?質(zhì)量評估Fastqc, multiqc

一般公司提交的是初步質(zhì)控處理過的clean data，最好把raw data一并要過來。一般公司會對數(shù)據(jù)進行基本的質(zhì)控，但我們還要再確認一次，為什么呢？個人遇到的情況包括以下幾種：

• 部分樣本的接頭可能去得不完全

• 此外，為了數(shù)據(jù)量好看（更大），一般質(zhì)量過得去的情況下，公司不會對reads前后端測序質(zhì)量較低的堿基進行剪切，需要自己根據(jù)情況進行處理

• 有的公司對不同樣本處理不一致，每個樣本的clean data中reads長度可能