第一話 故鄉(xiāng)是克蘇魯之星

在漫長的戰(zhàn)斗之后，假蘇特克被消滅，宇宙人青子被吸入黑洞，但法子也身負(fù)重傷，即將面臨重生。從降落在未知地點的塔迪斯中，紅子看到了外面無數(shù)的克蘇魯怪物，外出進(jìn)行調(diào)查，遇到了自稱是當(dāng)?shù)鼐用竦募t發(fā)女子（？）。在兩人交談的過程中，法子在塔迪斯中遭到克蘇魯怪物圍困，打算返回塔迪斯對法子進(jìn)行救援的紅子被那名紅發(fā)女子（？）阻攔，原來對方竟然是失去了自己身體的伊庫薩2。伊庫薩2執(zhí)意要與紅子即伊庫薩1決斗，兩人因此又一次大打出手，途中伊庫薩2揭露了克蘇魯人母星毀滅的真相——時間領(lǐng)主們出于不明目的，出手炸毀了克蘇魯星球。最終伊庫薩1再度打敗伊庫薩2，但沒有再度奪去其性命。紅子帶著被伊庫薩2附身過的女孩（？）回到塔迪斯，遇到了已經(jīng)重生完成的法子。重生過后的法子精神極不穩(wěn)定，在與紅子單方面發(fā)生口角之后自顧自駕駛塔迪斯離開，紅子不得不自己帶著那個女孩（？）回到地球，對伊庫薩2所說的話依然有些疑問。

第二話 ALICE毀滅！惡魔之手伊庫薩3誕生

數(shù)月后，伊庫薩2在法子幫助下重新塑造了軀體，法子希望伊庫薩2幫她向伊庫薩1道歉，但被伊庫薩2回絕。伊庫薩2打算回到克蘇魯母船尋找伊庫薩1，卻發(fā)現(xiàn)母船跑到了地球附近，克蘇魯人正在入侵地球?？颂K魯人的領(lǐng)導(dǎo)者伊庫薩1是一名正義的戰(zhàn)士，按理來說不應(yīng)該做出這樣的事情，對此感到疑惑的伊庫薩2直接進(jìn)入母船，通過賽比雅找到了看起來很像紅子的領(lǐng)導(dǎo)者，對方自稱為Another Gold。伊庫薩2很快便確定這個Another Gold并非伊庫薩1，而AG也承認(rèn)她是伊庫薩1的敵人，打算拉攏伊庫薩2，但遭到拒絕，因為伊庫薩2認(rèn)為只有自己才能打敗伊庫薩1，并對AG趁伊庫薩1不在奪取克蘇魯艦隊控制權(quán)的行為表現(xiàn)出厭惡。并且，伊庫薩2清楚地感受到，自己對AG有種似乎是天生就有的仇恨。

與此同時，ALICE隊在與克蘇魯人的苦戰(zhàn)中遭到全滅，隊長有珠也在對陣AG仿制的Big Gold時陣亡。作為尤格·索托斯，音無彩名在天臺注視著一切，與間宮合唱團(tuán)一起奏響了人類的滅亡之歌。

隨著伊庫薩2與AG之間對立起來，雙方終于都失去了耐心，伊庫薩2對AG發(fā)動攻擊，但被長相神似伊庫薩1的小女孩攔下，她就是AG制造的最強(qiáng)大的伊庫薩戰(zhàn)士，伊庫薩3。伊庫薩2不敵伊庫薩3，被后者消滅了肉體，逃離了克蘇魯母船。她轉(zhuǎn)過頭，最后看了一眼滿目瘡痍的地球，隨即迅速離開，但不知道自己下一步的行動計劃?，F(xiàn)在的她什么都沒有，只有對伊庫薩1的執(zhí)念。在這執(zhí)念的驅(qū)使下，她下意識地開始朝伊庫薩1所在的地方飛去。

第三話 流浪的伊庫薩1

自從將紅發(fā)女孩（？）放回地球之后，伊庫薩1便帶著死去的青子的身體四處流浪，打算找到復(fù)活青子的方法。為此，她來到了平行世界的地球，恰巧目睹了遭到欺凌的高島柘榴與橘希實香，為兩個人出了頭。但是，伊庫薩1卻發(fā)現(xiàn)校內(nèi)有克蘇魯怪物的氣息，因此決定以紅子的身份暫時留在學(xué)校里進(jìn)行調(diào)查。很快，她便遇到了間宮卓司，敏銳地察覺出這個人是多重人格者。卓司目睹了最初的克蘇魯怪物小隊進(jìn)入學(xué)校并寄生學(xué)生的情景，精神受到刺激。他將這一切與自己兒時聽母親所說的事情聯(lián)系到一起，認(rèn)為克蘇魯怪物將會帶來終之空。等到紅子發(fā)現(xiàn)時，卓司已經(jīng)幫助克蘇魯怪物打開了傳送門，讓它們能夠大量進(jìn)入這個平行世界，占領(lǐng)了學(xué)校。紅子阻止了事態(tài)繼續(xù)擴(kuò)大，并準(zhǔn)確殺死了發(fā)瘋的卓司人格，留下了皆守與由岐。

同時，柘榴與希實香分別遭到被寄生的人類圍攻，柘榴因為《大鼻子情圣》的故事而決定戰(zhàn)斗，使用紅子送給她的手鐲進(jìn)行自救，并救下了希實香。怪物們組成巨大的怪獸，伊庫薩1召喚出伊庫薩機(jī)器人將對方消滅，暫時阻止了克蘇魯人的入侵。在她離開前，柘榴與希實香希望紅子能夠替她們看望一下兩人以前的同學(xué)，這個同學(xué)就是現(xiàn)在在群青就讀的佐倉霧。

第四話 溫柔而強(qiáng)大的伊庫薩2（前篇）

在前往群青途中，伊庫薩1遭到伏擊，伊庫薩機(jī)器人被奪走，伊庫薩1也身負(fù)重傷，墜落到了地面上。

在黑須太一消失后，桐原冬子整日愁容滿面，又一次開始了絕食行為。在奄奄一息時，伊庫薩2正好出現(xiàn)在她面前，不由分說地與其合為一體，救了冬子一命，也讓自己獲得了新身體。但與伊庫薩1附身青子的情況不同，冬子依然有著自己的意識，其棘手的性格讓她與伊庫薩2之間沖突不斷。

因為符合正常人標(biāo)準(zhǔn)，正要離開群青回歸社會的霧在路上遇到了昏迷不醒的紅子，又帶她回到了群青，聽聞此事的伊庫薩2判斷出對方是伊庫薩1，連忙跑去與其見面。蘇醒的紅子想起過去曾與宇宙人青子駕駛的伊庫薩西格瑪作戰(zhàn)的事情，又聯(lián)想到伊庫薩機(jī)器人被奪走的事，詢問伊庫薩2伊庫薩西格瑪?shù)南侣洌翈焖_2表示西格瑪在自己作為亡魂昏迷時被不明人物奪走，也就是在它遭人強(qiáng)搶時伊庫薩2才從昏迷中蘇醒過來。

從伊庫薩2口中，伊庫薩1也得知了克蘇魯人現(xiàn)在的情況，對此感到難以置信，尤其是對伊庫薩3的事情，因為最初制造伊庫薩3的就是伊庫薩1自己。伊庫薩3是作為克蘇魯人的新領(lǐng)導(dǎo)者被制造出來的，因為伊庫薩1認(rèn)為作為戰(zhàn)士的自己并不能帶領(lǐng)克蘇魯人走向和平的未來。也正是因此，伊庫薩3在伊庫薩1的設(shè)計中是一名像Sir Violet般溫柔的領(lǐng)導(dǎo)者，不應(yīng)該像伊庫薩2所說的那樣成為惡魔的手下。在聽到伊庫薩2說Another Gold長得與紅子一模一樣時，伊庫薩1懷疑到了被吸入黑洞的宇宙人青子頭上，因為沒有其他的可能。盡管確定了克蘇魯人已經(jīng)將魔爪伸向了群青，但伊庫薩2拒絕讓重傷的伊庫薩1參與戰(zhàn)斗，因為她認(rèn)為伊庫薩1很可能會因為逞強(qiáng)把自己害死，這樣一來她伊庫薩2就無法親手終結(jié)自己的姐姐了。

此時，克蘇魯人的先頭部隊抵達(dá)了群青，為首的正是伊庫薩3。現(xiàn)在她已經(jīng)控制了伊庫薩機(jī)器人、伊庫薩西格瑪以及伊庫薩龍三臺機(jī)體，迎戰(zhàn)的伊庫薩2看起來毫無勝利的可能。

第五話 溫柔而強(qiáng)大的伊庫薩2（后篇）

伊庫薩2依然無法對伊庫薩3造成任何傷害，擔(dān)心2號的紅子強(qiáng)行變身參與戰(zhàn)斗，結(jié)果兩人一同遭到擊敗。就在此時，伊庫薩3突然感到身體不適，伊庫薩2抓住機(jī)會與伊庫薩1一同對伊庫薩3發(fā)起精神攻擊，讓她放開了對伊庫薩機(jī)器人以及伊庫薩西格瑪?shù)目刂?，兩人成功奪回自己的分身。由于精神攻擊，伊庫薩3一時陷入混亂，撤退了。

因為親眼目睹了克蘇魯人降臨的景象，出于恐懼，冬子又開始變得消極起來，再次絕食，并與伊庫薩2發(fā)生爭吵。伊庫薩1試圖調(diào)和兩人關(guān)系，但伊庫薩2不耐煩起來，脫離冬子的身體，去找新人間體了。紅子照顧著冬子，想方設(shè)法勸她吃東西，但是冬子說什么也不肯。這時候，一個會動的兔子玩偶突然出現(xiàn)，強(qiáng)行往冬子嘴里塞了漢堡，之后離開了，那就是伊庫薩2給自己找的新身體。冬子的態(tài)度有所轉(zhuǎn)變，她告訴紅子，伊庫薩2讓她想起了一個已經(jīng)消失的人。

在維生艙里，伊庫薩3發(fā)現(xiàn)自己的身體貌似在崩壞，去找AG進(jìn)行詢問，但AG對此躲躲閃閃，讓伊庫薩3心里產(chǎn)生了懷疑。原來，在AG放出伊庫薩3時，伊庫薩3實際上還處于未完成狀態(tài)。即使不進(jìn)行戰(zhàn)斗，伊庫薩3的身體也會慢慢衰敗，最終死亡。

第六話 屹立的戰(zhàn)士們

霧提出自己可以代替冬子，但冬子已經(jīng)回心轉(zhuǎn)意，重新與伊庫薩2一心同體。另一方面，在從母船返回平行世界的地球途中，伊庫薩3再次感到不適，墜落到地面上，被柘榴與希實香發(fā)現(xiàn)。因為看到伊庫薩3與伊庫薩1有些相像，柘榴認(rèn)為使用伊庫薩1的手鐲或許能幫助伊庫薩3恢復(fù)過來。在戴上手鐲的瞬間，伊庫薩3看到了伊庫薩1的記憶，其中也包括她看著正在制造中的伊庫薩3的場景，伊庫薩3由此知道了一切，不再為AG工作，來到群青與兩名姐姐相認(rèn)。

由于伊庫薩3的背叛，氣急敗壞的AG派出了最新制造的生物兵器Neos Gold，打算取得伊庫薩三姐妹的性命。伊庫薩三姐妹一同對陣Neos，伊庫薩1的Charge Up系統(tǒng)在此過程中被破壞，伊庫薩3則在打出對Neos的致命一擊后耗盡能量戰(zhàn)死。悲痛不已的伊庫薩1與伊庫薩2準(zhǔn)備埋葬伊庫薩3，但3號卻因為吸收了兩人的能量而復(fù)活，服裝變成了半紅半藍(lán)，而這就是伊庫薩1預(yù)想中伊庫薩3的樣子。復(fù)活后的伊庫薩3身體虛弱，紅子決定將她托付給柘榴與希實香，自己則打算繼續(xù)尋找復(fù)活青子的方法，與伊庫薩2告別。此時，賽比雅突然出現(xiàn)在幾人面前，告知了她們AG入侵平行世界的理由：她打算占領(lǐng)所有的地球，殺死每個地球上的蒼崎青子，霸占所有遠(yuǎn)野志貴，伊庫薩1因此確認(rèn)了AG就是失蹤的宇宙人青子。為了阻止宇宙人青子，伊庫薩1與伊庫薩2根據(jù)賽比雅提供的情報，朝克蘇魯人下一步正要入侵的平行世界飛奔過去。