太平天國(guó)的最高統(tǒng)帥為天王洪秀全，太平天國(guó)初期設(shè)立軍師，楊秀清為左輔正軍師，蕭朝貴為右弼又正軍師，馮云山為前導(dǎo)副軍師。在永安時(shí)又對(duì)眾人封王。太平軍在建立軍隊(duì)制度時(shí)借鑒了《周禮》。

在太平天國(guó)中，朝廷內(nèi)以丞相官位為最高，還分為天、地、春、夏、秋、冬六官，并且也有正、又正、副、又副四人，共有二十四人；以下另設(shè)有檢點(diǎn)三十六人，指揮七十二人，將軍一百人。

太平軍分陸營(yíng)、水營(yíng)、土營(yíng)，陸營(yíng)由步兵炮兵騎兵組成，也擁有一定的工兵，分為中、前、后、左、右五翼。每翼下轄有19軍，每軍各設(shè)立一名軍帥和監(jiān)軍，每軍有五個(gè)師，各師由師帥統(tǒng)領(lǐng)；每師還會(huì)擁有五旅，每旅由旅帥管轄；每旅有五個(gè)卒隊(duì)，各卒隊(duì)由卒長(zhǎng)統(tǒng)帥；各卒有四兩，每?jī)捎幸粌伤抉R；每?jī)上掠形鍌€(gè)伍隊(duì)，每伍由伍長(zhǎng)所領(lǐng)有四人。每軍共有師帥五人，旅帥二十五人，卒長(zhǎng)一百二十五人，兩司馬五百人。

女營(yíng)就是女軍，女軍與陸營(yíng)分級(jí)不同，女軍分為軍、卒、伍三級(jí)，女營(yíng)共有40個(gè)軍，每軍設(shè)總制、軍帥、監(jiān)軍一名，下面管轄25個(gè)卒隊(duì)，每卒下轄4個(gè)兩司馬。女營(yíng)平時(shí)也會(huì)陪同陸營(yíng)一起作戰(zhàn)，或是負(fù)責(zé)守城。

太平天國(guó)在民間也按照軍事化結(jié)構(gòu)建立，12500家組成一軍由軍帥統(tǒng)領(lǐng)，下面有五個(gè)師，每師有2500家分成五個(gè)旅，每旅有500家分為100家為一卒。下面分成四兩，每?jī)捎?5人有兩司馬統(tǒng)領(lǐng)。然后每4家成一伍由一名伍長(zhǎng)管理。

有警則首領(lǐng)統(tǒng)領(lǐng)成兵殺敵捕賊，無(wú)事則首領(lǐng)督之為兵耕田奉尚。

太平軍的訓(xùn)練分為集體操練和個(gè)人武藝，軍中將領(lǐng)還被要求熟讀兵書(shū)懂兵法，軍中的土營(yíng)就是工兵，土營(yíng)負(fù)責(zé)搭筑營(yíng)壘還在攻城時(shí)爆破城墻。

軍隊(duì)后勤還設(shè)立典旗幟、典炮、典鉛碼、典紅粉、典硝、典鐵匠、典木匠、典繩索、典圣庫(kù)、典圣糧、典買辦、典油鹽，這些典官都直屬于各軍總制指揮，并不屬于軍帥指揮。