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鐵死亡基因的專屬倉庫,F(xiàn)errDb數(shù)據(jù)庫

2022-12-26 13:53 作者:小云愛生信  | 我要投稿

爾云間? 一個專門做科研的團隊

原創(chuàng)?小果?生信果?

小果在查詢基因集的時候經(jīng)常會遇到各種數(shù)據(jù)庫,而有一些熱點的基因集其實是有他們專屬的數(shù)據(jù)庫的,比如說鐵死亡,下面就有小果來介紹一下鐵死亡基因的數(shù)據(jù)庫吧。


這個數(shù)據(jù)庫叫FerrDb,上鏈接

http://www.zhounan.org/ferrdb/current/

圖片

看一下首頁,先說一下最重要,如何讓下載到鐵死亡的數(shù)據(jù)集,就是點右上角的download。


圖片

Data Set是選擇要下載的數(shù)據(jù)類型,來了解一下吧:

  1. Driver是驅動基因,

  2. suppressor是抑制基因,

  3. Marker是標志基因,

  4. Unclassified是未歸類的基因,

我們下載基因集一般就會選擇這幾種基因,后面選一個格式就可以點擊download下載了。


說完了大家最想知道的,再來補充一點小知識吧:


鐵死亡(Ferroptosis)是一種鐵依賴性的調(diào)節(jié)性細胞死亡方式,與多種人類疾病(例如癌癥、心血管疾病和退行性疾病等)緊密相關。鐵死亡的過程很復雜,由多種代謝物和生物分子組成,也有一些特征基因發(fā)生變化。現(xiàn)如今鐵死亡已成為除m6A、自噬、腸道微生物、腫瘤免疫等明星研究的又一大熱點, FerrDb數(shù)據(jù)庫可以助我們輕松入門鐵死亡研究熱點。


FerrDb數(shù)據(jù)庫是由廣州醫(yī)科大學附屬腦科醫(yī)院、四川大學生命科學學院以及生物資源與生態(tài)環(huán)境教育部重點實驗研究團隊共同建成的, FerrDb是現(xiàn)如今第一個人工整理的鐵死亡數(shù)據(jù)庫,用于管理和鑒定鐵死亡相關的標志物和調(diào)控因子以及鐵死亡關聯(lián)疾病的數(shù)據(jù)庫 。FerrDb中的數(shù)據(jù)都可免費下載和使用。


好了,小伙伴們,這就是今天小果要介紹的主要內(nèi)容了,有什么問題的話歡迎來和小果分享討論喲。


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