教程 | 做一個(gè)自己專屬的本地 BLAST 數(shù)據(jù)庫
寫在前面
中秋和國(guó)慶期間，我總是要往返廣州貴陽。工作在廣州，家人在貴陽，于是多出了不少旅途時(shí)光。手機(jī)信號(hào)自然是沒有，也常常是夜晚的航班。播客聽多了，發(fā)現(xiàn)只能等著節(jié)目更新。來來去去，最后還是要閉眼思考。
活著，為了什么？
這個(gè)課題怎么做？那個(gè)課題怎么做？
有沒有什么新課題想法？
是不是把一些想法給忘掉了
當(dāng)然，常常有成果的，自然還是“TBtools的優(yōu)化”。可能，這是比較簡(jiǎn)單的事情。
開發(fā)至今 6 年有余，最早期的功能包括 Fasta 序列提取 和 Blast 界面化。事實(shí)上，這些功能從當(dāng)初開發(fā)到現(xiàn)在，幾乎沒有更新過。或許只能說，我寫得挺好，功能挺穩(wěn)健。不過，必須承認(rèn)，有時(shí)候用起來還是不太方便，尤其是切換不同數(shù)據(jù)庫比對(duì)，類似的工作不時(shí)重復(fù)。已有的界面如下：
其他 Blast 界面化功能是類似的。我們完全可以想象得到，不夠方便，尤其是當(dāng)我們?cè)诒镜刈鲎銐蚨嗟姆治鰰r(shí)。
于是，我們需要“革自己的命”，實(shí)現(xiàn)一些新的功能，從更高維度降低數(shù)據(jù)分析的繁雜程度。
Blast Zone 簡(jiǎn)介
經(jīng)過簡(jiǎn)單的思索，在帶娃的閑暇之余，我寫了一個(gè)自認(rèn)為還不錯(cuò)的新插件，命名為“Blast Zone”。查看這個(gè)功能，首先是更新 TBtools 到版本 v1.09866 或者更高版本（為了匹配這個(gè)功能更新，我跳過了 6 個(gè)版本號(hào)）。隨后可以在熟悉的地方找到這個(gè)功能。
點(diǎn)擊即可查看
一般來說，尤其是對(duì)于 Windows 用戶（當(dāng)然 Mac 也相同），建議首先點(diǎn)擊Config摁鈕，調(diào)整默認(rèn)數(shù)據(jù)庫放置的位置，以方便后續(xù)分析。
BLAST 數(shù)據(jù)庫的添加與刪除
添加數(shù)據(jù)庫
開始建立一些數(shù)據(jù)庫
數(shù)據(jù)庫建立完成可見
類似的可以增加系列數(shù)據(jù)庫
刪除數(shù)據(jù)庫
相比于添加數(shù)據(jù)庫，刪除數(shù)據(jù)庫更為簡(jiǎn)單。只要選擇指定數(shù)據(jù)庫，點(diǎn)擊 “-” 按鈕即可。
可以看到
進(jìn)行 BLAST 序列比對(duì)
“Blast Zone” 上開展 BLAST 分析，相比于 TBtools 中已有功能會(huì)更為方便。
查看結(jié)果
當(dāng)然，也可以直接“Text View”。
切換一個(gè)數(shù)據(jù)庫比對(duì)，只需要鼠標(biāo)點(diǎn)擊選擇另外一個(gè)數(shù)據(jù)庫即可
其他特性
當(dāng)然，最重要的是，Blast Zone 的數(shù)據(jù)庫可以隨時(shí)“重用”。關(guān)閉 TBtools，重新開啟，那么數(shù)據(jù)庫列表跟前一次關(guān)閉時(shí)，保持一致。
更有趣的地方，以后再說.....
寫在最后
路漫漫，其修遠(yuǎn)兮~
一步一個(gè)腳印，做好自己即是一切。
