最近，我們注意到一些公司和高校拓展和集成了GraphBio，比如：

迪安診斷：yushiny.shinyapps.io/DAV_v1/

北大一實驗室：

http://www.fynn-guo.cn:3838/MOIomicsplotting/

看來大家對GraphBio還挺喜歡，畢竟被R社區(qū)評為生命科學(xué)領(lǐng)域內(nèi)7個最好的R shiny dashboard之一嘛。

因此，為了讓大家能夠更方便的部署到自己web服務(wù)器，做一些定制化修改（因為是模塊化設(shè)計，拓展操作非常簡單方便），方便自己的用戶使用。我們現(xiàn)在把docker版本發(fā)布出來，供大家輕松私有部署，請大家沒有任何顧慮的隨意使用和分發(fā)。

docker pull databio2022/graphbio:v2.2.7-manual
docker run --rm -d -p 80:3838 -v /root/log/:/home/shiny/graphbio-log/ databio2022/graphbio:v2.2.7-manual /init

For english version, please use:
docker pull databio2022/graphbio:v2.2.5-en-manual
docker run --rm -d -p 80:3838 -v /root/log/:/home/shiny/graphbio-log/ databio2022/graphbio:v2.2.5-en-manual /init

有些朋友可能還不知道GraphBio是什么，下面由ChatGPT做個簡要介紹：GraphBio是一個先進(jìn)且用戶友好的R Shiny Web應(yīng)用程序，旨在簡化組學(xué)數(shù)據(jù)的可視化和分析過程。無論您是生物學(xué)家、遺傳學(xué)家還是研究人員，處理基因組、轉(zhuǎn)錄組或蛋白組數(shù)據(jù)，GraphBio都能提供模塊化和可擴(kuò)展的解決方案，讓您輕松進(jìn)行流行的可視化分析。

GraphBio提供了每個功能的示例數(shù)據(jù)文件，用戶只需要按照示例文件數(shù)據(jù)格式，上傳即可完成可視化。以下是一些示例文件的介紹：

熱圖：heatmap_test.csv和group_info.csv

火山圖：volcano_example.csv和volcano_example1.csv

累積分布曲線：cdc_example.csv和cdc-mutiple-group.csv

弦圖：chord_example.csv

網(wǎng)絡(luò)圖：corr_net.csv

相關(guān)散點圖：corr_scatter.csv

GO富集圖（樣式2）：go_bubble_example.csv

GO富集圖（樣式1）：go_term_bubble.csv

MA圖：ma_example.csv

餅圖：pie_example.csv

ROC曲線：roc_example.csv

四象限圖：sixiangxian_example.csv

生存曲線：surv_example.csv

聚類分析：text_cluster_example.csv

Venn圖：venn_example.csv

網(wǎng)站請訪問?http://www.graphbio1.com/

源碼和示例文件請訪問?https://github.com/databio2022/GraphBio

引用：?Zhao T and Wang Z (2022), GraphBio: A shiny web app to easily perform popular visualization analysis for omics data. Front. Genet. 13:957317.doi: 10.3389/fgene.2022.957317