神經(jīng)科學(xué)一區(qū)期刊,代謝組學(xué)鑒別缺血性卒中與擬卒中提供診斷價值
前言
中風(fēng)是成人致殘的主要原因,其中大部分是由腦梗塞引起的。區(qū)分缺血性卒中患者(IS)和模擬卒中患者(SMS)是很重要的,因為錯誤的分類可能會導(dǎo)致不適當(dāng)?shù)母深A(yù),阻止有效的治療,以及資源的低效分配,如卒中單元護理。多模式計算機斷層掃描(CT)的常規(guī)診斷在區(qū)分IS和SMS方面的能力有限。因此,對新型診斷標(biāo)記物的需求很大。循環(huán)代謝組靈敏地捕捉多個器官的病理生理事件,因此可能反映與急性IS相關(guān)的事件,如腦損傷、全身反應(yīng)(如應(yīng)激)和血管內(nèi)的過程。
本篇,作者使用非靶向代謝組學(xué)的發(fā)現(xiàn)-驗證方法來識別能夠區(qū)分IS和SM的代謝物。作者進一步進行了系統(tǒng)的文獻回顧,以確定在癥狀出現(xiàn)后的24小時內(nèi)與IS相關(guān)的循環(huán)代謝物,并評估相關(guān)代謝物的診斷價值。
本篇由來自于德國慕尼黑大學(xué)中風(fēng)和癡呆癥研究所斯蒂芬·蒂德博士在ANNALS OF NEUROLOGY期刊(IF:11.274)發(fā)表了題為 的研究成果,通過代謝組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了不對稱和對稱的二甲基精氨酸、孕烯醇酮硫酸鹽和腺苷特征這四種代謝產(chǎn)物可以更好地鑒別急性缺血性卒中與擬卒中,優(yōu)于常規(guī)診斷的多模式顱腦CT(CT;AUC=0.80)和樣本中檢測到的先前發(fā)表的代謝物集合。這一組與中風(fēng)病理生理學(xué)相關(guān)的已知生物學(xué)效應(yīng)的4種代謝物,可以在患者到達醫(yī)院時識別IS患者,從而鼓勵進一步深入的研究,為性缺血性卒中與擬卒中鑒別提供相關(guān)的診斷價值。
研究方法
1. 實驗分組/研究材料
(1) 1期實驗(發(fā)現(xiàn)階段):正常對照組NC;卒中患者組IS
(2) 2期實驗(驗證階段):正常對照組NC;卒中患者組IS
(3) 3期實驗(推導(dǎo)階段):模擬卒中組SM;卒中患者組IS(2期樣本)
(4) 4期實驗(驗證階段):模擬卒中組SM;卒中患者組IS
(5) 5期實驗(重復(fù)階段):模擬卒中組SM;卒中患者組IS
2.技術(shù)路線
2.1 生理/病理分析:醫(yī)院常規(guī)項目檢查、家族病史調(diào)查、CT檢查、NIHSS美國國立衛(wèi)生研究院卒中量表評分、磁共振成像(MRI)檢查
2.2 代謝組學(xué):LC-MS 非靶標(biāo)代謝組分析
2.3 統(tǒng)計分析:常規(guī)數(shù)據(jù)統(tǒng)計、兩階段遞增法、5次重復(fù)的10倍交叉驗證、多元線性回歸模型、支持向量機、線性判別分析、10000棵樹200次運行的隨機森林、K近臨分析、樸素貝葉斯、邏輯回歸
研究結(jié)果
1.第1期(發(fā)現(xiàn)階段)篩選出49種代謝物,其中通過第2期(驗證階段)篩出有41種
在發(fā)現(xiàn)階段樣本(1期)的689個測定代謝物中,不到50%的樣本檢測到180個代謝物,剩下509個代謝物進行分析。將IS患者與NC患者進行比較,發(fā)現(xiàn)樣本中有49種代謝物符合預(yù)先指定的統(tǒng)計意義標(biāo)準(zhǔn)(1期;見圖1A、表1B)。在驗證階段樣本(2期)中,其中41種也符合這些標(biāo)準(zhǔn),包括16種脂肪酸,類固醇皮質(zhì)醇和孕烯醇酮硫酸鹽,三羧酸(TCA)循環(huán)中間體檸檬酸和蘋果酸(均升高),脯氨酸,以及核苷腺苷、鳥苷和肌苷。
圖1A | 采用發(fā)現(xiàn)-確認(rèn)方法的抽樣和分析策略對NC、IS和SM樣本進行比較
表1B | 49種代謝物的統(tǒng)計數(shù)據(jù),按p值排序
2.六種分類模型中隨機森林的分類效果最好
可以看到六種分類模型(圖1D,SVM:支持向量機、LDA:線性判別分析、RF(10000)*200:10000棵樹200次運行的隨機森林、KNN:K近臨分析、NB:樸素貝葉斯、LR:邏輯回歸)中,隨機森林的分類效果最好,故選擇隨機森林模型。在隨機森林分類中,30種內(nèi)源性代謝物將IS患者與NC區(qū)分開來,曲線下面積(AUC)為0.961(圖1C)。
圖1C | 隨機森林模型的AOC曲線
圖1D | 6種分類模型的AUC對比
3.進一步分析挑選出4種代謝物
隨機森林分類結(jié)果的分層聚類顯示了相當(dāng)大的共線性,特別是在脂肪酸之間(圖2E),表明分類器中存在冗余。在考慮共線性的情況下為簡化分類器鑒別IS和SM的信息最豐富的代謝產(chǎn)物(圖2A),作者評估了隨機森林條件變量的重要性,發(fā)現(xiàn)不對稱二甲基精氨酸、對稱二甲基精氨酸、孕烯醇酮硫酸鹽和腺苷排名最高(3期)。
圖1E | 隨機森林分類結(jié)果的分層聚類熱圖
圖2A | 隨機森林變量重要性分析排名前10結(jié)果
4.進一步分析挑選出4種代謝物
與多模態(tài)CT相比,這4種代謝物的敏感性為82.5%,特異性為84.9%,其AUC更高(0.90 vs 0.74, 3期;圖2B)。在驗證樣本中也得到了類似的結(jié)果(4期,敏感性:92.4%,特異性:82.9%;圖2C)。通過傾向評分匹配選擇,進一步控制潛在的混雜因素,如人口統(tǒng)計學(xué)、血管危險因素和藥物治療(N = 210;圖2A),在繼續(xù)招募的復(fù)制樣本中表現(xiàn)依舊更好(第5期,敏感性:88.6%,特異性:72.7%,AUC = 0.90, N = 500;圖2D)。作者進一步進行了2項敏感性分析:第一,排除接受重組組織型纖溶酶原激活劑(rt-PA)的SM患者;第二,排除接受rt-PA治療后采血的IS患者。兩種分析結(jié)果相似(圖2E)。選定的4種代謝物組也能區(qū)分IS和NC患者(AUC = 0.92;圖2F)。
圖2B | 四種代謝物在3期樣本中的預(yù)測效果
圖2C | 四種代謝物在4期樣本中的預(yù)測效果
圖2D | 四種代謝物在5期樣本中的預(yù)測效果
圖2E | 四種代謝物在4期樣本中的預(yù)測效果(排除rt-PA樣本)
圖2F | 四種代謝物在5期樣本中的預(yù)測效果(排除rt-PA樣本)
5.進一步評估預(yù)示代謝物水平變化與急性事件之間的聯(lián)系
4種診斷代謝物的水平在中風(fēng)后第90天(D90)基本恢復(fù)正常(圖3A),從而證明了第1天(D1)代謝物水平變化與急性事件之間的聯(lián)系。入院時,心栓塞性卒中患者的SDMA水平(D1)明顯高于大動脈粥樣硬化性卒中和病因不明的卒中患者(圖3B,5期)。孕烯醇酮硫酸鹽水平與梗死體積(β = 0.66, p < 0.0001;圖3C,5期)以及入院時國立衛(wèi)生研究院卒中量表評分(β = 0.47, p = 0.001)顯著相關(guān)。在評估分析前變異性的影響時,作者發(fā)現(xiàn)腺苷水平與分析前樣品處理時間呈負相關(guān)(圖3D,4期),重要的是,在IS患者和SM患者之間沒有差異(51 vs 51分鐘,p = 0.81)。有94.2%的樣品是在40-70分鐘內(nèi)加工的。
圖3A | 四種代謝物水平在卒中后第90天恢復(fù)到對照水平
圖3B | 不同患者四種代謝物水平在入院時的水平對比
圖3C?| 四種代謝物水平與腦梗塞體積關(guān)系
圖3D | 四種代謝物水平與檢測時間關(guān)系
6.檢索數(shù)據(jù)庫篩選出5項過去研究用于對比
為了將作者的發(fā)現(xiàn)與之前報道的與急性IS相關(guān)的代謝物集聯(lián)系起來,作者進行了一項系統(tǒng)回顧,搜索提供IS患者循環(huán)代謝物數(shù)據(jù)的研究,這些研究僅限于癥狀出現(xiàn)后24小時內(nèi)的血液采樣。在鑒定的3149項記錄中,有5項研究符合選擇標(biāo)準(zhǔn)(表2)。所有研究均為單中心、基于醫(yī)院的研究,比較IS患者與NC患者( 4項研究)或頭痛或眩暈患者(1項研究)。大多數(shù)(4項研究)缺乏獨立樣本的驗證。總的來說,這些研究報告了41種與IS相關(guān)的不同代謝物,研究之間只有1種代謝物重疊。
表2 | 5項過去研究的在當(dāng)前項目中的結(jié)果
7.本次篩選的30種代謝物中有4種與過去的研究表現(xiàn)出了相同的方向性
41種代謝物中有24種在作者的數(shù)據(jù)集中。對當(dāng)前數(shù)據(jù)集的針對性查找發(fā)現(xiàn),在發(fā)現(xiàn)樣本(第1期)的基本模型中有11種代謝物滿足預(yù)先指定的統(tǒng)計顯著性標(biāo)準(zhǔn),在完整模型中也有4種代謝物(腺苷、脯氨酸、丙基肉堿和12-羥基乙二烯酸[HETE])滿足標(biāo)準(zhǔn),所有代謝物都具有相同的方向性。這4種代謝物在驗證樣品中也符合標(biāo)準(zhǔn)。在當(dāng)前研究(1期和2期)中識別和驗證的30種異常內(nèi)源性代謝物中,有5種(12-羥基乙二烯酸、腺苷、脯氨酸、油基肉堿和丙基肉堿)在以前的研究中進行了評估。值得注意的是,其中4個(80%)是異常的,并且在之前的數(shù)據(jù)集中表現(xiàn)出相同的方向性。
8、本項目篩選的代謝物比前人研究有更好的分類表現(xiàn)
在作者的發(fā)現(xiàn)和驗證樣本(第1期和第2期)中,用發(fā)表的代謝物集獲得的用于區(qū)分IS和NC患者的AUC值從0.61到0.80(見表2),這與當(dāng)前樣本中識別的代謝物集(發(fā)現(xiàn)和驗證樣本中分別為0.93和0.96)相比顯著降低。應(yīng)用已發(fā)表的代謝物集來區(qū)分IS患者和作者數(shù)據(jù)集中的SM患者,顯示AUC值低于0.7(3-5期)。
研究結(jié)論
在區(qū)分IS患者和SM患者的診斷準(zhǔn)確性方面的改進已逐步被證明在患者安全、臨床結(jié)果、成本效益方面皆有益處。多模式CT是目前入院時檢測顱內(nèi)出血、血管閉塞的診斷標(biāo)準(zhǔn),是全身溶栓和血管內(nèi)治療的組織窗口,但在癥狀出現(xiàn)后的6小時內(nèi),對于區(qū)分IS和SM的效用有限,其AUC值約為0.8,當(dāng)前研究也反映了AUC值約為0.8。
ADMA、SDMA、硫酸孕烯醇酮和腺苷的鑒別能力在本研究中明顯更高,據(jù)作者所知,這在血液生物標(biāo)志物中是前所未有的。因此,代謝物組可以在無法使用MRI的緊急情況下補充CT成像結(jié)果。雖然非靶向代謝組學(xué)仍然需要大量的時間和成本,但隨著技術(shù)的升級改進靶向代謝組學(xué)可以在較短的時間內(nèi)定量分析,并在護理時定量分析,使臨床應(yīng)用成為可能。
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中風(fēng)又稱“腦卒中”(cerebral stroke)是一種急性腦血管疾病,是由于腦部血管突然破裂或因血管阻塞導(dǎo)致血液不能流入大腦而引起腦組織損傷的一組疾病,包括缺血性和出血性卒中。本文在區(qū)分缺血性卒中患者(IS)和模擬卒中患者(SMS)鑒別運用代謝組學(xué)針對標(biāo)志做了發(fā)現(xiàn)、驗證及重復(fù),確認(rèn)ADMA、SDMA、硫酸孕烯醇酮和腺苷的鑒別能力在本研究中明顯更高。
本文是慕尼黑大學(xué)醫(yī)院中風(fēng)和癡呆癥研究所初級研究組組長、副教授斯蒂芬·蒂特博士發(fā)表的一篇文章,本次研究篩選出了鑒別能力更高的四種代謝物,優(yōu)于傳統(tǒng)診斷,具有很高的臨床應(yīng)用意義,文中的篩選方式和發(fā)現(xiàn)驗證的方法非常值得借鑒。
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