MALDI-TOF 分析肽混合物時(shí)，能耐受適量的緩沖劑、鹽，而且各個(gè)肽片段幾乎都只產(chǎn)生單電荷離子，因此MALDI-TOF MS成為理想的質(zhì)量肽譜圖分析工具。當(dāng)您需要對(duì)蛋白質(zhì)(多肽)樣品的理論序列通過(guò)MALDI TOF進(jìn)行確證。首先我們會(huì)對(duì)拿到的樣品通過(guò)進(jìn)行酶切，再通過(guò)MALDI MS進(jìn)行肽指紋圖譜的確證，再通過(guò)MS/MS對(duì)峰圖進(jìn)行驗(yàn)證，然后通過(guò)與您提供的理論序列進(jìn)行比對(duì)得到肽覆蓋圖譜。百泰派克公司應(yīng)用現(xiàn)有的質(zhì)譜技術(shù)平臺(tái)，開(kāi)發(fā)出以MALDI TOF MS為基礎(chǔ)的的質(zhì)量肽譜圖分析。

MALDI TOF 用于質(zhì)量肽譜分析的優(yōu)缺點(diǎn):

優(yōu)點(diǎn)：是蛋白質(zhì)鑒定的經(jīng)典方法，算法簡(jiǎn)單，速度快， 在串聯(lián)質(zhì)譜鑒定出現(xiàn)之前應(yīng)用廣泛。

缺點(diǎn):?質(zhì)量相近的多肽增加匹配難度，并且無(wú)法實(shí)現(xiàn)混合蛋白的鑒定，不太適合數(shù)據(jù)庫(kù)不完整的物種的蛋白質(zhì)鑒定，不能分析到翻譯后修飾位點(diǎn)，不易與液相色譜連接。