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HMDD 4.0:miRNA-疾病關(guān)系數(shù)據(jù)庫(kù)

2023-11-03 14:31 作者:凌恩生物  | 我要投稿

凌恩-盈飛團(tuán)隊(duì)

?擁有多項(xiàng)自主專(zhuān)利技

術(shù)和軟件著作權(quán),具

有豐富的數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)

搭建經(jīng)驗(yàn)。?

MicroRNA(miRNA)是一類(lèi)重要的小非編碼RNA,在疾病診斷和治療中發(fā)揮著重要作用。人類(lèi) MicroRNA 疾病數(shù)據(jù)庫(kù) (HMDD) 為 miRNA 相關(guān)醫(yī)學(xué)提供了重要且全面的資源。與HMDD v3.0 相比,

HMDD v4.0?包含的條目數(shù)量增加了 1.5 倍

,增加了一些新的類(lèi)別(

與疾病有關(guān)的外泌體 miRNA、與人類(lèi)疾病有關(guān)的病毒編碼的 miRNA 以及 miRNA-circRNA 相互作用的條目

),還在疾病中篩選了

性別偏向的miRNA

數(shù)據(jù)庫(kù)可免費(fèi)訪(fǎng)問(wèn)http://www.cuilab.cn/hmdd。

圖1 圖形摘要

HMDD v4.0包含53530個(gè)實(shí)驗(yàn)支持的miRNA-疾病關(guān)聯(lián)條目,涵蓋了來(lái)自37090篇論文的1817個(gè)人類(lèi)miRNA基因,79個(gè)病毒源性miRNA和2360個(gè)人類(lèi)疾病。根據(jù)實(shí)驗(yàn)證據(jù),這些條目被分為8類(lèi),包括23種不同的證據(jù)代碼。此外,研究還將來(lái)自不同疾病的性別偏向的miRNA納入HMDD v4.0中,以促進(jìn)對(duì)疾病性別差異的理解。

圖2 HMDD v4.0數(shù)據(jù)庫(kù)概述

與其他類(lèi)似數(shù)據(jù)庫(kù)相比,HMDD v4.0增加了更大數(shù)量的miRNA-疾病關(guān)聯(lián)、詳細(xì)的關(guān)聯(lián)類(lèi)別和方便的功能模塊。

表 HMDD v4.0與其他類(lèi)似數(shù)據(jù)庫(kù)的比較

總之,HMDD的不斷更新,為研究miRNA-疾病關(guān)系網(wǎng)絡(luò)提供了一個(gè)重要而有用的資源。

Tips

?

凌恩-盈飛團(tuán)隊(duì),致力于開(kāi)拓前沿分子生物學(xué)技術(shù)和高性能計(jì)算在生命科學(xué)研究、分子育種及人類(lèi)健康領(lǐng)域的應(yīng)用,旨在為生命科學(xué)領(lǐng)域客戶(hù)提供國(guó)際領(lǐng)先的數(shù)據(jù)管理和分析解決方案。公司擁有多項(xiàng)自主專(zhuān)利技術(shù)和軟件著作權(quán),成功開(kāi)發(fā)VG多樣性分析軟件、VG轉(zhuǎn)錄組分析軟件、VG生信分析云平臺(tái)、R J腫瘤信息 管理系統(tǒng)(臨床應(yīng)用)、Y-STR/Y-SNP法醫(yī)學(xué)分析平臺(tái)(法醫(yī)應(yīng)用)、FD個(gè)人基因組分析和報(bào)告系統(tǒng)、FD祖源分析和報(bào)告系統(tǒng)、FD家系分析和報(bào)告系統(tǒng)、動(dòng)植物物種數(shù)據(jù)庫(kù)(水稻、蕨類(lèi)、瓠瓜、旱獺、桉樹(shù)等 )、TMBQ 靶向代謝組批量定量分析平臺(tái)、蛋白代謝數(shù)據(jù)分析平臺(tái)等??蛻?hù)群體包括高等院校、科研院所、三甲醫(yī)院及疾控中心,藥企及基因檢測(cè)公司等。?

參考文獻(xiàn) HMDD v4.0: a database for experimentally supported?human microRNA-disease associations. Nucleic Acids Research, 2023.

HMDD 4.0:miRNA-疾病關(guān)系數(shù)據(jù)庫(kù)的評(píng)論 (共 條)

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