鹿明生物中藥:數(shù)據(jù)到底有多硬?服務(wù)好在哪里?
鹿明生物中藥產(chǎn)品部
致中藥科研工作者的一封信
大家好!
鹿明生物于2023年6月19號(hào)對(duì)中藥組學(xué)研究平臺(tái)做了正式的發(fā)布,很開心與大家正式見面,也很開心因此獲得大家更多的認(rèn)可和關(guān)注。在此,我謹(jǐn)代表鹿明中藥研究平臺(tái)向各位老師致以真誠感謝!
或許很多老師在聽說我們的中藥研究服務(wù)平臺(tái)之后會(huì)好奇地問:中藥的數(shù)據(jù)庫很多,鹿明為啥還要再花那么大的投入做中藥數(shù)據(jù)庫建設(shè)?鹿明生物的中藥研究服務(wù)平臺(tái)跟其它公司相比有啥特點(diǎn)?目前有很多開源的中藥數(shù)據(jù)庫,可以給廣大的中藥研究者提供不同維度的信息,比如:
一、精準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫
1.Tasly-TCM中藥數(shù)據(jù)庫(https://cloud.tasly.com/#/tcm/home )
該數(shù)據(jù)庫包含:48126個(gè)處方、9122種植物、34967種有效成分和13109個(gè)靶標(biāo),供用戶查詢中醫(yī)的癥狀、處方、草藥和成分。
2.??HERB數(shù)據(jù)庫
(http://herb.ac.cn/ )
該數(shù)據(jù)庫包含:中藥材7263、中藥材有效成分49258、靶點(diǎn)12933、疾病28212種,并提供高通量實(shí)驗(yàn)和參考挖掘數(shù)據(jù)的瀏覽、搜索、查看、下載等功能。
3.?TCMID中醫(yī)藥綜合數(shù)據(jù)庫http://www.megabionet.org/tcmid/??
該數(shù)據(jù)庫包含:47 000個(gè)處方,8159個(gè)草藥,25 210個(gè)化合物,6828個(gè)藥物,3791個(gè)疾病和17 521個(gè)靶標(biāo)。是廣大中藥科研工作者在物質(zhì)基礎(chǔ)研究中的常用數(shù)據(jù)庫。
除了上述3個(gè)數(shù)據(jù)庫,目前還有很多為方便中醫(yī)藥研究而建立的數(shù)據(jù)庫。比如:
1、中藥材數(shù)據(jù)庫:由中國科學(xué)院中藥資源中心提供,收錄了5000多種中藥材的信息,包括中藥材的形態(tài)、化學(xué)成分、藥理作用、臨床應(yīng)用等方面的內(nèi)容。
2、中藥方劑數(shù)據(jù)庫:由中國中醫(yī)科學(xué)院中藥所提供,收錄了2000多種中藥方劑的信息,包括方劑的組成、功效、用法用量等方面的內(nèi)容。
3、中藥化學(xué)成分?jǐn)?shù)據(jù)庫:由中國藥科大學(xué)提供,收錄了2000多種中藥的化學(xué)成分信息,包括化學(xué)結(jié)構(gòu)、分子量、藥理作用等方面的內(nèi)容。
4、中藥藥理數(shù)據(jù)庫:由中國中醫(yī)科學(xué)院中藥所提供,收錄了中藥的藥理作用、機(jī)制、臨床應(yīng)用等方面的信息。
5、中藥臨床應(yīng)用數(shù)據(jù)庫:由中國中醫(yī)科學(xué)院中藥所提供,收錄了中藥在臨床應(yīng)用中的效果、用法用量、不良反應(yīng)等方面的信息。
6、中藥質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫:由國家藥典委員會(huì)提供,收錄了中藥的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)、檢測(cè)方法、評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)等方面的信息。
既然已經(jīng)有這么多好的數(shù)據(jù)庫,那我們鹿明生物為什么要不遺余力的打造一個(gè)本地標(biāo)品數(shù)據(jù)庫呢?
就是為了能夠?qū)χ兴幬镔|(zhì)基礎(chǔ)進(jìn)行準(zhǔn)確鑒定!目前這些公共數(shù)據(jù)庫存在兩個(gè)問題:1.僅有化合物的一級(jí)分子量、二級(jí)碎片兩個(gè)維度信息,有些甚至沒有真實(shí)的二級(jí)信息。中藥成分極其復(fù)雜,同分異構(gòu)體,糖苷和苷元普遍同時(shí)存在,如果不引入標(biāo)品的保留時(shí)間信息,僅靠一級(jí)分子量和二級(jí)質(zhì)譜碎片信息是無法準(zhǔn)確定性的,況且公共數(shù)據(jù)庫中的二級(jí)信息可能還來源不同的質(zhì)譜型號(hào),不同的質(zhì)譜參數(shù),這些都會(huì)導(dǎo)致質(zhì)譜的二級(jí)碎片譜圖雜亂,數(shù)據(jù)質(zhì)量無法保證;
2. 公開數(shù)據(jù)庫缺乏中藥代謝產(chǎn)物的信息。眾所周知代謝產(chǎn)物也很可能是發(fā)揮藥效的活性成分,但目前還沒有針對(duì)中藥代謝產(chǎn)物的數(shù)據(jù)庫。以上種種限制了對(duì)于中藥有效成分分析,活性物質(zhì)篩選、藥理作用機(jī)制的物質(zhì)基礎(chǔ)等方面的研究,也遠(yuǎn)遠(yuǎn)夠不上應(yīng)用的需要。
因此,為了打破傳統(tǒng)模式數(shù)據(jù)庫壁壘,建立新型數(shù)據(jù)庫范式,更好的解決中藥基礎(chǔ)研究中最重要的問題——準(zhǔn)確性。鹿明生物以標(biāo)準(zhǔn)品為核心構(gòu)建了三大類型特色數(shù)據(jù)庫,從四個(gè)維度(保留時(shí)間、一級(jí)精確分子量、二級(jí)碎片、同位素峰)保證對(duì)中藥化學(xué)成分的準(zhǔn)確定性,可以實(shí)現(xiàn)一針檢測(cè)分析,通過同時(shí)搜索不同本地?cái)?shù)據(jù)庫,達(dá)到分析鑒定中藥單體和復(fù)方的入血或入靶活性成分和代謝產(chǎn)物的目的,為中藥物質(zhì)基礎(chǔ)的研究工作多方位保駕護(hù)航。
以上3大類數(shù)據(jù)庫提供:保留時(shí)間、一級(jí)精確質(zhì)量(理論、實(shí)測(cè)、誤差ppm)、二級(jí)質(zhì)譜碎片(特征碎片結(jié)構(gòu)注釋)、成分分類、成分藥材來源信息、分子式、分子量誤差、CAS號(hào)、KEGG號(hào)、InChIKey、標(biāo)品貨號(hào)、廠家等信息,方便中藥成分的精準(zhǔn)注釋與相對(duì)定量分析。
雖然我們不是第一家以標(biāo)準(zhǔn)品打造中藥數(shù)據(jù)庫的公司!
但我們一定是目前唯一一家不計(jì)成本打造中藥化學(xué)成分全標(biāo)品數(shù)據(jù)庫的公司!
所有自建庫均為:實(shí)際購買標(biāo)準(zhǔn)品在自已儀器上建立本地自建庫,非外買庫。且樣本實(shí)際檢測(cè)所用液相、色譜柱、質(zhì)譜儀、參數(shù)與數(shù)據(jù)庫建立時(shí)完全一致,有效保證樣本檢測(cè)結(jié)果與自建數(shù)據(jù)庫圖譜的可比性!!確保定性結(jié)果準(zhǔn)!準(zhǔn)!準(zhǔn)!
所以我們的數(shù)據(jù)硬,硬在真實(shí)自建的數(shù)據(jù)庫本身。
除了信息全面扎實(shí)的數(shù)據(jù)庫,我們有高精密度靈敏度高分辨率的儀器檢測(cè)和采集平臺(tái),輔以自研軟件和算法,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)結(jié)果高質(zhì)量穩(wěn)定輸出。
現(xiàn)在來回答大家的第二個(gè)問題:鹿明生物的中藥研究服務(wù)平臺(tái)的特點(diǎn)是什么?
二、為什么我們做得更好?
1、我們的核心優(yōu)勢(shì)
2、涵蓋6大檢測(cè)分析服務(wù)
基于核心數(shù)據(jù)庫結(jié)合儀器平臺(tái)與自研軟件及算法,我們實(shí)現(xiàn)中藥研究的6大檢測(cè)分析服務(wù)內(nèi)容,可助力中藥現(xiàn)代化研究方向。
3、省錢、省力、省心
基于產(chǎn)品質(zhì)量優(yōu)勢(shì)的保障,鹿明中藥研究平臺(tái)能夠?qū)崿F(xiàn)三省:省錢、省力、省心!
我們的服務(wù)好,好在分析內(nèi)容好,分析質(zhì)量好;好在完整的檢測(cè)服務(wù)體系和完備的售后解決體系。
雖然鹿明中藥組學(xué)研究平臺(tái)推出不久,但服務(wù)內(nèi)容扎實(shí)可靠。鹿明生物的中藥檢測(cè)服務(wù)質(zhì)量在同行中有絕對(duì)優(yōu)勢(shì),實(shí)在是因?yàn)楹ε聫V大研究者不了解,走了彎路,所以寫了這一篇不長不短的推文,以供大家交流參考。
祝大家在今后的科研和工作中順順利利!?。?/p>
此致!
關(guān)于鹿明生物中藥創(chuàng)新組學(xué)平臺(tái)的更多介紹,可通過下方視頻了解喲~
注:文章解釋權(quán)歸鹿明生物所有。如有任何疑問或想法請(qǐng)通過官方渠道聯(lián)系鹿明生物哦!
.
文末看點(diǎn)|lumingbio
上海鹿明生物科技有限公司是歐易生物旗下從事蛋白質(zhì)組及代謝組質(zhì)譜檢測(cè)的專業(yè)質(zhì)譜組學(xué)服務(wù)公司。公司建有空間代謝組商業(yè)服務(wù)平臺(tái),深耕質(zhì)譜組學(xué)檢測(cè)分析,具體包括空間代謝組、雙平臺(tái)代謝組、靶向代謝組、TMT標(biāo)記定量蛋白組、翻譯后修飾蛋白組、4D-DIA蛋白組、單細(xì)胞及超微量蛋白組、空間蛋白組等。創(chuàng)新質(zhì)譜組學(xué)平臺(tái)廣泛應(yīng)用于機(jī)制解析、分型診斷、標(biāo)志物篩選、藥靶發(fā)掘等多個(gè)領(lǐng)域。公司并先后獲得高新技術(shù)企業(yè)、上海市專精特新企業(yè)并建有院士專家工作站,自有包括tims tof pro2在內(nèi)的各類大型質(zhì)譜近二十臺(tái)套,年服務(wù)項(xiàng)目超2000項(xiàng)。鹿明生物協(xié)助合作伙伴發(fā)表SCI論文近千篇,成功打造以硬數(shù)據(jù)、好服務(wù)為基礎(chǔ),以空間代謝組為特色的質(zhì)譜組學(xué)檢測(cè)服務(wù)公司品牌。
往期精彩推薦
揭秘鹿明生物的中藥代謝組學(xué)分析平臺(tái),為中藥研究提供強(qiáng)有力支持!
2023-07-12
創(chuàng)新中藥新品重磅上市!1000+種代謝物一次檢測(cè),多重升維精準(zhǔn)全,空代解碼中藥空間構(gòu)象
2023-07-5
鹿明創(chuàng)新中藥研究平臺(tái)——“百味中藥”成分鑒定支持計(jì)劃
2023-06-14
鹿明生物L(fēng)UOMICS CM助力中藥研究難題!6項(xiàng)特色服務(wù),3大中藥數(shù)據(jù)庫保障!
2023-06-7
LC-MS和GC-MS兩大質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)共同助力中藥復(fù)方成分定性分析
2023-05-29
END?
鯤?撰文
歡迎轉(zhuǎn)發(fā)到朋友圈
本文系鹿明生物原創(chuàng)
轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明本文轉(zhuǎn)自鹿明生物
我知道你在看喲
點(diǎn)“閱讀原文”了解更多