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病毒分離

2023-03-21 19:00 作者:大家好我是常明謙  | 我要投稿

1.6 ?病料處理

采集病豬的小腸,剪碎后轉(zhuǎn)入研磨器中,加入DMEM基礎(chǔ)培養(yǎng)液,研磨成10%的組織懸液,反復(fù)凍融3次,3000r/min離心10min后取上清,用0.22μm微孔濾膜過濾除菌后,置-70℃保存?zhèn)溆谩?/span>

病豬的糞便用DMEM基礎(chǔ)培養(yǎng)液作10倍稀釋后加入雙抗(終濃度1000IU/ml青霉素、1000μg/ml鏈霉素)于4℃作用12h,離心取上清,用0.22μm微孔濾膜過濾除菌后,置-70℃保存?zhèn)溆谩?/span>

1.7 ?RT-PCR擴增PEDV M基因

1.7.1 ?RNA的提取

取100mg組織樣品用剪刀剪碎后,置于研磨器中,加入2ml的DMEM培養(yǎng)基,研磨至組織呈勻漿狀,置-70℃凍融2~3次后,5000 r/min離心10 min后,取上清200μl至1.5 ml離心管,每管加入1 ml RNA-Solv??Reagent RNA Isolation Solvent,顛倒混勻,室溫靜置5~10min。每管加入200 μl氯仿,渦旋15 sec,嚴(yán)格冰浴10 min,4℃ 12,000r/min離心10min。取80%的上清轉(zhuǎn)至新的1.5 ml離心管,加入500 μl異丙醇,混勻,室溫靜置10min,室溫12,000r/min離心10min。棄上清,每管加入1.2ml無水乙醇和300μl DEPC水,輕微渦旋,7500r/min離心5min,棄上清,用槍頭吸干殘留水份,風(fēng)干5~10min,最后加入20μl DEPC水溶解。紫外分光光度計測定A260及A280值,確定樣品RNA含量及純度,-70℃保存?zhèn)溆谩?/span>

1.7.2 ?反轉(zhuǎn)錄合成cDNA

反轉(zhuǎn)錄體系按照表1加入。

表1 ?反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系

10×RT Buffer

1.0 μl

dNTPs (10mM)

1.0 μl

MgCl2

2.0μl

RNase Inhibitor

0.25 μl

ReverTra Aceò

0.5 μl

Oligo(dT)20

1.0 μl

RNA模板

適量體積(0.2μg)

RNase Free H2O

加至終體積10.0 μl

反轉(zhuǎn)錄的反應(yīng)程序為:42.0℃反轉(zhuǎn)錄30min,95.0℃ 5min,進行反轉(zhuǎn)錄。獲得的cDNA用作PCR擴增的模板。

1.7.3 ?PCR擴增

根據(jù)GenBank 登錄的PEDV(No.JQ282909)基因組序列設(shè)計一對特異性引物,擴增PEDV M基因(表2),引物序列為:

上游引物P1:5’-TTCCCGTTGATGAGGTGAT-3’

下游引物P2:5’-AAGCATTGACTGAACGACC-3’

擴增片段大小為552bp,引物由上海生工生物工程有限公司合成。

表2 ?PCR反應(yīng)體系

10×Ex Buffer

2.5 μl

Ex Taq

0.125 μl

上游引物

0.75μl

下游引物

0.75μl

cDNA模板

5μl

dd H2O

加至終體積25.0 μl

反應(yīng)條件為:94℃變性5 min后進入循環(huán),循環(huán)參數(shù)為:94℃ 1min,54℃ 1min,72℃ 1min;35個循環(huán)后72℃延伸10min。

取擴增產(chǎn)物在0.8%瓊脂糖凝膠上進行電泳,觀察結(jié)果并拍照。

1.8 ?病毒分離

取經(jīng)RT-PCR檢測為PEDV陽性的病料懸液1ml接種已長成單層的Vero細(xì)胞(接種前倒掉細(xì)胞培養(yǎng)液,用PBS洗2次),并加入1ml的細(xì)胞維持液(含10μg/ml胰酶的無血清DMEM培養(yǎng)液),37℃吸附1h,吸棄接種物,補加5ml的細(xì)胞維持液,繼續(xù)培養(yǎng),每天觀察,如出現(xiàn)細(xì)胞病變即及時收毒,如無細(xì)胞病變出現(xiàn),則在培養(yǎng)72h時收毒,并繼續(xù)盲傳,盲傳7代后仍無病變者棄去不要。

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