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在成功處理上千例單細胞樣本后,我們收獲了10個樣本解離技巧?。ㄎ哪└浇怆x經(jīng)驗視頻鏈

2020-05-15 15:01 作者:上海歐易生物  | 我要投稿


Kate張?是誰?

Kate張,人稱張老板,歐易生物單細胞事業(yè)部元老之一。率領一眾須眉和巾幗,披荊斬棘,鏖戰(zhàn)大江南北,短時間內(nèi)為歐易搭建了完善的單細胞實驗體系,替歐易生物在單細胞領域闖下“赫赫威名”。

在Kate張的帶領下,歐易單細胞天團至今已經(jīng)成功處理樣本上千例,組織類型覆蓋數(shù)十種。

樣本解離作為單細胞實驗的第一道門戶,結(jié)果質(zhì)量直接決定整個項目的成功與否,其重要性不言而喻。但是很多老師和同學在開展單細胞實驗伊始,總是會碰到各種各樣的問題。

為了幫助大家制備出高質(zhì)量的單細胞懸液,小編專門采訪了Kate張,就單細胞懸液的制備中那些讓人“頭疼”的問題,為大家一一解答。

Q1

問:達到怎樣的要求才算高質(zhì)量的單細胞懸液呢?

答:主要為以下幾個判斷標準:在總細胞量高于105的前提下

1.鏡檢結(jié)果顯示紅細胞占比低于4%;

2.碎片/其他雜質(zhì)占比低于4%;

3.細胞團數(shù)量占比低于4%;

4.細胞活性高于85%,并能半小時內(nèi)保持活性不變。

Q2

問:組織需要剪非常碎嗎?一般剪碎到什么程度比較好呢?

答:是的,一般組織剪得越碎,在消化過程中與酶解液接觸越充分,越利于消化。我們一般將組織剪碎至1-2mm3的糜狀,如下圖1

圖1 | 剪碎后的組織

Q3

問:一般細胞的離心力在多少最佳?

答:我們正常離心力在300g左右,有時會根據(jù)細胞具體情況作調(diào)整。

Q4

問:如果細胞沉淀非常紅,可以多加點紅細胞裂解液嗎?

答:一般情況下不建議多加裂紅液。一般紅細胞裂解液有推薦的紅細胞裂解液/細胞懸液的體系,增大體系可能影響到細胞活性。所以,紅細胞裂解不干凈,建議增加裂紅時間,或增加裂紅次數(shù)。

Q5

問:假設制備出的單細胞,細胞量比較多,但是活性不高,如何提高活性呢?

答:可以嘗試一下去死細胞試劑盒,根據(jù)我們操作經(jīng)驗,細胞活性在60%-75%區(qū)間時去死細胞提高活性的效果較好。

圖2 | 去死細胞試劑盒

Q6

問:假設細胞懸液中碎片比較多,要怎么去除呢?

答:建議嘗試以下3點去除:

1.降低離心力,多次洗滌,或密度梯度離心;

2.用血清重懸細胞,離心洗滌,可去除部分碎片;

3.去碎片試劑盒,根據(jù)我們操作經(jīng)驗,大塊的碎片去除效果較好。

圖3 | 去碎片試劑盒

Q7

問:如果細胞懸液中有比較大的結(jié)團,要怎么去除呢?

答:可以輕柔地多吹打幾次,無法吹開可用40μm細胞篩過濾去除。

Q8

問:倘若細胞消化下來后,還沒進行處理細胞活性就往下降了,這要怎么辦?

答:根據(jù)我們的經(jīng)驗,可能有以下2種可能。

1.可能與解離體系有關,建議嘗試加入一些輔助酶,例如:DNA酶,透明質(zhì)酸酶等輔助消化,減少酶解液對細胞狀態(tài)的影響;

2.消化過程是否太過劇烈,例如:旋轉(zhuǎn)消化轉(zhuǎn)速過高或震蕩消化震蕩劇烈都有可能對細胞狀態(tài)造成影響。

Q9

問:要是鏡檢細胞用的臺盼藍,鏡檢下不知道有一些是不是細胞,這個要怎么判斷呢?

答:建議嘗試用熒光染料對細胞進行染色,再行鏡檢,對比明場與熒光即可判斷。

Q10

問:為什么沒染色的時候細胞形態(tài)挺好的,臺盼藍一染色就有挺多片狀的碎片???

答:可能是因為臺盼藍里的碎片,建議將臺盼藍過一下0.22μm的過濾器之后再鏡檢。

今天的解離十問十答欄目就結(jié)束啦,不知道有沒有幫助到大家解除疑惑呢?


解離經(jīng)驗分享視頻,請戳:https://www.bilibili.com/video/BV1Ti4y1b7Yt觀看。

END

文章源自歐易生物公眾號

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