做慢病毒感染前一定要先解決的 6 個(gè)問(wèn)題!實(shí)驗(yàn)才不白做!
慢病毒載體是我們實(shí)驗(yàn)室常用的基因表達(dá)載體,遇到問(wèn)題首先檢查細(xì)胞狀態(tài)如何?可能感染復(fù)數(shù) MOI 過(guò)高,需要摸索最適合的 MOI;也可以添加助轉(zhuǎn)染試劑 polybrene 增加感染效率;實(shí)在不行,查查文獻(xiàn),看看我們的細(xì)胞是否適合用慢病毒感染?
細(xì)胞轉(zhuǎn)染表達(dá)目的基因是實(shí)驗(yàn)室的一項(xiàng)基礎(chǔ)技術(shù),但導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)失敗的原因卻有很多。目前針對(duì)基因表達(dá)的載體一般分為病毒和非病毒載體,病毒載體由于其高轉(zhuǎn)導(dǎo)效率、易篩選穩(wěn)定細(xì)胞株、大規(guī)模的生產(chǎn)能力使其成為理想的基因表達(dá)載體。其中腺相關(guān)病毒(Adeno-associated virus, AAV)載體、慢病毒(Lentivirus)載體和腺病毒載體(Adenovirus)是最常用的病毒載體。目前,慢病毒是產(chǎn)業(yè)應(yīng)用相對(duì)成熟的病毒載體類(lèi)型,尤其是在免疫細(xì)胞治療,腫瘤研究領(lǐng)域起到了關(guān)鍵性的作用。
隨著科研人員對(duì)慢病毒的廣泛使用,越來(lái)越多的操作難題也顯露了出來(lái),下面給大家整理一些慢病毒操作中的常見(jiàn)問(wèn)題及解答:
Q:用于慢病毒感染的細(xì)胞接種量多少才合適呢?
A:以在感染 3 天左右長(zhǎng)滿(mǎn)培養(yǎng)皿底部為宜,不同細(xì)胞根據(jù)其生長(zhǎng)速度靈活調(diào)整接種量
Q:慢病毒感染后細(xì)胞狀態(tài)異常?
A:出現(xiàn)這種情況時(shí),有幾個(gè)主要原因:
1)首先,確定是否有支原體或者細(xì)菌污染
2)可能是 MOI(感染復(fù)數(shù))過(guò)高,需要摸索尋找最適合的 MOI
3)同時(shí)考慮目的細(xì)胞可能比較敏感,更換其它細(xì)胞感染確定病毒是否有問(wèn)題
4)如果以上都排除后細(xì)胞狀態(tài)仍然不好,嘗試增加血清含量,觀察細(xì)胞狀態(tài)是否好轉(zhuǎn)
Q:慢病毒感染效率低怎么辦,如何提高慢病毒感染效率?
A:慢毒感染效率低,主要需要考慮的問(wèn)題有:
1)細(xì)胞是否適合用慢病毒進(jìn)行感染?(慢病毒適用于大部分細(xì)胞系,例如肝細(xì)胞、心肌細(xì)胞、腫瘤細(xì)胞等,但也有一些細(xì)胞不適合用慢病毒感染,可能更適合用腺病毒,可查閱文獻(xiàn),或咨詢(xún)漢恒)
2)慢病毒是否進(jìn)行了正確的存儲(chǔ)和稀釋?zhuān)咳绻《敬鎯?chǔ)不當(dāng)或反復(fù)凍融會(huì)降低病毒活性,從而導(dǎo)致感染效率降低
3)感染操作問(wèn)題:首先排查 MOI 是否合適;其次可以使用漢恒生物推薦的 1/2 體積感染法來(lái)增加感染效率;最后感染換液(一般 24 h)及觀察的時(shí)間是否合適
4)對(duì)于一些難感染細(xì)胞的感染方法:例如懸浮細(xì)胞可使用平角離心轉(zhuǎn)染法,其他一些較難感染的細(xì)胞可進(jìn)行二次感染
5)可以添加助轉(zhuǎn)染試劑 polybrene 增加感染效率
Q:慢病毒感染細(xì)胞熒光表達(dá)較弱?
A:熒光蛋白的亮度與啟動(dòng)子、表達(dá)方式和連接原件等有關(guān):
1)不同啟動(dòng)子誘導(dǎo)熒光蛋白表達(dá)的強(qiáng)弱不同,如 UBC 相對(duì)于 EF1α、CAG、CMV 等強(qiáng)啟動(dòng)子表達(dá)較弱
2)融合或非融合表達(dá)與熒光強(qiáng)度也有很大關(guān)系,融合表達(dá)時(shí)熒光蛋白可能出現(xiàn)錯(cuò)誤折疊等現(xiàn)象,導(dǎo)致檢測(cè)不到熒光信號(hào)或熒光較弱;非融合表達(dá)時(shí)一般選擇連接肽作為連接原件,如 2A 肽或 IRES 將 ORF 分隔開(kāi)
3)帶熒光的慢病毒感染細(xì)胞后,熒光的強(qiáng)度取決于病毒進(jìn)入到細(xì)胞的顆粒數(shù)、細(xì)胞狀態(tài)、細(xì)胞類(lèi)型、觀察時(shí)間等因素,熒光表達(dá)的強(qiáng)度與目的細(xì)胞感染病毒的顆粒數(shù)正相關(guān),一般感染細(xì)胞后 72 h 觀察熒光強(qiáng)度最佳,而增殖較慢的細(xì)胞可以適當(dāng)延長(zhǎng)時(shí)間
4)也可能會(huì)遇到過(guò)表達(dá)的慢病毒比對(duì)照的熒光要暗的情況,這主要是因?yàn)榛虻牟迦?,?huì)影響位于下游的熒光蛋白表達(dá)
Q:在篩選穩(wěn)定細(xì)胞株時(shí),為什么細(xì)胞熒光正常,藥物篩選后大量熒光陽(yáng)性細(xì)胞死亡?
A:出現(xiàn)這種情況時(shí),有幾個(gè)主要的原因:
1)抗性基因由弱啟動(dòng)子啟動(dòng)表達(dá)較弱
2)抗性基因表達(dá)在 IRES 之后
3)使用藥物劑量過(guò)高
Q:為什么慢病毒穩(wěn)定株會(huì)出現(xiàn)表達(dá)或者干擾效果丟失?
A:慢病毒是 RNA 病毒,感染細(xì)胞后會(huì)整合進(jìn)細(xì)胞基因組,因此理論上該基因一直都會(huì)表達(dá)。?但并不意味著穩(wěn)定株一直傳代是一個(gè)好的選擇
因?yàn)橐环矫?,?xì)胞傳代次數(shù)增加可能使得該細(xì)胞干擾或者過(guò)表達(dá)的基因受到代償機(jī)制的調(diào)節(jié),導(dǎo)致多次傳代后干擾和過(guò)表達(dá)效果下降,另外一方面,細(xì)胞本身隨著傳代增加其理化性質(zhì)會(huì)逐漸變化,比如原代細(xì)胞隨著傳代次數(shù)增加細(xì)胞逐漸老化,基因表達(dá)譜變化本身就會(huì)很明顯,又比如永生化細(xì)胞或者腫瘤細(xì)胞隨著傳代次數(shù)增加其積累突變也是增加的,這也會(huì)導(dǎo)致其表達(dá)譜變化。因此建議,穩(wěn)定株構(gòu)建好之后可以多凍存代數(shù)較早的細(xì)胞,每次實(shí)驗(yàn)盡量使用代數(shù)靠前的細(xì)胞