實驗寶典 | 高質(zhì)量RNA實驗流程技巧請收好!
在過去的十年中,RNA-Seq技術(shù)迅速發(fā)展,因為能夠從整體水平研究基因功能以及基因結(jié)構(gòu),揭示特定生物學(xué)過程以及疾病發(fā)生過程中的分子機理,所以廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、臨床診斷和藥物研發(fā)等領(lǐng)域。由于RNA本身不穩(wěn)定,而mRNA只占抽提總RNA的3%-4%,且RNA-seq最常用的磁珠富集法對于RNA的完整度要求也很高,所以,提取作為科研實驗開始的第一步是十分重要的一個環(huán)節(jié)。
今天小歐就來為大家?guī)硖崛〗绲目▽毜?,一起來了解RNA提取液氮研磨組織時的注意事項吧~
一、液氮研磨重要性
1、 由于RNA的分子結(jié)構(gòu)特點,RNA極易降解,液氮可以使樣本組織瞬間達到低溫狀態(tài),抑制組織內(nèi)源性RNase降解RNA;
2、 由于液氮極低的溫度可以使樣本組織和細胞都變得很脆(對,就是嘎嘣脆的那種~),通過研磨便于細胞的破碎,釋放出細胞內(nèi)部的核酸;
3、組織的勻漿過程是RNA提取是否成功的關(guān)鍵步驟之一,液氮研磨可以保持組織在勻漿過程中持續(xù)處于低溫狀態(tài),防止研磨過程中RNA的降解;
二、液氮研磨的原理(研缽)
液氮的溫度為一196℃,它既能使各種組織成分不易被破壞或降解(終止細胞內(nèi)外一切生物反應(yīng),又能使組織變硬,脆性增加易于磨碎)。
三、液氮研磨流程
1.?滅菌
研缽的滅菌180度烘2h,每份樣本使用單獨的研缽、鑷子、剪刀等取樣工具,防止交叉污染,且取樣工具需要遠離垃圾桶,防止污染樣本。
2.?預(yù)冷
1)?用記號筆在收集管蓋上和管壁上,都寫上樣品名稱;
2)?將樣品、收集管、勺子放在液氮中預(yù)冷;
3)?將液氮小心加入并浸滿研缽,浸泡預(yù)冷研杵與研缽(加入液氮時,緩慢加入,防止液氮飛濺),一般加兩次液氮就很好的預(yù)冷了。
3.放入組織
????將組織迅速轉(zhuǎn)移至液氮內(nèi),確保組織全部浸沒在液氮中。
4.破碎
使用研杵在液氮中輕輕敲打組織,將組織打碎成小塊,要注意切勿用力過度,要防止組織塊飛濺出研缽;在液氮即將揮發(fā)完時,使用研杵對組織樣本進行碾壓研磨。注意研磨過程要朝著一個方向研磨。
5.中途補充液氮
待液氮揮發(fā)完后,立即加入1/3研缽體積的液氮(注意,加入液氮速度要緩慢,切勿使得液氮沖擊力過大,將組織樣本沖出研缽)。
6.?充分研磨2-3次
迅速用研杵研磨組織,根據(jù)組織狀態(tài)的變化程度,在確保組織始終處于冰凍狀態(tài)下,及時補充液氮進行研磨,直至組織被研磨成粉末狀。
7.收集聚攏樣品
最后再補充一次液氮聚攏粉末,用勺子攪拌粉末,待液氮揮發(fā)完全粉末泛白。
8.裝取樣品
用長鑷子取出液氮中的樣品收集管,用勺子挖取適量粉末樣本至收集管中,且要注意,手指不要捏住收集管的管底,要抓住管口的位置,收取后蓋好蓋子并迅速投入液氮保存;剩余多余樣品收集至合適的樣品管中,也要迅速投入液氮。
四、注意事項
1.個人防護:佩戴棉手套,注意液氮飛濺凍傷;液氮、裂解液均對人體有危害,注意避免直接皮膚接觸,禁止在該實驗中穿短褲、涼鞋等會暴露皮膚的服裝,必要時可以帶上護目鏡以保護面部安全;
2.勺子離心管需要預(yù)冷;
3.研磨過程中使用的器材均需滅菌;
4.研磨程度越細越好。
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