要設置限制用戶只能通過域名訪問網(wǎng)站，需要進行以下步驟：

1. 配置DNS解析

首先需要在域名服務商那里進行DNS解析配置，將要訪問網(wǎng)站的域名與服務器IP地址綁定。這樣，當用戶通過瀏覽器訪問網(wǎng)站時，DNS解析會將域名解析為服務器IP地址，然后再與服務器建立連接。

2. 配置虛擬主機

在服務器上通過配置虛擬主機，將要訪問的網(wǎng)站與特定的域名進行綁定。這樣，當用戶通過域名訪問網(wǎng)站時，服務器會根據(jù)域名解析的結果，找到相應的虛擬主機，從而實現(xiàn)對網(wǎng)站的訪問。

3. 禁止IP地址訪問

為了達到限制用戶只能通過域名訪問網(wǎng)站的目的，需要禁止直接使用IP地址訪問網(wǎng)站?？梢栽诜掌魃显O置相應的規(guī)則，如通過.htaccess文件中添加deny from all的方式，禁止所有IP地址的訪問。

4. 配置SSL證書

為了保障網(wǎng)站的安全性，需要配置SSL證書，實現(xiàn)HTTPS協(xié)議的加密傳輸。通過SSL證書的配置，只有在用戶輸入正確的域名時，才能正確建立加密連接，從而達到限制用戶只能通過域名訪問網(wǎng)站的目的。

總結一下，設置限制用戶只能通過域名訪問網(wǎng)站需要配置DNS解析、虛擬主機、禁止IP地址訪問、以及配置SSL證書等一系列的操作。這些操作可以有效地保護網(wǎng)站的安全性，同時限制用戶只能通過域名訪問網(wǎng)站，防止非法訪問和攻擊。