用手機定位軟件定位莫爾寺要把名稱寫為“莫爾佛塔”，高德地圖位置定在喀什市，百度地圖目前是定位在阿圖什市，可見莫爾寺地處喀什與阿圖什交界處，但到歷史上一直歸喀什轄管。

莫爾寺遺址距離喀什市中心大約30公里，地處伯什克然木鄉(xiāng)莫爾村，遺址距離莫爾村約4公里，南距離恰克瑪克河約3.5公里，與漢諾伊古城遺址遙遙相望。

2019年至2021年，中央民族大學(xué)和新疆維吾爾自治區(qū)文物考古研究所合作，對喀什市莫爾寺遺址進行主動發(fā)掘，取得了階段性成果。該成果認(rèn)為，莫爾寺遺址是一座地面佛寺遺址，修建在一條西北至東南走向的狹長洪積臺地上。臺地長約300米，最寬處約170米，臺地上留存有兩個塔，一個圓形一個方形。

圓形塔即俗稱的莫爾佛塔，位于遺址中心，是莫爾寺遺址的標(biāo)志性建筑。圓形塔靠近地面處塔基邊長約12米，高約12米，矗立在南側(cè)約8米高的陡崖邊緣。該塔是一座以土坯砌筑的覆缽塔，存有三層逐漸縮小的方形塔基，塔基上有圓盤，圓盤上有圓柱形塔身，最上部是覆缽形塔頂。

方形塔位于遺址西北端，距圓形塔約有60米，是一座四方形多層實心土坯塔。塔頂和四壁表面已全部毀壞，據(jù)考證，該塔至少是一座五層塔，自第一層往上逐層縮小。

寺院、僧房等基址，挖掘出土有龜茲小錢、剪輪五銖錢、開元通寶等錢幣，據(jù)此推斷遺址的年代可能早到東漢（25-220）末或魏晉（220-420）時期，晚到唐代（618-907）。莫爾佛塔的碳十四校正年代主要集中在3世紀(jì)后半期，可以與出土錢幣相互印證。

兩個佛塔的西側(cè)臺地下面有一眼坎兒井，井口呈不規(guī)則的長方形，冬天里面沒有看到有水。

坎兒井是一種主要由暗渠和豎井等構(gòu)成的自流灌溉系統(tǒng)，莫爾寺正北方向有一長串坎兒井。佛塔中間的單個坎兒井是否與北側(cè)的坎兒井系統(tǒng)相關(guān)，還有待進一步考證研究。據(jù)資料介紹，1984年坎兒井系統(tǒng)井的數(shù)量為126眼，1990年為在77眼，后來普查時已經(jīng)少到36眼，這個坎兒井系統(tǒng)據(jù)考證屬于漢至唐代，與莫爾寺遺址的斷定時間大體相符。