天啟二年春，廣寧之?dāng)?，袁崇煥正好在北京。朝廷上下亂作一團(tuán)的時候，他選擇翹班出山海關(guān)，數(shù)天后又出現(xiàn)，豪言壯語：予我兵馬錢糧，我一人足守此。朝廷壯其志，劃撥軍費(fèi)讓他募兵數(shù)千人出關(guān)。

在山海關(guān)和王在晉共事，經(jīng)略王在晉令崇煥移駐中前所，監(jiān)參將周守廉、游擊左輔軍，經(jīng)理前屯衛(wèi)事。尋令赴前屯安置遼人之失業(yè)者，崇煥即夜行荊棘虎豹中，以四鼓入城，因此王不喜袁崇煥，認(rèn)為這個人不像做大事的人。王在晉計劃修八里鋪固守山海關(guān)，袁崇煥認(rèn)為該守寧遠(yuǎn)，于是上書朝廷說明看法。這個爭論被朝中兵部尚書孫承宗看到。孫承宗之前力主熊廷弼罪該萬死，對遼事頗為關(guān)心，就決定去親自考察一番。

八月孫承宗自請為督師，袁崇煥為中軍負(fù)責(zé)營建軍營。

天啟三年，孫承宗認(rèn)為閻鳴泰無用，從不和他討論問題，隨后罷免了閻鳴泰。又一意要守寧遠(yuǎn)，但是因為祖大壽消極怠工，于是袁崇煥又被派去去寧遠(yuǎn)監(jiān)督祖大壽造城墻，二人相得益彰。

天啟四年寧遠(yuǎn)修筑完畢。孫承宗又開始派兵收復(fù)松山錦州右屯，高額的耗費(fèi)引發(fā)朝廷議論紛紛。同期袁崇煥受命查處虧空過程中擅自斬殺一校，幾乎引發(fā)兵變，孫承宗在事后自述中提及欲練袁崇煥其氣，于是將其包庇下來。

這幾年里孫承宗年老體衰，在邊關(guān)工作工作精力大不如前，多次上書請求回京，均被皇帝婉拒。

天啟五年，后金奇襲旅順大捷，毛文龍所代表的東江軍潰敗，張盤戰(zhàn)死。此時朝臣又借機(jī)彈劾孫承宗空屯兵右屯空耗費(fèi)國家糧草，牽制何在。孫承宗害怕自己離開后熊廷弼復(fù)出，于是上書激將天啟皇帝稱天下無人可替代熊廷弼，請免一死。天啟皇帝大怒，于是賜死熊廷弼。孫承宗剪除后患于是又策劃巡河趁隙攻取耀州。誰知渡河的時候被數(shù)百后金軍隊襲擊，數(shù)萬人一哄而散，主將被殺。這就是著名的柳河之?dāng)?。孫承宗引咎辭職。

九月新經(jīng)略高第上任，聽說后金計劃渡河于是動議撤錦右，袁崇煥同寧遠(yuǎn)通判金啟宗布揭反對，文中不乏痛斥孫承宗巡河懦弱之舉，恐嚇高第有兵搶糧一事。高第上書皇帝請重申權(quán)責(zé)，皇帝不理。于是這事就耽擱下來了。

十月到十二月袁崇煥連上三疏請守父喪守制回家，朝廷認(rèn)為戰(zhàn)事在即不得不奪情并讓袁崇煥官升一級，為山東右參政。

天啟六年正月，高第報告預(yù)測后金正月十五渡河。天啟這才如夢初醒讓袁崇煥去撤右屯糧食。正月十五后金軍隊渡河，偵知右屯三千人。右屯守將周守廉見狀棄城而逃，而糧食盡數(shù)被棄置在海邊，錦右陷落。（后周守廉被朝廷論罪斬首）

軍隊全部逃回寧遠(yuǎn)。副總兵趙率教守前屯防備蒙古，寧遠(yuǎn)總兵滿桂帶祖大壽朱梅左輔等人守寧遠(yuǎn)。此時山海關(guān)三萬多人，寧遠(yuǎn)二萬，覺華島七千人。

后金正月二十日攻城兩天不克，于是繞出寧遠(yuǎn)東南。袁崇煥偵知后命令屯糧點龍宮寺焚毀多余的糧草撤往覺華島，覺華島掘冰自守。后金察覺，踏冰而至，屠毀覺華島后撤兵。這就是覺華島大敗。

正月二十八日滿桂違令擅自出城攻擊后金，大捷。

袁崇煥因功升任兵部右侍郎遼東巡撫，頌魏忠賢功德，袁功勞次之，滿桂和趙率教并功又次之。滿桂不服和趙率教同功。袁素來不滿滿桂的自行其是甚至出城作戰(zhàn)，于是彈劾滿桂專橫不忠。滿桂因為破壞團(tuán)結(jié)被迫離職，在王之臣的竭力挽留下得以調(diào)任山海關(guān)總兵。

高第彈劾孫承宗吃空餉，賬面十一萬，稱軍隊只有五萬多人，多人上書彈劾孫承宗誤國，都被天啟斥退。戰(zhàn)后魏忠賢派人調(diào)查，稱有九萬七千人，高第因此稱病辭職天啟允之。王之臣繼任經(jīng)略，而滿桂為山海關(guān)總兵正是王之臣極力要求的。

期間滿桂入京面見天啟皇帝，得以備敘其功，又解開衣服給皇帝看傷疤。天啟非常感動，下令朝臣要從優(yōu)敘滿桂的功勞。

八月努爾哈赤暴斃，袁崇煥遣使吊奴款和，輿論嘩然。于是王之臣趁機(jī)劾之，稱東蒙古對明朝失望因此離心。二人發(fā)生矛盾，袁崇煥上書備疏款和拖延之策。魏忠賢本就不堪遼東軍費(fèi)糜費(fèi)，于是支持議和將王之臣調(diào)入關(guān)內(nèi)，由閻鳴泰和袁崇煥主持關(guān)外?！@就是吊奴案。

十月，袁崇煥和皇太極書信來往不斷。

不久袁崇煥動議廢插賞為馬價銀，獲得兵部首肯，從此蒙古瓦解。——這就是插賞案。

袁崇煥提議毛文龍部移鎮(zhèn)蓋州，并派趙佑徐敷奏等人去毛文龍?zhí)幷斜?。東江部叛走兩萬四千多軍民。毛文龍大怒出兵斬殺趙佑，并請斬徐敷奏。朝廷同意，但是袁崇煥表示用人之際包庇了徐敷奏。——這是東江誘畔案。

冬天，朝鮮勾結(jié)后金襲擊毛文龍，毛文龍遭遇鐵山大敗被迫退守云從島。后金統(tǒng)帥阿敏望洋興嘆。他是努爾哈赤弟弟的女婿一向被其他大貝勒排擠，這次領(lǐng)兵出征有心自立為王，于是又掉頭帶兵攻打朝鮮。

袁崇煥上書稱朝鮮勾結(jié)后金襲擊毛帥罪有應(yīng)得無需理會，自己固若金湯以逸待勞中，勸誡皇帝不要動兵。

毛文龍則諜報稱袁崇煥勾結(jié)皇太極故意按兵不動，朝鮮和后金勾結(jié)故遭此大敗云云。天啟回復(fù)稱贊他豪氣未滅，希望他不要記仇朝鮮，積極出兵擊退后金。

袁崇煥此時剛在大凌河筑城，稱“聞奴十萬據(jù)巢，十萬掠朝”，不可輕動，選擇繼續(xù)寫信和皇太極議和順便筑大凌河。

三月朝鮮最終被迫和后金簽訂協(xié)議議和不再協(xié)助明朝抗金，阿敏撤軍。

四月袁崇煥閻鳴泰頌魏忠賢功德為其立生祠?！廃h案。

天啟七年五月皇太極寫信斥責(zé)袁崇煥毫無誠意：一邊筑城一邊議和。于是后金又出兵攻大凌河，祖大壽棄城而逃，金兵遂圍錦州。

袁崇煥上書求援，于是滿桂帶一萬人從山海關(guān)出發(fā)馳援。到了寧遠(yuǎn)，袁崇煥收繳其軍隊，只給四千人。滿桂帶四千軍隊繼續(xù)馳援，遇到后金在塔山的運(yùn)糧隊，滿桂部下斬首一級后撤回寧遠(yuǎn)。

后金大兵過塔山攻寧遠(yuǎn)，擊敗寧遠(yuǎn)外的駐軍后，又撤回錦州外，不久又撤兵回師，這就是歷史上的“寧錦之戰(zhàn)”，總計歷時二十四天。歷來后金動兵都是在深冬，為的是壯丁不誤耕耘之事，這次夏季大舉用兵正逢農(nóng)忙且暑熱自然不能持久。

七月，袁崇煥又報稱大捷，因為戰(zhàn)時屢屢求援言語失措，又被天啟皇帝訓(xùn)斥為暮氣沉沉，怯戰(zhàn)畏敵，加之又款和誤國。群臣也紛紛彈劾言詞激烈，袁崇煥驚懼，于是稱病辭職。

八月，天啟病死。崇禎繼位和魏忠賢虛以委蛇。

十一月魏忠賢被迫自殺。因為之前魏忠賢令王之臣棄錦州，王之臣滿桂被質(zhì)疑為閹黨罷免，閻鳴泰被下獄。不過不久后滿桂又起復(fù)為宣大總兵。

崇禎元年六月毛文龍擒后金使者闊科押送北京，凌遲處死。

八月，袁崇煥到北京，動議“五年復(fù)遼”。旋到寧遠(yuǎn)，平定寧遠(yuǎn)兵變，懲處首惡左良玉等人。重新收復(fù)錦州等地。

十二月滿桂報告東蒙古喀喇沁部和后金結(jié)盟。

崇禎二年二月袁崇煥宣布運(yùn)糧寧遠(yuǎn)，毛文龍斷糧。三月毛文龍上書抗議海禁表示東江之所以能勉強(qiáng)維持至今全靠海商，求解職由登州入京服罪訴冤，被崇禎大罵一頓。

袁崇煥答毛健羽作復(fù)遼五策。

袁崇煥高臺堡賣糧給喀喇沁部。北京輿論一片嘩然，崇禎三令五申令其停止賣糧，袁崇煥伙同兵部尚書王恰辯稱喀喇沁部絕無二心云云。崇禎要求袁崇煥計口給糧，袁崇煥不聽。

四月袁崇煥提議和毛文龍面議，并將十船糧食送給毛文龍，毛文龍動心，同意會面。

兵部尚書王恰反悔稱不能資助喀喇沁部。崇禎正式下旨只許袁崇煥對喀喇沁部計口給糧。

五月和毛文龍會面時，第一天袁崇煥詐稱后金起兵侵略河西，派自己親兵假意去河西協(xié)防。第二天又詐稱有后金侵略河?xùn)|，讓毛文龍起兵協(xié)防，毛文龍不察，派身邊的三千軍隊出征，身邊保衛(wèi)力量極度空虛。

第三天袁崇煥讓自己親兵埋伏趁其不備擒住毛文龍，毛文龍大呼我無罪，門外毛文龍部下群情洶涌，袁崇煥道我奉旨?xì)⒛悖谑潜娊缘皖^無語，毛文龍默然：我負(fù)朝廷多矣。遂引頸就戮。

袁崇煥將東江軍隊分四協(xié)，分屬毛承祿，陳繼盛，降將劉愛塔，徐敷奏。后己巳之變，劉愛塔和徐敷奏帶兵馳援北京，劉愛塔中流矢戰(zhàn)死，弟弟劉興賢叛逃歸金。徐敷奏戰(zhàn)后因袁崇煥謀逆案逃竄津門被朝廷捉拿，由孫承宗按誘畔東江，殺掠海商等罪名處死。

九月袁崇煥清點遼鎮(zhèn)部隊共計十萬八千人，馬九萬匹（后馬匹查缺二萬三，還預(yù)支取馬乾無數(shù)，這就是“空月馬乾”案）

（前文馬價銀亦虧空，亦該袁崇煥償還，不知如何償還虧空）

十月己巳之變爆發(fā)，十一月初一袁崇煥接到情報率兩萬人勤王。

十日到薊州城，十二日后金過城五里扎營，皇太極修書一封投入城中，當(dāng)晚潛越成功。滿桂恰駐軍到順義被后金奇襲殺敗。（崇禎聞后金潛越大怒，將兵部尚書王恰下獄）十三日欲戰(zhàn)而無可戰(zhàn)一天，十四日探明敵情后拒絕下屬建議的追擊后金，反而繞出河西務(wù)。

十七日袁崇煥部九千人成功繞到北京城下，不動不告。北京因此震動，城中人有大膽者名沈自征潛入軍營問：督師欲反乎？今人皆疑你謀逆，稍不盡心，天下人爭食汝肉矣！袁崇煥諾諾。

孫承宗也派人如此訓(xùn)斥袁崇煥。

于是在多方調(diào)節(jié)下，袁崇煥二十日進(jìn)京見崇禎，崇禎賜冠帶安撫之。

這天后金這才姍姍來遲，興兵攻德勝門，滿桂敗績。

同日發(fā)生廣渠門之戰(zhàn)：數(shù)百后金軍隊突入嚴(yán)陣以待的袁崇煥軍隊中大掠一陣，天色昏暗后安然退去。袁軍派人追擊一陣，報稱廣渠門大捷。

第二天袁崇煥撤往左安門，見后金軍路過，于是遠(yuǎn)遠(yuǎn)炮擊后金軍。（也就是若為左安門之戰(zhàn)，滿州方并無此事記載，包括所謂的南海子大捷）

皇太極縱一御馬監(jiān)太監(jiān)為自己投書一封。兩個太監(jiān)入城后遞交皇太極的書信并在大營中的所見所聞，指出袁崇煥和后金使者往來親密。

崇禎看信大驚，因為內(nèi)容和袁崇煥日前入見說的一模一樣，于是召見朝臣商議，質(zhì)疑為何袁崇煥一直按兵不動。

十一月三十日崇禎再次召見并滿桂祖大壽等人，滿桂出血衣控告袁崇煥謀殺，崇禎亦數(shù)問，袁崇煥張口結(jié)舌皆不能辯，于是崇禎將袁崇煥下獄。

崇禎三年八月，袁崇煥被凌遲處死。

時朝廷首輔韓廣為袁崇煥座師，引咎辭職；次輔錢龍錫亦因此被牽累。

錢龍錫奏辯，言：“崇煥陛見時，臣見其貌寢，退謂同官‘此人恐不勝任’。及崇煥以五年復(fù)遼自詭，往詢方略。因此被牽連入逆案。

帝召諸臣于平臺，置崇煥重辟。責(zé)龍錫私結(jié)邊臣，蒙隱不舉，令廷臣議罪。是日，群議于中府，謂：“斬帥雖龍錫啟端，而兩書有‘處置慎重’語，意不在擅殺，殺文龍乃崇煥過舉。至講款，倡自崇煥，龍錫始答以‘酌量’，繼答以‘天子神武，不宜講款’。然軍國大事，私自商度，不抗疏發(fā)奸，何所逃罪？”帝遂遣使逮之。十二月逮至，下獄。復(fù)疏辯，悉封上崇煥原書及所答書，帝不省。