HMDD 4.0:miRNA-疾病關(guān)系數(shù)據(jù)庫(kù)
凌恩-盈飛團(tuán)隊(duì)
?擁有多項(xiàng)自主專(zhuān)利技
術(shù)和軟件著作權(quán),具
有豐富的數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)
搭建經(jīng)驗(yàn)。?
MicroRNA(miRNA)是一類(lèi)重要的小非編碼RNA,在疾病診斷和治療中發(fā)揮著重要作用。人類(lèi) MicroRNA 疾病數(shù)據(jù)庫(kù) (HMDD) 為 miRNA 相關(guān)醫(yī)學(xué)提供了重要且全面的資源。與HMDD v3.0 相比,
HMDD v4.0?包含的條目數(shù)量增加了 1.5 倍
,增加了一些新的類(lèi)別(
與疾病有關(guān)的外泌體 miRNA、與人類(lèi)疾病有關(guān)的病毒編碼的 miRNA 以及 miRNA-circRNA 相互作用的條目
),還在疾病中篩選了
性別偏向的miRNA
。
數(shù)據(jù)庫(kù)可免費(fèi)訪(fǎng)問(wèn)http://www.cuilab.cn/hmdd。
圖1 圖形摘要
HMDD v4.0包含53530個(gè)實(shí)驗(yàn)支持的miRNA-疾病關(guān)聯(lián)條目,涵蓋了來(lái)自37090篇論文的1817個(gè)人類(lèi)miRNA基因,79個(gè)病毒源性miRNA和2360個(gè)人類(lèi)疾病。根據(jù)實(shí)驗(yàn)證據(jù),這些條目被分為8類(lèi),包括23種不同的證據(jù)代碼。此外,研究還將來(lái)自不同疾病的性別偏向的miRNA納入HMDD v4.0中,以促進(jìn)對(duì)疾病性別差異的理解。
圖2 HMDD v4.0數(shù)據(jù)庫(kù)概述
與其他類(lèi)似數(shù)據(jù)庫(kù)相比,HMDD v4.0增加了更大數(shù)量的miRNA-疾病關(guān)聯(lián)、詳細(xì)的關(guān)聯(lián)類(lèi)別和方便的功能模塊。
表 HMDD v4.0與其他類(lèi)似數(shù)據(jù)庫(kù)的比較
總之,HMDD的不斷更新,為研究miRNA-疾病關(guān)系網(wǎng)絡(luò)提供了一個(gè)重要而有用的資源。
Tips
?
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參考文獻(xiàn) HMDD v4.0: a database for experimentally supported?human microRNA-disease associations. Nucleic Acids Research, 2023.