DIA蛋白質(zhì)組學(xué)
DIA蛋白質(zhì)組學(xué)是指用DIA技術(shù)進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)的研究,DIA具有可重現(xiàn)性高和定量準(zhǔn)確度高等優(yōu)點(diǎn),SWATH就是一種DIA技術(shù)。百泰派克生物科技提供SWATH定量蛋白組學(xué)服務(wù)。
DIA技術(shù)
DIA(data-independent acquisition)即數(shù)據(jù)非依賴型掃描模式,是一種新的全息式的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集模式。DIA在一級(jí)質(zhì)譜檢測(cè)后,會(huì)對(duì)特定質(zhì)荷比范圍內(nèi)的所有母離子進(jìn)行碎裂,采集所有母離子的碎片離子,并快速地依次掃描相鄰的母離子寬口內(nèi)的所有碎片離子,從而獲得完整的肽段信息,大大提高了定量的可重現(xiàn)性。DIA可以對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行相對(duì)或絕對(duì)定量。
DIA蛋白質(zhì)組學(xué)
DIA蛋白質(zhì)組學(xué)是指利用DIA技術(shù)進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)的研究,包括蛋白質(zhì)組的定性和定量。傳統(tǒng)的蛋白組學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,如iTRAQ、TMT、Label-free和SILAC等,都是數(shù)據(jù)依賴型掃描模式(data-dependent acquisition,DDA)的技術(shù)。因在母離子選擇的過(guò)程中質(zhì)譜更偏向于掃描高豐度的肽段,所以這些DDA技術(shù)的二級(jí)質(zhì)譜只能夠采集一級(jí)譜圖信號(hào)最強(qiáng)的 Top20 的信息,從而造成信息遺漏,對(duì)于大批量樣品或者多批次實(shí)驗(yàn)的重現(xiàn)性不好。于是,DIA技術(shù)就針對(duì)這一問(wèn)題被開發(fā)出來(lái)了。DIA技術(shù)中,選定的m/z范圍內(nèi)的所有離子都被裂解并在串聯(lián)質(zhì)譜的第二階段進(jìn)行分析。與DDA 定量蛋白組相比,DIA有靈敏度高、可重現(xiàn)性高以及定量準(zhǔn)確度高等優(yōu)點(diǎn)。SWATH技術(shù)就是DIA中的一種。
