不同種類的PCR探針如何工作-Eclipse? 探針
2022-12-01 09:08 作者:biofount科研試劑 | 我要投稿
Eclipse? 探針是一種 PCR 探針,用于通過互補(bǔ)靶向 DNA 序列。 Eclipse? 探針有四個(gè)組成部分:熒光報(bào)告基因、猝滅劑、小溝結(jié)合物和寡核苷酸。 與目標(biāo)序列的比對導(dǎo)致報(bào)告基因和淬滅劑之間的物理距離有利于熒光。
小溝結(jié)合劑 (MGB):小溝結(jié)合劑是一種新月形的小分子,通過小溝與 DNA 相互作用。 由于與堿基對邊緣結(jié)合的氫,MGB 可以加入寡核苷酸序列。
圖 1. Eclipse? 探針包含小溝結(jié)合物、熒光報(bào)告基因、猝滅劑和互補(bǔ)寡核苷酸。
Eclipse? 探針如何工作?
熒光報(bào)告基因位于寡核苷酸序列的 3' 端,猝滅劑位于 Eclipse? 探針的 5' 端。
MGB 與猝滅劑結(jié)合。 由于 Eclipse? 探針具有環(huán)狀構(gòu)象(如“U”型),淬滅劑靠近熒光報(bào)告基因,使其能夠淬滅報(bào)告基因。
探針在退火階段改變其構(gòu)象并與目標(biāo)序列雜交,從而將淬滅劑與熒光報(bào)告基因分離。
因此,報(bào)告基因可以發(fā)出熒光。 產(chǎn)生的熒光信號與樣品中的擴(kuò)增產(chǎn)物成正比。
圖2. Eclipse? 探針結(jié)合導(dǎo)致構(gòu)象變化,將報(bào)告基因與猝滅劑分開。 分開后,報(bào)告基因發(fā)出熒光。
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