最美情侣中文字幕电影,在线麻豆精品传媒,在线网站高清黄,久久黄色视频

歡迎光臨散文網 會員登陸 & 注冊

文獻晶體數據改進示例13(特戊酸無序)

2023-10-19 09:04 作者:DJ_Tokyo  | 我要投稿

案例來源:

Dalton Trans.

2023

,

52

, 175–184. DOI:10.1039/d2dt03492a CCDC:2211477 ? 圖形用戶界面:Olex2

[1]

(版本:Olex2-1.5) 精修程序:SHELXL

[2]

(版本:SHELXL-2019/2) CIF文件下載:CCDC

[3]

官網 ? 根據CCDC號從CCDC官網下到2211477.cif文件,用Olex2打開并提取其hkl和res文件查看,如

圖1

所示,特戊酸中叔丁基做了無序拆分處理,但是其占有率固定為0.5,而電子云密度圖看起來也很有問題。

▲圖1 CCDC 2211477數據概覽

? 引入自由變量,精修至收斂后,如

圖2

所示,表明該叔丁基是一個0.14:0.86的無序比例,而不是原來的0.5:0.5。

▲圖2 引入自由變量精修結果

? 結構中另一個特戊酸上的叔丁基用PART 1做了分組,但是沒有做無序拆分,如

圖3

所示,可能是一個未完成狀態(tài)。

▲圖3 分組但未做無序拆分的叔丁基

? 對該叔丁基做常規(guī)無需拆分,并輔以

SAME指令

SIMU指令

限制,最終結果如

圖4

所示。

▲圖4 CCDC 2211477數據重新處理結果

? 視頻操作演示請參閱:https://www.bilibili.com/video/BV1pz4y1F7Wb ? 結語 通常情況下,無序組分的占有率通過精修自由變量來確定,很少采用直接固定的方式精修,除非有強有力的證據支持,例如元素分析、熱重分析、電荷平衡等,不過這些大多適用于不同物種的共占位無序(如無機化合物中的參雜),游離溶劑(如水等)。像本案例中的構象無序這種的,一般都用自由變量來精修無序占比。(當然,也可以在精修收斂后固定其占有率。) ? 參考文獻 [1] Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H.

OLEX2: A complete structure solution, refinement and analysis program. J. Appl. Cryst.

2009

,

42

, 339–341. [2] (a) Sheldrick, G. M.

SHELXL-2019/2

,

Program for Crystal Structure Refinement

, University of G?ttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history of

SHELX

.

Acta Cryst.

2008

,

A64

, 112–122. (c) Sheldrick, G. M. Crystal structure refinement with

SHELXL

.

Acta Cryst

.

2015

,

C71

, 3–8. (d) Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.; Dittrich, B. Aspherical scattering factors for

SHELXL

– model, implementation and application.

Acta Cryst.

2019

,

A75

, 50–62. [3] (a) Allen, F. H. The Cambridge Structural Database: a quarter of a million crystal structures and rising.

Acta Cryst.

2002

,

B58

, 380–388. (b) Allen, F. H. The Cambridge Structural Database: a quarter of a million crystal structures and rising.

Acta Cryst.

2016

,

B72

, 171–179. ? ?

文獻晶體數據改進示例13(特戊酸無序)的評論 (共 條)

分享到微博請遵守國家法律
玉屏| 铁岭市| 简阳市| 攀枝花市| 盐池县| 舒兰市| 望江县| 阳春市| 革吉县| 长汀县| 昭觉县| 沐川县| 双辽市| 临高县| 宁河县| 祁连县| 洪洞县| 湘西| 中山市| 晋江市| 成武县| 红安县| 抚远县| 如皋市| 团风县| 扎兰屯市| 旌德县| 陇川县| 崇左市| 娱乐| 焦作市| 南城县| 邯郸市| 洪雅县| 神池县| 克拉玛依市| 乌兰察布市| 宁河县| 肇源县| 乌审旗| 琼结县|