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酶切鑒定、酶切連接、瓊脂糖配置實驗

2022-04-23 15:07 作者:可可西里良人  | 我要投稿


1 前言說明

酶切鑒定:提純重組質(zhì)粒,用相應(yīng)的限制性內(nèi)切酶(一種或兩種)切割質(zhì)粒釋放出的插入片斷,對于可能存在雙向插入的重組子還可用適當(dāng)?shù)南拗菩詢?nèi)切酶消化鑒定插入方向,然后用凝膠電泳檢測插入片斷和載體的大小。

酶切連接:

2 酶切鑒定

2.1實驗操作程序

2.1.1酶切操作:

以酶切and連接方式構(gòu)建質(zhì)粒:目的質(zhì)粒,使用Bam H1和Xba I兩種酶進行反應(yīng),目的:獲得局部片段

酶切反應(yīng)體系(冰水浴條件):

配置OK體系,放置37℃恒溫箱,2h,然后4℃過夜

2.1.2瓊脂糖凝膠電泳分離目的DNA:

材料:1 x TAE;瓊脂糖;EB,Mark(5-10ul),Buffer(50ul+10ulBuffer)

1.按照相應(yīng)配置體系,稱量并倒入取錐形瓶,加入1 x TAE溶解;

2.放在微波爐加熱至沸騰,兩次(第一次約45s,第二次約15s)

3.待稍涼后(切記不能凝固),加入EB,倒入卡槽里面(注意梳子插孔方向)

4.待凝固后,約15min,放入電泳槽(注意拔梳子要小心)。

5.電壓:11V,電流198mA,時間:45min

6.紫外光照射,切膠,用1.5ml離心管回收

7.加樣時注意膠孔方向,切勿搞反了

2.1.3目的基因(DNA)膠回收

1.將單一的目的DNA條帶從瓊脂糖凝膠中切下來(盡量切除多余部分)放入干凈的1.5ml離心管中,稱重。

2.向膠塊中加入等倍體積溶液的PN(如果凝膠重0.1g,其體積可視為100ul,則加入100ul PN溶液),放置在50℃金屬浴溶解,期間間隔3-5min上下翻轉(zhuǎn)離心管,以確保膠塊充分溶解。

3.此時,向吸附柱CA2中(吸附柱放入收集管)加入500ul平衡液BL,12000rpm(~13400*g)離心1min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。

4.將溶解OK的膠溶液加入到吸附柱CA2(吸附柱放入收集管)中,室溫靜置2min,12000rpm(~13400*g)離心1min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱CA2放入收集管中

5.向吸附柱CA2中加入600ul漂洗液PW(使用前檢查是否已經(jīng)加入無水乙醇),12000rpm(~13400*g)離心1min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱CA2放入收集管中

6.重復(fù)上一步驟

7.將吸附柱CA2放入收集管中,12000rpm(~13400*g)離心2min,盡量除盡漂洗液,將吸附柱CA2置于室溫防止數(shù)分鐘,徹底晾干,以防止殘留的漂洗液影響下一步的實驗

8.將吸附柱CA2放入新的離心管中,向吸附膜中間懸空加入30ul的ddH2O,室溫靜置2min,12000rpm(~13400*g)離心2min,收集DNA溶液

9.純度檢測

2.1.4酶連接實驗

酶連接反應(yīng)體系(冰水?。?/p>

配置OK體系,放置金屬水浴鍋(16℃)連接,過夜。

后續(xù)【質(zhì)粒轉(zhuǎn)化】【挑克隆】【搖菌】【中提】


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