根據(jù)制藥企業(yè)生產(chǎn)類型可以分為合成藥、中成藥、生物制藥等。其中，合成藥物廢水來源于合成工藝反應(yīng)的步驟中，在產(chǎn)品轉(zhuǎn)化的過程中原料的損失、副產(chǎn)物的多余、有機溶劑的廢棄等。中成藥污染物主要來自洗滌、蒸煮、提純分離、濃縮或制劑，以及在生產(chǎn)工序中所排出的清洗廢水，冷凝水或殘渣廢水等。生物制藥廢水主要是發(fā)酵過程中萃取或蒸餾過程中所產(chǎn)生的殘留液或?qū)Я鲝U液。制藥廢水常規(guī)的污染物是COD、BOD5、SS、氨氮等，主要表現(xiàn)為水質(zhì)變化、間隙排水、水量波動大。制藥廢水污染能力強、毒性大、可生化性差。在處理工藝中步驟多，設(shè)計的工藝復(fù)雜，難度大等。

在制藥廢水處理方法上，主要包括預(yù)處理+生化處理+沉淀消毒等。預(yù)處理包括混凝沉淀、氣浮、鐵碳-芬頓、微電解、催化氧化等，生化工藝包括厭氧和好氧兩個方面，通常情況為了提高效率增強效果降低成本，厭氧和好氧會聯(lián)合使用。常見的厭氧工藝包括：上流式活性污泥反應(yīng)器（UASB），兩相厭氧消化、水解酸化池等，好氧工藝就比較多了，比如普通的接觸氧化法、生物膜法、序列式活性污泥法（SBR）、活性污泥法、深井曝氣池等。制藥廢水治理過程中，針對高氨氮磷、高鹽、高COD的問題，為了后續(xù)的生化降解做準備，常用化學氧化法來降低污染物含量，比如微電解-鐵碳芬頓，混凝沉淀等方法進行。

芬頓試劑氧化反應(yīng)在廢水處理中是最為常見的工藝，一般情況下是微電解聯(lián)合使用。微電解的原理就是將鐵碳的填料浸沒在酸性廢水中，因為鐵和碳之間產(chǎn)生電極電位差，從而使得廢水形成無數(shù)個微小的原電池。在酸性電解質(zhì)水溶液中發(fā)生反應(yīng)，產(chǎn)生大量的Fe2+。Fe2+在酸性溶液中具有較強的活性，能夠改變廢水大多數(shù)有機污染物的結(jié)構(gòu)。在微電解反應(yīng)的過程中，產(chǎn)生的Fe2+和過氧化氫一起反應(yīng)，就是芬頓試劑法。在反應(yīng)的過程中，生成羥基離子和Fe3+。這種羥基離子具有較強的氧化作用，可以將廢水中的大多數(shù)有機物氧化降解為小分子的有機物。為了加強氧化效果，會加入催化劑使得廢水快速形成自由基較強的羥基氧化劑。同時，F(xiàn)e3+具有絮凝劑的作用，通過調(diào)節(jié)pH值，中和沉淀進一步分離。

生化處理階段比較重要的就是厭氧反應(yīng)，預(yù)處理階段將廢水污染物的濃度降低到適合生化反應(yīng)的范圍內(nèi)，將廢水通入的厭氧反應(yīng)器內(nèi)，使得廢水從反應(yīng)器的底部不斷上升。在上升的過程中會通過活性污泥床，活性污泥中有經(jīng)過馴化的高效微生物。廢水中的有機污染物就和這些微生物在厭氧的條件內(nèi)發(fā)生代謝作用，過程中會產(chǎn)生熱量和氣體。氣體的主要成分有二氧化碳和甲烷，可以通過專門的管道進行收集并處理成為清潔能源-沼氣來使用。在活性污泥床上發(fā)生反應(yīng)的時候，產(chǎn)生的氣泡會從底部向上升，在上升的過程會攜帶有活性污泥顆粒一起上升。循環(huán)往復(fù)，就具有了攪拌和混勻的作用。單純的厭氧是不能充分降解污染物的，是需要后續(xù)的好氧和沉淀消毒處理，才能達到預(yù)期的效果。