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「撥云見日」② | 葉片樣本植物代謝組實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)大公開

2023-03-13 11:44 作者:百趣代謝組學(xué)  | 我要投稿

本周我們就一起看看不同植物葉片樣本的實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)吧。

葉片樣本實(shí)測(cè)結(jié)果大揭秘 不同植物葉片物質(zhì)檢出水平:平均檢出1275種

我們可以發(fā)現(xiàn),利用植物代謝組檢測(cè)植物葉片樣本,物質(zhì)檢出數(shù)量基本都達(dá)到了1000+種,平均檢出為1275種。接下來(lái),我們來(lái)看一下初、次級(jí)代謝物的檢測(cè)情況。

不同植物葉片次級(jí)代謝物檢出:平均890種

不難發(fā)現(xiàn),6種不同植物葉片次級(jí)代謝物檢出有很大的差異,那么不同種類葉片間的差異主要由哪些物質(zhì)類別導(dǎo)致的呢?

不同植物葉片檢出代謝物類別:豐富

我們從一級(jí)分類的各類別物質(zhì)占比發(fā)現(xiàn),在不同種植物葉片中,莽草酸及苯丙酸類和萜類的占比比較高。而在二級(jí)分類中,倍半萜類、單萜類和二萜類占萜類中的比例較高。萜類物質(zhì)在促進(jìn)植物生長(zhǎng)和抵抗各種逆境中發(fā)揮功效。像倍半萜是自然界中分布較廣的一類化合物,具有抗炎、抗腫瘤、免疫調(diào)節(jié)等廣泛的生物活性。因此,其物質(zhì)數(shù)量的差異能夠反映植物本身生理狀態(tài)及營(yíng)養(yǎng)價(jià)值。

所有的代謝物類型在不同物種、不同組織中都是有差異的,因此對(duì)于代謝物的檢測(cè)不能僅限于某一類。當(dāng)然,以上的數(shù)據(jù)僅為不同植物葉片樣本項(xiàng)目的實(shí)測(cè)數(shù)據(jù),也不等于最終樣本中檢出的情況。針對(duì)不同的處理,不同的生長(zhǎng)條件,不同的品種,以上數(shù)據(jù)都有差異,因此我們需要根據(jù)自己的樣本來(lái)進(jìn)行實(shí)際分析。

植物代謝組優(yōu)勢(shì)一覽 1.高品質(zhì)海量植物數(shù)據(jù)庫(kù)

植物代謝組具有包含20000+種植物初、次級(jí)代謝物,囊括近20000種植物且超98%代謝物具有參考文獻(xiàn)來(lái)源的全新的、高品質(zhì)的、海量的植物專屬數(shù)據(jù)庫(kù)。

2.專業(yè)且科學(xué)的物質(zhì)分類

植物代謝組數(shù)據(jù)庫(kù)是物質(zhì)分類覆蓋三個(gè)層級(jí),分類更加科學(xué)且專業(yè),從7個(gè)一級(jí)分類到400+的三級(jí)分類,提供了全面的、多層級(jí)的物質(zhì)分類,可滿足不同研究者對(duì)于物質(zhì)分類細(xì)致程度不同的需求。

3.數(shù)據(jù)質(zhì)量?jī)?yōu),檢出水平高

植物代謝組采用OE超高分辨質(zhì)譜檢測(cè),超高質(zhì)量精度輔助定性,同時(shí)高分辨可更好降低復(fù)雜基質(zhì)中質(zhì)量數(shù)接近的物質(zhì)的干擾,使得定量更準(zhǔn)確。

采用植物代謝組的組學(xué)技術(shù)對(duì)不同的物種進(jìn)行檢測(cè),可定性到1000-1400種代謝物,如不同種類茶葉樣本平均檢出近1300種代謝物。

4.代謝物數(shù)據(jù)分析內(nèi)容:全

植物代謝組20+項(xiàng)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容可分為基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分析與高級(jí)數(shù)據(jù)分析,覆蓋了從差異代謝物篩選到差異代謝物的功能分析的由淺入深式有用信息挖掘,為您帶來(lái)更為全面細(xì)致的數(shù)據(jù)挖掘體驗(yàn)。

分析內(nèi)容一覽圖 5.代謝物數(shù)據(jù)分析內(nèi)容:豐富

20+項(xiàng)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容,無(wú)論是差異代謝物篩選的火山圖還是差異代謝物功能分析的代謝物調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析圖,植物代謝組無(wú)一例外都帶來(lái)了精美且符合發(fā)文需求的數(shù)據(jù)分析圖。接下來(lái)將為您具體舉例:

相關(guān)性熱圖

K-Means圖

KEGG分類圖

差異豐度得分圖

看完植物代謝組在不同種類茶葉中的精彩表現(xiàn)您心動(dòng)了嗎?現(xiàn)在聯(lián)系我們,我們將會(huì)針對(duì)您的科研課題提供一對(duì)一的專屬技術(shù)服務(wù)。

本期關(guān)于葉片樣本植物代謝組實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)的分享就到這里結(jié)束啦~本系列推文共8期,第三期將為大家?guī)?lái)根系分泌物樣本類型實(shí)測(cè)數(shù)據(jù),讓我們一起來(lái)期待一下吧~



「撥云見日」② | 葉片樣本植物代謝組實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)大公開的評(píng)論 (共 條)

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