時空日報 | 心臟適應壓力過程中MyD88對降低心臟炎癥至關重要

大家好,歡迎觀看《時空日報》第23期。本期追蹤到時空/單細胞組學相關研究文章共計3篇。以下是應用時空云平臺STOmics Cloud的StereoCopilot模塊生成的文章概要,并輔以人工審核,供了解參考。

1、T細胞MyD88是通過調節(jié)T細胞活化來調控心臟纖維化的新調節(jié)因子
T-cell MyD88 is a novel regulator of cardiac fibrosis through modulation of T-cell activation
Circulation Research; IF: 20.100; DOI: 10.1161/CIRCRESAHA.123.323030
內容概要:對T細胞中缺乏MyD88的小鼠進行主動脈縮窄并分析其重塑、收縮功能、存活和T細胞活化情況,結合scRNA-seq等分析,發(fā)現(xiàn)MyD88通過TCR依賴性信號調節(jié)T細胞的激活和存活,從而限制T細胞的活化,減輕心臟炎癥反應;缺乏T細胞MyD88會導致心臟T細胞浸潤和纖維化的增加。這一發(fā)現(xiàn)為心臟適應應激過程中調節(jié)心臟炎癥反應提供了新思路。
2、背外側前額葉皮層的單核轉錄組學分析:包括17q21.31位點在內的神經元基因表達在PTSD應激反應中的機制作用
Single-nucleus transcriptome profiling of dorsolateral prefrontal cortex: Mechanistic roles for neuronal gene expression, including the 17q21.31 locus, in PTSD stress response
The American Journal of Psychiatry; IF: 17.700; DOI: 10.1176/appi.ajp.20220478
內容概要:通過scRNA-seq探究創(chuàng)傷后應激障礙(posttraumatic stress disorder,PTSD)和重度抑郁癥(major depressive disorder,MDD)患者的背外側前額葉皮層( dorsolateral prefrontal cortex,DLPFC)細胞類型特異性的轉錄組病理學,揭示了PTSD和MDD中大腦應激反應的細胞類型特異性機制,強調了檢測細胞類型特異性基因表達的重要性,并指出了有希望的新生物標志物和治療靶點。
3、乙二醛為scRNA-seq分析的替代固定劑
Glyoxal as alternative fixative for single cell RNA sequencing
G3?(Bethesda, Md.); IF: 2.600; DOI: 10.1093/g3journal/jkad160
內容概要:該研究探討了scRNA-seq中細胞固定的問題,提出了使用乙二醛作為細胞固定劑的方案。通過Drop-seq方法,在乙二醛固定的果蠅細胞和人類細胞中檢測到了高水平的轉錄本和基因。同時,乙二醛固定的樣本與未固定的樣本之間的基因表達數(shù)據(jù)高度相關,表明該固定方案不會引起基因表達的顯著變化,從而保留了轉錄組的完整性。因此,乙二醛是一種適合于果蠅和其他物種的細胞固定劑,可用于高質量的scRNA-seq應用。
《時空日報》是華大時空基于時空云平臺STOmics Cloud的StereoCopilot功能板塊,推出的聚焦于時空組學領域學術前沿的欄目。該欄目以實時、精準追蹤時空組學前沿為目標,共享最新時空知識,助力生命科學和臨床醫(yī)學發(fā)展。