓 ?
發(fā)表期刊:Frontiers in Plant Science? ?
發(fā)表時(shí)間:2022.6.28 ? ?
影響因子:6.627
作者單位:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院
主要運(yùn)用技術(shù):代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)
研究結(jié)果:
在本研究中,為進(jìn)一步解開該突變體出現(xiàn)這種代謝差異的原因,研究人員對(duì)'Benihoppe'的MT和WT草莓進(jìn)行了聯(lián)合非靶向代謝組和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析。代謝分析共檢測(cè)出113種黃酮類化合物,并且首次在草莓中檢測(cè)到一種特定的花青素,即矮牽?;?3-O-蕓香糖苷。
進(jìn)一步聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組分析,該研究發(fā)現(xiàn)花青素和原花青素的上調(diào)是由于F3 ' 5 ' H的下調(diào)以及F3'H和LAR表達(dá)的上調(diào)共同引起的,并且該過程可能受到C3H、MADS 和 AP2/ERF 等轉(zhuǎn)錄因子上調(diào)的潛在影響。該研究還通過代謝物相關(guān)性分析表明,與總酚含量密切相關(guān)的是原花青素而非花青素,這凸顯了原花青素對(duì)這些草莓酚類物質(zhì)含量的貢獻(xiàn)。
果肉成熟過程中風(fēng)味相關(guān)初級(jí)代謝的動(dòng)態(tài)變化
文章標(biāo)題:代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析評(píng)估了榴蓮果肉成熟過程中風(fēng)味相關(guān)初級(jí)代謝的動(dòng)態(tài)變化
發(fā)表期刊:Frontiers in Plant Science
發(fā)表時(shí)間:2021.6
影響因子:6.627
作者單位:泰國(guó)朱拉隆功大學(xué)
主要運(yùn)用技術(shù):代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)
研究結(jié)果:
本研究利用毛細(xì)管電泳-氣相色譜-飛行時(shí)間質(zhì)譜法(代謝組學(xué))檢測(cè)到94種與榴蓮栽培品種(Monthong)果肉成熟相關(guān)代謝物(尤其是與風(fēng)味相關(guān)的代謝物)。
結(jié)果表明,在Monthong成熟過程中,蔗糖含量增加;棉子糖家族低聚糖含量的變化也被首次觀察到。同時(shí),蘋果酸和琥珀酸含量增加,而檸檬酸含量不變。值得注意的是,包括異亮氨酸、亮氨酸和纈氨酸在內(nèi)的大多數(shù)氨基酸含量增加,而天冬氨酸含量降低,谷氨酸含量不變。此外,研究者結(jié)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,闡明糖代謝、糖酵解、TCA循環(huán)和氨基酸途徑的動(dòng)態(tài)變化,并確定了關(guān)鍵候選基因。綜上,本研究闡明了榴蓮成熟過程中風(fēng)味相關(guān)的代謝基礎(chǔ),為未來開發(fā)榴蓮代謝物和遺傳標(biāo)記提供依據(jù)。
?
水果中的某類活性差異性相關(guān)代謝物
文章標(biāo)題:非靶向代謝組學(xué)分析鑒定桃肉中а-葡糖苷酶抑制活性差異性相關(guān)代謝物
材料:桃子果肉
發(fā)表期刊:Molecules
影響因子:4.927
作者單位:上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院林木果樹研究所
主要運(yùn)用歐易/鹿明生物技術(shù):非靶向代謝組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)
上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院林木果樹研究所葉正文研究員團(tuán)隊(duì)在Molecules雜志上發(fā)表的用UPLC-Q-TOF/MS(非靶向代謝組學(xué))方法比較中國(guó)不同桃子品種的果肉中а-葡糖苷酶抑制活性差異性論文,特別致謝了上海鹿明生物科技有限公司在代謝組學(xué)分析中的工作。
結(jié)果顯示:綠原酸、新綠原酸、兒茶素、低聚原花青素和根皮苷等標(biāo)志性化合物對(duì)α-葡萄糖苷酶抑制活性起作用,不同α-葡萄糖苷酶抑制活性的高低組間的代謝物存在顯著差異。所篩選到的9種標(biāo)志性化合物可以作為桃肉α-葡萄糖苷酶抑制活性的指標(biāo),為評(píng)價(jià)桃果實(shí)的營(yíng)養(yǎng)提供參考,以用于育種及商業(yè)鑒定。
水果因外界誘導(dǎo)因素引起的生物學(xué)機(jī)制變化
文章標(biāo)題:花誘導(dǎo)期間荔枝葉的代謝組學(xué)分析揭示莖環(huán)剝的代謝改善
發(fā)表期刊:Molecules
發(fā)表時(shí)間:2021.07
影響因子:4.927
作者單位:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院
主要運(yùn)用技術(shù):代謝組學(xué)
研究結(jié)論:
研究了荔枝莖環(huán)剝和低溫處理后葉片的代謝變化。結(jié)果表明,環(huán)剝處理改善了荔枝在淺綠期的開花情況,使荔枝的頂端新梢開花。此外,莖環(huán)剝樹葉片中蔗糖和D-麥芽糖等含量高,而UDP-葡萄糖、D-葡萄糖- 6p、D-半乳糖和D-果糖含量低,可能與荔枝開花有關(guān)。半乳糖醇、苯基丙酮酸、乙酰輔酶A、亞油酸、α -亞麻酸、13-HPOT、9-oxoODE和9,12,13-triHOME的穩(wěn)定水平表明,環(huán)剝可以克服激活這些化合物代謝途徑的低溫效應(yīng),可能對(duì)荔枝開花產(chǎn)生負(fù)面影響。
由此可見,淀粉和蔗糖代謝、半乳糖代謝、磷酸烯醇丙酮酸代謝和亞油酸代謝可能在荔枝成花誘導(dǎo)中起重要作用。本研究有助于了解花誘導(dǎo)過程中莖環(huán)剝和低溫處理的生物學(xué)機(jī)制。
夏日,是一場(chǎng)顏色與香氣的果味交響樂。享受微風(fēng)拂面般的清爽,在柔軟的涼意中舒展,品味甜蜜的瓜果,這才是夏天該有的姿態(tài)。清甜、輕盈、純粹,果香溢滿舌尖,這便是瓜果里流動(dòng)的香氣,恍如一團(tuán)團(tuán)散落人間的紅霞,逐漸渲染出一個(gè)粉色的國(guó)度。感謝各位科研人對(duì)水果研究的貢獻(xiàn),給我們帶來了夏天的甜蜜暴擊!
好啦~本期分享就到這里,咨詢組學(xué)研究服務(wù)請(qǐng)掃描下方二維碼,獲取更多組學(xué)資料~
歡迎百度搜索鹿明生物——訪問鹿明生物官網(wǎng)——了解TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、非靶向代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)等組學(xué)技術(shù)
猜你還想看
1、項(xiàng)目文章 | 恭喜西北研究院劉光琇團(tuán)隊(duì)探索新型tRNA增產(chǎn)抗生素發(fā)表生物一區(qū)頂刊
2、Cancer Cell | 腫瘤學(xué)一區(qū)頂刊:空間多組學(xué)技術(shù)破譯膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中的腫瘤-宿主相互依賴性
3、Nature子刊 | 多組學(xué)聯(lián)合分析鼠李糖乳桿菌與白色念珠菌之間的代謝爭(zhēng)奪戰(zhàn)
4、Environ Int | 浙江大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院周舟課題組在環(huán)境科學(xué)頂刊首次發(fā)文揭示鎘暴露與糖尿病的關(guān)聯(lián)
本文系鹿明生物原創(chuàng)
轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明本文轉(zhuǎn)自鹿明生物