?? ? ? ? ?病毒傳開宗明義第一章，病毒進(jìn)化史。

? ? ? ? ?首先，讓我們認(rèn)識一下病毒(Virus)。病毒是最原始的生命體，早在沒有細(xì)胞之前就有病毒存在，那時的病毒還只限于蛋白質(zhì)和核酸這類簡單化學(xué)物質(zhì)，沒有表現(xiàn)出病毒的寄生特征，當(dāng)一部分病毒進(jìn)化成為細(xì)胞——既細(xì)胞體生物出現(xiàn)之后，個別這種蛋白質(zhì)和核酸或它們的復(fù)合體表現(xiàn)出寄生性，然后進(jìn)化成現(xiàn)代病毒。

? ? ? ?讓我們從原始的始祖病毒開始我們神圣的進(jìn)化之路，終點是如今的大千世界！

這是病毒的進(jìn)化史，理由如下：

1，類病毒與德爾塔病毒(以下簡稱丁肝病毒)繁殖方式一樣，只是丁肝病毒多了一個德爾塔抗原。(蛇丁肝病毒多了一個疑似德爾塔棘突蛋白)

2，丁肝病毒的RNA是反義RNA，繁殖方式與反義RNA病毒一樣(丁肝病毒：轉(zhuǎn)錄——德爾塔抗原催化RNA復(fù)制；反義RNA病毒：轉(zhuǎn)錄——基質(zhì)蛋白催化RNA復(fù)制)。

3，丁肝病毒生活需要細(xì)胞的DNA依賴的RNA聚合酶(主要是RNA聚合酶II——轉(zhuǎn)錄mRNA的RNA聚合酶)進(jìn)行RNA復(fù)制(可見細(xì)胞的RNA聚合酶祖先是RNA依賴的RNA聚合酶)。

4，正義RNA病毒、反義RNA病毒的RNA依賴的RNA聚合酶與逆轉(zhuǎn)錄病毒的逆轉(zhuǎn)錄酶擁有共同結(jié)構(gòu)。

5，正義RNA病毒RNA復(fù)制時首先形成雙鏈RNA，然后雙鏈RNA轉(zhuǎn)錄形成正義RNA；雙鏈RNA病毒首先進(jìn)行轉(zhuǎn)錄形成正義RNA，最終正義RNA轉(zhuǎn)錄成為雙鏈RNA，可謂是“師出同門”。

6，正義RNA病毒復(fù)制時在細(xì)胞內(nèi)形成小體，雙鏈RNA病毒可直接作為小體。

7，反義RNA病毒復(fù)制時不形成雙鏈RNA，與正義RNA病毒完全不同。

8，人體內(nèi)有內(nèi)源性博爾納病毒基因(EBLN-1/2/3P)，而博爾納病毒正是反義RNA病毒，可見反義RNA病毒可以整合在宿主DNA基因組中，這與逆轉(zhuǎn)錄病毒是一樣的(可見，反義RNA病毒是逆轉(zhuǎn)錄病毒的祖先)。

9，反義RNA病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒、擬逆轉(zhuǎn)錄病毒、單鏈DNA病毒與雙鏈DNA病毒均可以通過內(nèi)含子剪輯RNA來改變外顯子的表達(dá)，這與細(xì)胞是一樣的

10，逆轉(zhuǎn)錄病毒中的泡沫病毒有20%的概率會形成擁有雙鏈DNA的病毒，這種病毒的生活方式與乙肝病毒一樣(泡沫病毒中擁有雙鏈DNA的病毒遺傳信息流與乙肝病毒均為DNA→RNA→DNA，泡沫病毒中擁有雙正義RNA的病毒遺傳信息流為RNA→DNA→RNA)。

11，乙肝病毒（DR1與DR2）、花椰菜花葉病毒（19S與35S）的DNA上均有兩個正向重復(fù)序列（direct repeat），用以mRNA轉(zhuǎn)錄、pgRNA合成與病毒DNA合成。逆轉(zhuǎn)錄病毒的DNA上也有兩個重復(fù)序列（long terminal repeat），用以mRNA轉(zhuǎn)錄、正義RNA合成與病毒DNA合成。

12，無論是以HIV為代表的逆轉(zhuǎn)錄病毒(Retrovirus)，還是以乙肝病毒為代表的擬逆轉(zhuǎn)錄病毒(Pararetrovirus)，它們合成雙鏈DNA的逆轉(zhuǎn)錄過程中，均會形成單鏈DNA，而且單鏈DNA也含有重復(fù)序列。而腺相關(guān)病毒這種無害的人細(xì)小病毒的單鏈DNA也含有重復(fù)序列(Inverted Repeat)。

13，無論是擁有線型單鏈DNA的腺相關(guān)病毒，還是擁有環(huán)狀單鏈DNA的M13噬菌體，它們在進(jìn)行DNA復(fù)制時均會形成雙鏈DNA。而逆轉(zhuǎn)錄病毒與擬逆轉(zhuǎn)錄病毒也會形成雙鏈DNA。

14，人體細(xì)胞內(nèi)的DNA很多都是逆轉(zhuǎn)錄病毒(少數(shù)為反義RNA病毒)整合而來。

15，反義RNA病毒的RNA依賴的RNA聚合酶與逆轉(zhuǎn)錄酶、DNA聚合酶和RNA聚合酶結(jié)構(gòu)相似

16，非洲豬瘟病毒與原始細(xì)胞的DNA聚合酶均缺失外切酶修復(fù)校正功能，由此可知，原始細(xì)胞由原始雙鏈DNA病毒進(jìn)化而來。

17，原始DNA病毒的DNA聚合酶開始沒有外切酶修復(fù)校正功能，修復(fù)校正功能是后期進(jìn)化而來。而原始細(xì)胞的DNA細(xì)胞的DNA聚合酶也是如此。

18，最早出現(xiàn)的外切酶修復(fù)校正功能為3'→5'外切酶，最晚出現(xiàn)的外切酶修復(fù)校正功能為5'→3'外切酶。

19，真核細(xì)胞的染色體與現(xiàn)代雙鏈DNA病毒的DNA均為線型，而細(xì)胞的末端為由重復(fù)序列組成的端粒，現(xiàn)代雙鏈DNA病毒DNA的末端為重復(fù)序列。

20，真核細(xì)胞的端粒上有端粒酶用以合成替換引物的DNA，腺病毒的DNA末端有磷蛋白作為DNA復(fù)制的引物。

以上僅為個人猜想。