2012年2月2日沈陽鐵路局吉林機務段的HXN5型0499號機車擔當長春北至營城電廠站間83653次煤炭列車到達電廠站2道停車后本務機車擔當調(diào)車作業(yè);由于調(diào)車人員電臺故障電廠站值班員呼叫83653次司機連掛;司機動車推進將尾部車輛推下電廠站1道盡頭翻車機庫走行坑道內(nèi)全輪脫軌;構成鐵路一般交通D類事故但擔當83653次列車的本務機車HXN5型0499號機車除輪對擦傷外車體并未出軌或損壞

2014年7月23日沈陽鐵路局吉林機務段的HXN5型0586號機車(蘇家屯機務段丹東運用車間司機值乘)擔當蘇家屯至丹東間43141次貨車(該列車1-16位裝載貨物為煤17-21位裝載貨物為汽油)2:25當列車運行至沈丹線祁家堡至草河口間122km267m有人看守道口處一輛制動失靈的東風天龍牌重型半掛牽引車撞斷道口欄桿后強行搶越43141次列車停車不及以72km/h的速度與其相撞導致機車及機后1-14輛車輛顛覆,機后第15位車輛脫線擔當43141次列車學習司機頭部受傷;事故中斷沈丹線下行行車約9小時;構成鐵路交通重大事故;事故后HXN5型0586號機車報廢殘骸保存在蘇家屯機務段

2018年10月22日沈陽鐵路局吉林機務段HXN5型0568號機車擔當棋盤至舒蘭間46183次貨物列車;計劃出庫后棋盤站二場6道掛車,因棋盤站值班員與現(xiàn)場列檢人員溝通不當機車進入二場6道走行掛頭過程中脫軌器突然上線0568號機車停車不及以12km/h速度軋過脫軌器前臺機車轉向架全輪脫線;事故造成0568號機車前轉向架走行部輕微受損影響棋盤站二場5道和7道接車進路,事故后HXN5型0568號機車由吉林機務段自行修復后恢復運行

2020年5月20日19:09上海鐵路局合肥機務段和諧HXN50650號機車牽引25032次貨車運行至皖贛線上行155km＋870m安徽省績溪縣境內(nèi)時司機發(fā)現(xiàn)一行人在鐵路上拍攝視頻從而果斷采取制動措施,但因制動不及相撞至行人當場死亡

2020年9月22日,哈爾濱鐵路局齊齊哈爾機務段和諧HXN5 0006號機車牽引貨車(車次不明)運行至伊加線內(nèi)蒙古呼倫貝爾克一河鎮(zhèn)境內(nèi)一無人看守鐵路道口時與一輛搶越道口的五菱小貨車相撞,萬幸事故沒有造成人員傷亡

2020年12月4日15:00左右某和諧HXN5型機車單機(車次車號不明)運行至鶴崗線時一輛運送砂石的江淮牌貨車因制動失靈沖入鐵路線路;執(zhí)勤民警及時封鎖現(xiàn)場并攔停機車,萬幸事故沒有造成人員傷亡