區(qū)別1、出身不同

　　PubMed由美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館轄下的國(guó)家生物技術(shù)中心(NCBI)進(jìn)行研制開(kāi)發(fā)。是美國(guó)國(guó)家政府行為，公開(kāi)、免費(fèi)、覆蓋范圍廣、數(shù)據(jù)量龐大，是生物醫(yī)藥人士最常用的數(shù)據(jù)庫(kù)之一。是最大的生物醫(yī)藥檢索平臺(tái)。

　　WOS是1963年美國(guó)科技信息研究所(Institute of Science Information，ISI)出版了科學(xué)引文索引(Science Citation Index，SCI)，收錄論文及其所引用的參考文獻(xiàn)，如今是權(quán)威的科技文獻(xiàn)檢索和分析評(píng)估工具。該數(shù)據(jù)庫(kù)集成了SCI，SSCI和A&HCI，在線提供全球近9,000種高質(zhì)量學(xué)術(shù)期刊的引文索引信息。

　　區(qū)別2、數(shù)據(jù)庫(kù)類型不同

　　PubMed是典型的文摘型數(shù)據(jù)庫(kù)，簡(jiǎn)言之就是收錄的文獻(xiàn)摘要。而WOS則是典型的引文型數(shù)據(jù)庫(kù)，除了有文獻(xiàn)摘要，還含有引文信息。相對(duì)來(lái)說(shuō)，WOS數(shù)據(jù)庫(kù)所包含的信息更多。

　　區(qū)別3、收錄范圍不同

　　PubMed：臨床、口腔、護(hù)理、生物醫(yī)學(xué)、醫(yī)藥、醫(yī)學(xué)史、醫(yī)學(xué)倫理、空間、生命科學(xué)。

　　WOS：科學(xué)、技術(shù)、社科、藝術(shù)、人文科學(xué)。

　　區(qū)別4、收錄數(shù)據(jù)庫(kù)不同

　　PubMed收錄范圍包括：MEDLINE、處理中引文、出版商提交引文、優(yōu)先發(fā)表引文、部分雜志的生命科學(xué)方面引文、NIH基金資助作者的文章引文、NCBI書籍引文等。

　　WOS：在Web of Science Core Collection(WoS核心收錄)中，收錄了期刊論文、專著和會(huì)議論文，具體分布在5個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中，分別為：Science Citation Index Expanded(簡(jiǎn)稱SCIE，科學(xué)引文索引擴(kuò)展版，即人們常說(shuō)的SCI);Social Sciences Citation Index(簡(jiǎn)稱SSCI，社會(huì)科學(xué)引文索引);Conference Proceedings Citation Index-Science(簡(jiǎn)稱CPCI-S，會(huì)議論文引文索引科學(xué)版，即過(guò)去的Index to Scientific and Technical Proceedings，簡(jiǎn)稱ISTP，科技會(huì)議錄引文索引);Current Chemical Reactions(CCR-E，最新化學(xué)反應(yīng));Index Chemicus(IC，化學(xué)索引)。

　　不過(guò)兩者所收錄數(shù)據(jù)庫(kù)范圍有重復(fù)有交叉。收錄數(shù)據(jù)庫(kù)范圍PubMed偏生物醫(yī)學(xué)，WOS的SCI是社會(huì)科學(xué)和自然科學(xué)都有。

　　區(qū)別5、檢索方式不同

　　PubMed除了常用的簡(jiǎn)單檢索外，還有豐富的字段檢索、高級(jí)檢索、各種檢索工具、自動(dòng)詞匯匹配技術(shù)、相似文獻(xiàn)等等。檢索功能極其強(qiáng)大。最主要的是有主題詞檢索(MESH)。

　　WOS是有基本的字段檢索、主題檢索、高級(jí)檢索。另外，其有PubMed不具備的引文檢索和學(xué)科分類檢索。