鹿明生物完成蛋白質(zhì)組學(xué)生物信息分析升級(jí)，可放心向TOP級(jí)期刊提交美圖分析啦！

此次升級(jí)參考近年《Cell》、《Nature》等權(quán)威學(xué)術(shù)雜志，綜合鹿明生物客戶(hù)們的需求與建議，我們將報(bào)告由內(nèi)而外精心打磨進(jìn)行了全面的更新升級(jí)，包括優(yōu)化數(shù)據(jù)預(yù)處理、多方位數(shù)據(jù)質(zhì)控、多元功能富集分析、多樣數(shù)據(jù)可視化，給客戶(hù)更加直接全面的分析結(jié)果。

本次升級(jí)后報(bào)告共有7大模塊，53項(xiàng)分析內(nèi)容。下面讓我們看看具體的更新內(nèi)容吧~

（一）項(xiàng)目概況-提煉報(bào)告內(nèi)容，基本結(jié)果一目了然

升級(jí)后的項(xiàng)目概況將在首頁(yè)展示實(shí)驗(yàn)樣本、分組及比較組信息、蛋白肽段鑒定及差異比較結(jié)果，除此之外還會(huì)展示全蛋白在GO、KEGG、Interpro、eggNOG、Pfam等數(shù)據(jù)庫(kù)中的注釋情況。

圖 1?新增項(xiàng)目概況內(nèi)容

圖 2?新增全蛋白注釋統(tǒng)計(jì)圖

（二）全方位數(shù)據(jù)質(zhì)控-從定性到定量，深入把控

從整體、分組、樣本三個(gè)角度，充分展示鑒定數(shù)量集，不同分組，不同樣本鑒定情況，輔助篩選離群樣本及批次效應(yīng)檢測(cè)。

圖 3?質(zhì)控分析展示

（三）多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)富集-分析內(nèi)容全面，圖片專(zhuān)業(yè)美觀

選取InterPro數(shù)據(jù)庫(kù)補(bǔ)充蛋白功能注釋?zhuān)瑫r(shí)針對(duì)于物種為人、大小鼠的數(shù)據(jù)還提供了Wikipathways和Reactome數(shù)據(jù)庫(kù)。對(duì)于富集分析結(jié)果可視化，除常規(guī)柱狀圖和氣泡圖之外，新增富集環(huán)狀圖（圖4中）、蝴蝶圖（圖4左下）和富集分析和弦圖（圖4右）。

圖 4?新增數(shù)據(jù)庫(kù)富集內(nèi)容

（四）美化PPI網(wǎng)絡(luò)圖-增加節(jié)點(diǎn)排序，“抓住”hub蛋白

圖 5?蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖

（五）GSEA分析-緊跟研究熱點(diǎn)，補(bǔ)充功能分析

圖 6?GSEA示例圖

除此之外，我們還對(duì)部分圖片進(jìn)行美化升級(jí)，如火山圖、Motif分析等。

圖 7?火山圖和Motif分析

以上僅對(duì)本次升級(jí)的部分內(nèi)容做簡(jiǎn)單展示，我們將持續(xù)關(guān)注老師需求與研究現(xiàn)狀，不斷進(jìn)行升級(jí)優(yōu)化，提供更加多樣化的分析結(jié)果！想要體驗(yàn)的老師快快聯(lián)系您的銷(xiāo)售工程師，或者：LUMING_BIO為您安排人員解答哦!

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上海鹿明生物科技有限公司是歐易生物旗下從事蛋白質(zhì)組及代謝組質(zhì)譜檢測(cè)的專(zhuān)業(yè)質(zhì)譜組學(xué)服務(wù)公司。公司建有國(guó)內(nèi)第一個(gè)空間代謝組商業(yè)服務(wù)平臺(tái)，深耕質(zhì)譜組學(xué)檢測(cè)分析，具體包括空間代謝組、雙平臺(tái)代謝組、靶向代謝組、TMT標(biāo)記定量蛋白組、翻譯后修飾蛋白組、4D-DIA蛋白組、單細(xì)胞及超微量蛋白組、空間蛋白組等。創(chuàng)新質(zhì)譜組學(xué)平臺(tái)廣泛應(yīng)用于機(jī)制解析、分型診斷、標(biāo)志物篩選、藥靶發(fā)掘等多個(gè)領(lǐng)域。公司并先后獲得高新技術(shù)企業(yè)、上海市專(zhuān)精特新企業(yè)并建有院士專(zhuān)家工作站，自有包括tims tof pro2在內(nèi)的各類(lèi)大型質(zhì)譜近二十臺(tái)套，年服務(wù)項(xiàng)目超2000項(xiàng)。鹿明生物協(xié)助合作伙伴發(fā)表SCI論文近千篇，成功打造以硬數(shù)據(jù)、好服務(wù)為基礎(chǔ)，以空間代謝組為特色的質(zhì)譜組學(xué)檢測(cè)服務(wù)公司品牌。