第十二章 蛋白質(zhì)的生物合成

1．密碼子（codon）：存在于信使RNA 中的三個相鄰的核苷酸順序，是蛋白質(zhì)合成中某一特定氨基酸的密碼單位。密碼子確定哪一種氨基酸叁入蛋白質(zhì)多肽鏈的特定位置上；共有64 個密碼子,其中61 個是氨基酸的密碼，3 個是作為終止密碼子。

2．同義密碼子（synonym codon）：為同一種氨基酸編碼的幾個密碼子之一，例如密碼子UUU 和UUC 二者都為苯丙氨酸編碼。

3．反密碼子（anticodon）：在轉(zhuǎn)移RNA 反密碼子環(huán)中的三個核苷酸的序列，在蛋白質(zhì)合成中通過互補的堿基配對，這部分結(jié)合到信使RNA 的特殊密碼上。

4．變偶假說（Wobble hypothesis）：克里克為解釋tRNA 分子如何去識別不止一個密碼子而提出的一種假說。據(jù)此假說，反密碼子的前兩個堿基（3ˊ端）按照堿基配對的一般規(guī)律與密碼子的前兩個（5ˊ端）堿基配對，然而tRNA 反密碼子中的第三個堿基，在與密碼子上3ˊ端的堿基形成氫鍵時，則可有某種程度的變動，使其有可能與幾種不同的堿基配對。

5．移碼突變（frame-shift mutation）：一種突變，其結(jié)果為導(dǎo)致核酸的核苷酸順序之間的正常關(guān)系發(fā)生改變。移碼突變是由刪去或插入一個核苷酸的點突變構(gòu)成的，在這種情況下，突變點以前的密碼子并不改變，并將決定正確的氨基酸順序；但突變點以后的所有密碼子都將改變。且將決定錯誤的氨基酸順序。

6．氨基酸同功受體（isoacceptor）：每一個氨基酸可以有多過一個tRNA 作為運載工具，這些tRNA 稱為該氨基酸同功受體。

7．反義RNA（antisense RNA）：具有互補序列的RNA。反義RNA 可以通過互補序列與特定的mRNA 相結(jié)合，結(jié)合位置包括mRNA 結(jié)合核糖體的序列（SD 序列）和起始密碼子AUG，從而抑制mRNA 的翻譯。又稱干擾mRNA 的互補RNA。

8． 信號肽（signal peptide）: 信號肽假說認(rèn)為，編碼分泌蛋白的mRNA在翻譯時首先合成的是N 末端帶有疏水氨基酸殘基的信號肽，它被內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上的受體識別并與之相結(jié)合。信號肽經(jīng)由膜中蛋白質(zhì)形成的孔道到達內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)腔，隨即被位于腔表面的信號肽酶水解，由于它的引導(dǎo)，新生的多肽就能夠通過內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜進入腔內(nèi)，最終被分泌到胞外。翻譯結(jié)束后，核糖體亞基解聚、孔道消失，內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜又恢復(fù)原先的脂雙層結(jié)構(gòu)。

9. 簡并密碼（degenerate codon）：或稱同義密碼子（synonym codon），為同一種氨基酸編碼幾個密碼子之一，例如密碼子UUU 和UUC 二者都為苯丙氨酸編碼。

10.核糖體（ribosome）: 核糖體是很多亞細(xì)胞核蛋白顆粒中的一個，由大約等量的RNA和蛋白質(zhì)所組成，是細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)合成的場所。每個核糖核蛋白體在外形上近似圓形，直徑約為20nm。由兩個不相同的亞基組成，這兩個亞基通過鎂離子和其它非共價鍵地結(jié)合在一起。已證實有四類核糖核蛋白體（細(xì)菌、植物、動物和線粒體）它們以其單體的、亞單位的和核糖核蛋白體RNA 的沉降系數(shù)相區(qū)別。細(xì)菌核蛋白體含有約50 個不同的蛋白質(zhì)分子和3 個不同的RNA 分子。小的亞單位含有約20個蛋白質(zhì)分子和1 個RNA分子。大的亞單位含有約30 個蛋白質(zhì)分子和2 個RNA 分子。核蛋白體有兩個結(jié)合轉(zhuǎn)移RNA 的部位（部位和部位），并且也能附上信使RNA，簡寫為Rb。

11．多核糖體（polysome）:在信使核糖核酸鏈上附著兩個或更多的核糖體。

12．氨酰基部位（aminoacyl site）：在蛋白質(zhì)合成過程中進入的氨酰-tRNA結(jié)合在核蛋白體上的部位。

13．肽?；课唬╬eptidy site）：指在蛋白質(zhì)合成過程中，當(dāng)下一個氨酰基轉(zhuǎn)移RNA接到核糖核蛋白體的氨基部位時，肽酰tRNA所在核蛋白體上的結(jié)合點。

14．肽基轉(zhuǎn)移酶（peptidyl transferase）：蛋白質(zhì)合成中的一種酶。它能催化正在增長的多肽鏈與下一個氨基酸之間形成肽鍵。在細(xì)菌中此酶是50S 核糖核蛋白體亞單位中的蛋白質(zhì)之一。

15．氨酰-tRNA 合成酶（amino acy-tRNA synthetase）：催化氨基酸激活的偶聯(lián)反應(yīng)的酶，先是一種氨基酸連接到AMP 生成一種氨酰腺苷酸，然后連接到轉(zhuǎn)移RNA 分子生成氨酰-tRNA 分子。

16．蛋白質(zhì)折疊（protein folding）：蛋白質(zhì)的三維構(gòu)象，稱為蛋白質(zhì)的折疊。是由蛋白質(zhì)多肽鏈的氨基酸順序所決定的。不同的蛋白質(zhì)有不同的氨基酸順序，也就各自按照一定的方式折疊而成該蛋白質(zhì)獨有的天然構(gòu)象。這個蛋白質(zhì)折疊是在自然條件下自發(fā)進行的，在生物體內(nèi)條件下，它是在熱力學(xué)上最穩(wěn)定的形式。多肽鏈在核糖體上一面延長，一面自發(fā)地折疊成其本身獨有的構(gòu)象。當(dāng)肽鏈終止延長并從核糖體上脫落時，它也就折疊成天然的三維結(jié)構(gòu)。

17．核蛋白體循環(huán)（polyribosome）：是指已活化的氨基酸由tRNA轉(zhuǎn)運到核蛋白體合成多肽鏈的過程。

18．鋅指（zine finger）：是調(diào)控轉(zhuǎn)錄的蛋白質(zhì)因子中與DNA 結(jié)合的一種基元，它由大約30 個氨基酸殘基的肽段與鋅螯合形成的指形結(jié)構(gòu)，鋅以4 個配位鍵與肽鏈的Cys或His 殘基結(jié)合，指形突起的肽段含12-13 個氨基酸殘基，指形突起嵌入DNA 的大溝中，由指形突起或其附近的某些氨基酸側(cè)鏈與DNA 的堿基結(jié)合而實現(xiàn)蛋白質(zhì)與DNA 的結(jié)合。

19．亮氨酸拉鏈（leucine zipper）：這是真核生物轉(zhuǎn)錄調(diào)控蛋白與蛋白質(zhì)及與DNA 結(jié)合的基元之一。兩個蛋白質(zhì)分子近處C 端肽段各自形成兩性α-螺旋，α-螺旋的肽段每隔7 個氨基酸殘基出現(xiàn)一個亮氨酸殘基，兩個α-螺旋的疏水面互相靠攏，兩排亮氨酸殘基疏水側(cè)鏈排列成拉鏈狀形成疏水鍵使蛋白質(zhì)結(jié)合成二聚體，α-螺旋的上游富含堿性氨基酸（Arg 、Lys）肽段借Arg 、Lys 側(cè)鏈基團與DNA 的堿基互相結(jié)合而實現(xiàn)蛋白質(zhì)與DNA 的特異結(jié)合。

20．順式作用元件（cis-acting element）：真核生物DNA 的轉(zhuǎn)錄啟動子和增強子等序列，合稱順式作用元件。

21．反式作用因子（trans-acting factor）：調(diào)控轉(zhuǎn)錄的各種蛋白質(zhì)因子總稱反式作用因子。

22．螺旋環(huán)螺旋（helix-loop-helix）：這種蛋白質(zhì)基元由兩個兩性α螺旋通過一個肽段連結(jié)形成螺旋環(huán)螺旋結(jié)構(gòu)，兩個蛋白質(zhì)通過兩性螺旋的疏水面互相結(jié)合，與DNA 的結(jié)合則依靠此基元附近的堿性氨基酸側(cè)鏈基團與DNA 的堿基結(jié)合而實現(xiàn)。