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每一次困惑,是一次升華的契機

2023-04-23 14:31 作者:計算老司機  | 我要投稿

激勵我不斷通過自媒體做視頻教學(xué),無論是短視頻,還是小班課,就是有同學(xué)持續(xù)不斷地深入學(xué)習(xí),并一直保持專業(yè)的交流,在他們的研究中也派上了用場。今天我分享一個表面吸附小班的同學(xué)小葉帶來的案例,我相信對于從事表面化學(xué)鍵分析的朋友們,非常有幫助。

首先看問題:H2分子鍵合非常簡單,H-H之間有一個σ單鍵,成占據(jù)態(tài)(填入兩個電子),而緊隨它但能量更高的就是其反鍵態(tài)σ*??雌饋矸浅:唵蔚氖虑?,但問題就在于小葉他做出來是這個樣子(-COHP計算,右側(cè)代表成鍵,左側(cè)則是反鍵):

錯誤結(jié)果:成鍵態(tài)部分占據(jù)

可以清楚看到,他得到的成鍵態(tài)是部分占據(jù)。這明顯不復(fù)合H2的軌道特征。但錯在哪里呢?如此簡單的體系,計算參數(shù)都很規(guī)范,為甚么會得到這樣的結(jié)果?為了搞清楚這一點,我們需要介紹一個概念 – 離散能級連續(xù)化。因為態(tài)密度是電子狀態(tài)在能量空間的分布,但出現(xiàn)相鄰狀態(tài)都是高度局域的,而且彼此遠(yuǎn)離(即能級差很大),在數(shù)學(xué)上做連續(xù)化時容易顯著偏離原來離散能級中心。我為了把這個例子凸顯明顯,在態(tài)密度小班課中特意設(shè)計了一個單Na原子態(tài)密度計算,如下圖:

Na原子的態(tài)密度圖,深能級被向高能級偏移并顯著寬化

可以清楚看到,最內(nèi)層軌道對應(yīng)的能級計算值在-1031.78 eV(VASP,PBE泛函計算), 而實際做出來的態(tài)密度圖在-1029.70 eV, 偏差幅度達到2 eV, 峰寬化也很明顯。這是明顯錯誤的,原因就在于它的下一個能級在1000 eV外,并且擁有更多的電子狀態(tài),因此連續(xù)化函數(shù)擬合時為了遷就高能級而移動了這個低能級以降低擬合偏差。但是這種處理毫無價值,因為我們關(guān)心的是費米能級附近的狀態(tài),對于深能級并不關(guān)心。

解決辦法:當(dāng)我們需要獲得高品質(zhì)態(tài)密度數(shù)據(jù),需要密切注意你需要分析的電子狀態(tài)大約在什么能量范圍(一般都在費米能級附近),在VASP中就可以通過設(shè)置EMIN, EMAX, NEDOS來限定這個連續(xù)化時品質(zhì)和能量分辨率(CASTEP中可以通過設(shè)置DOS范圍來實現(xiàn)調(diào)控)。下面是小葉設(shè)置了以上參數(shù)新得到的H2分子的態(tài)密度圖(COHP,沒有加負(fù)號,所以左側(cè)是成鍵、右側(cè)反鍵):

H2正確的COHP結(jié)果(注意沒加負(fù)號,所以左側(cè)是成鍵)

必須恭喜小葉順利得到可靠結(jié)果,也為他的認(rèn)真點贊。各位朋友可能感受到,做理論計算分析需要非常細(xì)心,同時需要掌握的知識技能很多,馬虎不得。


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