項(xiàng)目文章丨利用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序等揭示伴有自殺行為的抑郁癥的潛在治療新靶點(diǎn)
2023年1月11日,南京醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院劉妍教授課題組和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院郭興教授課題組合作在?EMBO Molecular Medicine(IF:14.260)雜志上發(fā)表題為“Depressive patient-derived GABA interneurons reveal abnormal neural activity associated with HTR2C”封面論文。
研究報道了伴有自殺行為的重性抑郁癥(sMDD)患者來源的 GABA 能中間神經(jīng)元(GINs)和腹側(cè)前腦類器官存在神經(jīng)元形態(tài)學(xué)豐富度、電生理活性異常以及鈣活性降低的表型,而通過干預(yù) HTR2C 的表達(dá)可挽救其異常的神經(jīng)活性。該發(fā)現(xiàn)為 sMDD 的機(jī)制研究以及藥物篩選提供了一個動態(tài)的、方便進(jìn)行基因調(diào)控的人源性細(xì)胞模型,揭示了 sMDD 病人在細(xì)胞層面的異常病理表型,并為將來的靶點(diǎn)藥物開發(fā)和診斷治療提供了依據(jù)。
本研究中 Chromium 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序由博奧晶典提供。

【發(fā)表期刊】EMBO Molecular Medicine
【影響因子】14.260
【發(fā)表時間】2023年1月11日
【發(fā)表單位】南京醫(yī)科大學(xué)
研究背景
伴有自殺行為的重度抑郁癥(sMDD)是一種嚴(yán)重的情緒障礙,但由于缺少動態(tài)人源性模型,所以 sMDD 產(chǎn)生機(jī)制鮮有報道。而利用攜帶患者遺傳信息的誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSCs)分化的神經(jīng)元和類器官進(jìn)行研究,可能會為揭示 sMDD 的發(fā)病機(jī)制及藥物研發(fā)帶來新的希望。
研究路線

主要結(jié)果
1. sMDD 衍生的 GINs 顯示出異常的病理表型
研究人員選擇 5 名自殺未遂的 sMDD 患者(sMDD 組)和 5 名健康對照(CTRL 組)的外周血細(xì)胞重新編程為 iPSCs,并分化為 GABA 能中間神經(jīng)元(GINs)。分析兩組 GINs,結(jié)果發(fā)現(xiàn) sMDD 來源的 GINs 的神經(jīng)元形態(tài)和 GINs 亞型均表現(xiàn)異常,而且表現(xiàn)出異常過度興奮的電生理信號及異常低的鈣信號。

2. sMDD 衍生的 GIN 中?HTR2C?的表達(dá)降低
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果發(fā)現(xiàn)了 5 種主要細(xì)胞類型,包括循環(huán)細(xì)胞(CyC)、神經(jīng)干細(xì)胞、腹側(cè)神經(jīng)祖細(xì)胞(vNPC)、早期中間神經(jīng)元(eIN)和成熟中間神經(jīng)元(mIN)。接下來對 CTRL 和 sMDD 樣本進(jìn)行差異表達(dá)分析。sMDD 組中差異表達(dá)的基因與 MDD 的相關(guān)性最大。GSEA 揭示了 sMDD GIN 簇中改變的生物過程和分子功能。GABA 能神經(jīng)元分化和鉀通道活性項(xiàng)上調(diào),而高電壓門控鈣通道活性項(xiàng)下調(diào),表明 sMDD GINs 中鈣通道功能發(fā)生改變。Bulk RNA-seq 結(jié)果顯示兩組之間有 244 個 DEG,對 DEG 進(jìn)行功能富集分析發(fā)現(xiàn)?HTR2C?包含在許多途徑中。通過組合 DrugBank 中的 DEG 及其靶藥物以形成基因-藥物網(wǎng)絡(luò),并根據(jù)其與藥物誘導(dǎo)表達(dá)的接近程度對藥物的潛在靶點(diǎn)進(jìn)行排序,發(fā)現(xiàn)?HTR2C?是 DEG 中最豐富的基因。

3.?HTR2C 過表達(dá)可部分逆轉(zhuǎn) sMDD GINs 的缺陷
為了進(jìn)一步確認(rèn) HTR2C 在介導(dǎo) sMDD 缺鈣中的作用,并評估其表型是否具有重復(fù)性,將 shRNA 或 OE 慢病毒感染到對照組腹前腦類器官中,然后將其消化成單個細(xì)胞進(jìn)行粘附培養(yǎng),并對貼壁神經(jīng)元進(jìn)行了成像分析。觀察了 GFP+?神經(jīng)元上的鈣信號,并使用 KCl 進(jìn)行去極化刺激。結(jié)果表明,KD 病毒組神經(jīng)元的鈣信號顯著低于載體病毒組,表明 CTRL 組 HTR2C 的下調(diào)顯示出與鈣信號降低相關(guān)的 sMDD 病理表型。而 OE 組缺陷的功能被顯著逆轉(zhuǎn),提示 HTR2C 過表達(dá)可部分逆轉(zhuǎn) sMDD GINs 的缺陷。

4.sMDD 相關(guān)的神經(jīng)缺陷可以通過 5-HT2CR 激動劑 Trzd 的過度表達(dá)來修復(fù)
接下來科研人員選擇 3 種 FDA 批準(zhǔn)的 5-HT2CR 激動劑:PNU、Ro 和 Trzd 來測試它們對 sMDD GIN 中鈣信號和電生理的影響。結(jié)果顯示 10?μM Trzd 可顯著增加鈣信號峰值。因此,研究人員選擇了它進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證,結(jié)果顯示 10 μM Trzd 治療可以逆轉(zhuǎn) sMDD GINs 和腹側(cè)前腦類器官中的異常鈣信號傳導(dǎo)和過度活動。并對 Tred 治療后的 GINs 進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序,證實(shí) Trez 治療部分逆轉(zhuǎn)了 sMDD GINs 的缺陷。

全文結(jié)論及研究意義

01
sMDD 衍生的 GABA 能中間神經(jīng)元(GINs)顯示出改變的神經(jīng)元形態(tài)和異常的 GIN 亞型;
02
sMDD 衍生的 GINs 表現(xiàn)出異常的電生理超興奮性和降低的鈣信號;
03
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組及 bulk 轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果顯示在 sMDD 衍生的 GIN 中 HTR2C 的表達(dá)降低;
04
sMDD 相關(guān)的神經(jīng)缺陷可以通過 HTR2C 和 5-HT2CR 激動劑 Trzd 的過度表達(dá)來修復(fù)。
研究結(jié)論
總之該研究為 sMDD 的機(jī)制研究以及藥物篩選提供了一個動態(tài)的、方便進(jìn)行基因調(diào)控的人源性細(xì)胞模型,揭示了 sMDD 病人在細(xì)胞層面的異常病理表型,并提示 5-HT2C 可能是重度抑郁癥的潛在藥物靶點(diǎn)。
參考文獻(xiàn)
Lu K, Hong Y, Tao M, Shen L, Zheng Z, Fang K, Yuan F, Xu M, Wang C, Zhu D, Guo X, Liu Y. Depressive patient-derived GABA interneurons reveal abnormal neural activity associated with HTR2C.?EMBO Mol Med.?2023 Jan 11;15(1):e16364.