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干貨 | 秩和檢驗(yàn)及其兩兩比較的思路與解析

2021-09-14 14:48 作者:JMP數(shù)據(jù)分析  | 我要投稿

在之前的文章中,我們介紹了兩組和多組正態(tài)分布數(shù)據(jù)的組間比較方法。在本文中,我們將要講解的則是用于檢驗(yàn)非正態(tài)分布數(shù)據(jù)差異的統(tǒng)計(jì)方法——秩和檢驗(yàn)。本文將重點(diǎn)介紹以下內(nèi)容:非獨(dú)立樣本秩和檢驗(yàn)、單樣本秩和檢驗(yàn)和配對(duì)樣本秩和檢驗(yàn)。



秩和檢驗(yàn)屬于非參數(shù)檢驗(yàn),非參數(shù)檢驗(yàn)不考慮總體的參數(shù)和總體的分布類型,而是對(duì)樣本所代表的總體的分布和分布位置進(jìn)行假設(shè)檢驗(yàn)。秩和檢驗(yàn)的基本思想是:首先進(jìn)行編秩,然后用秩次代替原始數(shù)據(jù)信息來進(jìn)行檢驗(yàn)。基于秩次檢驗(yàn)各組的平均秩是否相等,如果經(jīng)檢驗(yàn)得各組的平均秩不相等,則可以推論數(shù)據(jù)的分布不同。


本文主要用到兩個(gè)數(shù)據(jù)進(jìn)行講解,一個(gè)是BMI的數(shù)據(jù)(圖1),另一個(gè)是IgA的數(shù)據(jù)(圖2)。

圖1 BMI數(shù)據(jù)
圖2 IgA數(shù)據(jù)



01?獨(dú)立樣本秩和檢驗(yàn)

獨(dú)立樣本的秩和檢驗(yàn)主要有兩種方法:用于兩組比較的Wilcoxon秩和檢驗(yàn)和用于多組比較的Kruskal-Wallis秩和檢驗(yàn),詳見前文(一個(gè)神奇的JMP菜單,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的所有組間比較)。二者的關(guān)系有點(diǎn)類似于t檢驗(yàn)和方差分析的關(guān)系。

兩組比較可以用Wilcoxon秩和檢驗(yàn),也可以用Kruskal-Wallis秩和檢驗(yàn);多組比較只能用Kruskal-Wallis秩和檢驗(yàn)。

兩組和多組獨(dú)立樣本秩和檢驗(yàn)的操作一致,為了避免重復(fù)介紹,本文僅以多組樣本的秩和檢驗(yàn)為例進(jìn)行介紹。

圖1數(shù)據(jù)中,擬比較不同心功能分級(jí)患者的BMI是否存在差異。心功能分級(jí)分為四級(jí),分別用1-4表示,BMI為非正態(tài)分布,因此考慮Kruskal-Wallis秩和檢驗(yàn)。

首先通過點(diǎn)選JMP“分析”→“以X擬合Y”(圖3),進(jìn)入組間差異比較的界面。

圖3 獨(dú)立樣本秩和檢驗(yàn)操作——菜單選擇

本例中BMI為結(jié)果,心功能分級(jí)為分組,因此在對(duì)話框中將BMI放入“Y,響應(yīng)”,將“心功能分級(jí)”放入“X,因子”(圖4)。

圖4 獨(dú)立樣本秩和檢驗(yàn)操作——變量選擇

進(jìn)入結(jié)果界面后,點(diǎn)擊“心功能分級(jí)-BMI”單因子分析旁邊的紅色三角形按鈕,在下拉菜單中選擇“非參數(shù)→Wilcoxon檢驗(yàn)”(圖5)。

圖5 獨(dú)立樣本秩和檢驗(yàn)操作——方法選擇


輸出結(jié)果見圖6. 結(jié)果主要有兩部分:

  • 第一部分是數(shù)據(jù)描述,給出每組的例數(shù)、秩和、平均秩等信息。從得分均值的結(jié)果可知,心功能分級(jí)為4的患者BMI最高。

  • 第二部分為統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)結(jié)果,給出了Kruskal-Wallis秩和檢驗(yàn)的結(jié)果。表明不同心功能分級(jí)患者的BMI差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(卡方=10.4306,P=0.0152)。

    注意:這里給出的統(tǒng)計(jì)量是卡方,是因?yàn)镵ruskal-Wallis秩和檢驗(yàn)的結(jié)果服從卡方分布,并不是說做了卡方檢驗(yàn),大家不要搞混了。

    圖6 獨(dú)立樣本秩和檢驗(yàn)操作——檢驗(yàn)結(jié)果


    請注意,如果進(jìn)行兩組樣本的秩和檢驗(yàn),會(huì)同時(shí)給出Wilcoxon秩和檢驗(yàn)和Kruskal-Wallis秩和檢驗(yàn)兩個(gè)結(jié)果,兩種檢驗(yàn)的結(jié)果一致。

    Kruskal-Wallis秩和檢驗(yàn)結(jié)果顯示有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,通常我們還對(duì)具體哪兩組有差異感興趣,這就需要進(jìn)行組間兩兩比較。

    點(diǎn)擊“心功能分級(jí)-BMI”單因子分析旁邊的紅色三角形按鈕,在下拉菜單中選擇“非參數(shù)”→“非參數(shù)多重比較”→“對(duì)所有對(duì)執(zhí)行Steel-Dwass檢驗(yàn)”,操作見圖7。

    圖7 獨(dú)立樣本秩和檢驗(yàn)操作——兩兩比較操


    輸出結(jié)果見圖8,兩兩比較結(jié)果表明,心功能分級(jí)中的水平2和4(Z=3.089,P=0.0108);水平3和4(Z=3.057,P=0.0120)的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

    圖8 獨(dú)立樣本秩和檢驗(yàn)操作—兩兩比較檢驗(yàn)結(jié)果

    本例分析結(jié)果表明,不同心功能分級(jí)患者的BMI的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。兩兩比較結(jié)果顯示,心功能分級(jí)水平2和4;3和4的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。


    02??單樣本秩和檢驗(yàn)

    基于圖1數(shù)據(jù),探索患者的BMI與健康人群的正常值是否存在差異。假定BMI的正常值為19,BMI為非正態(tài)分布,則進(jìn)行單樣本秩和檢驗(yàn)。

    在既往的文章中我們已經(jīng)為大家講解了正態(tài)分布數(shù)據(jù)如何進(jìn)行單樣本t檢驗(yàn),若數(shù)據(jù)為非正態(tài)分布,應(yīng)如何操作呢?

    單樣本秩和檢驗(yàn)操作的前四步與單樣本t檢驗(yàn)相同:

    ①選擇JMP菜單“分析”→“分布”;

    ②在彈出的對(duì)話框中,將BMI放入“Y,列”;

    ③在結(jié)果界面中點(diǎn)擊BMI左側(cè)的紅色三角形按鈕,在下拉菜單中選擇“檢驗(yàn)均值”;

    ④在彈出的對(duì)話框中的指定假設(shè)均值中填寫19。

    完成以上步驟后,點(diǎn)擊確定則輸出單樣本t檢驗(yàn)結(jié)果。

    若想輸出單樣本秩和檢驗(yàn)結(jié)果,則繼續(xù)在對(duì)話框中勾選“Wilcoxon符號(hào)秩”(圖9)。

    圖9 單樣本秩和檢驗(yàn)操作——方法選擇

    結(jié)果如圖10所示,結(jié)果不僅包含t檢驗(yàn)的結(jié)果,還包含秩和檢驗(yàn)的結(jié)果(“符號(hào)秩”部分的結(jié)果)。結(jié)果顯示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量=3114.500,P<0.0001)。

    圖10 單樣本秩和檢驗(yàn)操作——檢驗(yàn)結(jié)果



    03??配對(duì)樣本的秩和檢驗(yàn)


    本例采用圖2數(shù)據(jù),分析患者化療前后IgA是否有差異。在既往的文章中我們已經(jīng)為大家講解了配對(duì)t檢驗(yàn)的操作步驟。


    配對(duì)秩和檢驗(yàn)的前兩步操作與配對(duì)t檢驗(yàn)相同,操作流程為:

    ①選擇JMP菜單“分析”→“專業(yè)建?!薄芭鋵?duì)”;

    ②在彈出的對(duì)話框中的“Y,配對(duì)響應(yīng)”中先放化療前IgA,再放化療后IgA。
    上述步驟詳見《一文學(xué)會(huì)t檢驗(yàn)的3種常用方法》。

    完成上述步驟后,在結(jié)果界面中點(diǎn)擊“配對(duì)”旁邊的紅色三角形按鈕,在下拉菜單中選擇“Wilcoxon符號(hào)秩”,即可獲得配對(duì)秩和檢驗(yàn)的結(jié)果(圖11)。


    圖11 配對(duì)秩和檢驗(yàn)操作——方法選擇

    結(jié)果如圖12所示,患者化療前后IgA差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(S=-2523.0,p<0.0001)。


    圖12 配對(duì)秩和檢驗(yàn)操作——檢驗(yàn)結(jié)果



    04??小結(jié)

    通常情況下,組間比較的數(shù)據(jù)呈明顯偏態(tài),我們會(huì)考慮采用秩和檢驗(yàn)而不是t檢驗(yàn)或方差分析。很多人可能對(duì)秩和檢驗(yàn)存在一定誤解,總覺得秩和檢驗(yàn)像是“備胎”,實(shí)際上秩和檢驗(yàn)的效率并不低。

    • 如果數(shù)據(jù)服從正態(tài)分布,秩和檢驗(yàn)的檢驗(yàn)效率比t檢驗(yàn)、方差分析等差不了多少;

    • 而如果數(shù)據(jù)呈偏態(tài)分布,秩和檢驗(yàn)的效率則遠(yuǎn)高于t檢驗(yàn)和方差分析。

    以上就是本期我們?yōu)榇蠹規(guī)淼母韶浄窒?。下期我們將帶?strong>分類資料組間比較的卡方檢驗(yàn)。


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