因?yàn)榘惭bHic-Pro，需要依賴幾個(gè)R包，比如ggplot2,又依賴>4.0的R，之前安的3.6，再重新安裝一遍最新的吧，記錄一下，省去了以后再重復(fù)查資料的過程。

一、先是官網(wǎng)上選擇適合自己服務(wù)器的R：

https://cran.r-project.org/

二、下載并解壓

wget https://cran.r-project.org/src/base/R-4/R-4.2.0.tar.gz

tar -zxvf R-4.2.0.tar.gz

./configure --with-pcre1

make? #會編譯好久

三、然后加載R包

進(jìn)入bin目錄下:

./R

> install.packages("BiocManager")

> install.packages('ggplot2')

> install.packages('RColorBrewer')

> q()

Save workspace image? [y/n/c]: n

新安裝的R包會默認(rèn)的放到library目錄下.

四、可能會遇見的鏡像問題：

Warning: unable to access index for repository https://mirrors.bfsu.edu.cn/CRAN/src/contrib:

? cannot?open URL 'https://mirrors.bfsu.edu.cn/CRAN/src/contrib/PACKAGES'

Warning message:

package ‘BiocManager’ is not available for this version of R

一開始我以為是R版本的問題，轉(zhuǎn)眼一想，我從3升到4，主要是為了安裝ggplot2，這個(gè)就是依賴版本4的，那換鏡像，于是重新選擇鏡像，從Beijing換到了Guangzhou，再安裝R包，問題解決。注意，安裝ggplot2需要時(shí)間會比較長。

參考：https://www.cnblogs.com/shanyr/p/11427876.html

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