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空間蛋白質(zhì)組學(xué):探索組織中隱藏的蛋白差異

2023-11-13 15:00 作者:青蓮百奧  | 我要投稿

空間蛋白質(zhì)組學(xué)研究蛋白質(zhì)在細胞或組織中的空間分布和環(huán)境,揭示其定位、相互作用及功能關(guān)系,獲取不同細胞和功能區(qū)域的蛋白表達譜。通過結(jié)合空間與細胞類型信息,深入了解組織微環(huán)境并發(fā)現(xiàn)生物標志物和新功能機制。與全組織分析相比,空間蛋白質(zhì)組學(xué)可獲得不同細胞和功能區(qū)域的蛋白表達譜;與單細胞分析相比,可獲得空間位置特異性的蛋白表達信息。

青蓮百奧解決方案

青蓮百奧推出空間蛋白質(zhì)組產(chǎn)品,利用HAMAMATSU切片掃描儀對切片進行掃描和注釋,通過MMI CellCut Plus激光捕獲顯微切割 (Laser capture microdissection ,LCM)捕獲新鮮冷凍樣本或FFPE樣本中感興趣的區(qū)域,進一步使用微量/通用型蛋白質(zhì)組試劑盒(MagicOmics-MMB)和Magicomics-AP-96全自動化前處理機器人進行高靈敏度的微量蛋白質(zhì)組學(xué)樣本前處理,采用Tims TOF HT 4D-DIA 質(zhì)譜檢測技術(shù)進行高通量的蛋白質(zhì)組學(xué)檢測,納克級樣本可實現(xiàn)毫克級檢測深度,平均檢出5000-8000個蛋白。

青蓮百奧產(chǎn)品優(yōu)勢

高精度的切片注釋

在常規(guī)空間蛋白質(zhì)組依賴HE染色技術(shù)上,使用HAMAMATSU切片掃描儀對切片掃描和注釋,結(jié)合其高分辨率、多通道掃描、自動化功能以及配套的圖像處理和注釋工具、方便和高效的數(shù)據(jù)存儲和管理對不同類型細胞自動識別定位、特定類型細胞的單細胞級別篩選、組織微環(huán)境分布分析等。

高準確度精密切割

在常規(guī)LCM技術(shù)上進行優(yōu)化,在MMI CellCut Plus激光捕獲顯微切割平臺上實現(xiàn)基于HAMAMATSU切片掃描儀的注釋信息實時成像觀察,根據(jù)客戶需求選定目標區(qū)域進行自動化動激光顯微切割,可實現(xiàn)單細胞級別的切割。

自動化微量樣品前處理

基于獨創(chuàng)性納米磁珠富集技術(shù),青蓮百奧微量/通用型蛋白質(zhì)組試劑盒(MagicOmics-MMB)對中微量樣品中的蛋白具有高效的富集能力,配套使用蛋白質(zhì)組學(xué)全流程自動化前處理機器人(MagicOmics-AP-96),能夠?qū)崿F(xiàn)空間蛋白質(zhì)組學(xué)樣本處理全流程自動化,最多可同時處理96例樣本,在大大降低實驗周期的同時,能夠保證蛋白質(zhì)檢測的準確性和穩(wěn)定性。

高深度質(zhì)譜檢測

通過整理多種先進技術(shù),再結(jié)合最新4D DIA tims TOF HT可實現(xiàn)高深度的蛋白組學(xué)檢測,單個樣本平均可檢出5000-8000個蛋白。在保證高深度檢測的同時,不同細胞類型的樣品可顯著性區(qū)分并特異性聚類。

項目文章

青蓮百奧的空間蛋白質(zhì)組學(xué)項目在國內(nèi)外學(xué)術(shù)界引起了廣泛關(guān)注。2022年7月,青蓮百奧與中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)院合作,在《

Nature Communications

》上共同發(fā)表了國內(nèi)首篇關(guān)于空間蛋白質(zhì)組學(xué)的研究論文“Spatially resolved proteomic map shows that extracellular matrix regulates epidermal growth”,為國內(nèi)空間蛋白質(zhì)組學(xué)的研究樹立了新的標桿。

應(yīng)用場景

空間蛋白質(zhì)組學(xué)是一種新興的技術(shù),能夠在組織和細胞水平上對蛋白質(zhì)分子進行高分辨率的定位和檢測。該技術(shù)具有廣泛的應(yīng)用前景,可用于研究微環(huán)境與疾病發(fā)展、腫瘤組織異質(zhì)性、機制與藥物靶點研究以及組織器官空間圖譜構(gòu)建等方面。

青蓮百奧是一家專注于空間蛋白質(zhì)組學(xué)研究的科技公司,旨在為全球的科研機構(gòu)和企業(yè)提供最先進、最專業(yè)的空間蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)。歡迎大家前來咨詢~

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