手機自帶應(yīng)用商店在方便用戶之時，也暗藏危機。手機應(yīng)用商店最主要的營收來源，就是各個應(yīng)用軟件的推廣分發(fā)費用，應(yīng)用軟件有下載量，應(yīng)用商店就有收入，在利益驅(qū)使下，應(yīng)用商店很容易對不良乃至非法應(yīng)用軟件“大開綠燈”，不管是否安全，是否偷取用戶資費和隱私。而在手機用戶一方，基本并不具備甄別有害應(yīng)用的能力，對手機廠商所提供的應(yīng)用商店又比較信賴，一旦應(yīng)用平臺出現(xiàn)不良乃至非法應(yīng)用，就容易上當(dāng)受騙。

在“研發(fā)預(yù)約掛號軟件獲利”等案件中，手機應(yīng)用商店應(yīng)承擔(dān)連帶責(zé)任。對入駐的軟件開發(fā)設(shè)計者、經(jīng)營者的身份資質(zhì)，應(yīng)用商店具有審查備案的義務(wù)。不良乃至非法軟件成功入駐，則表明應(yīng)用商店沒有履行好審查義務(wù)，若明明知道或在事實上已經(jīng)知道不良乃至非法軟件入駐其商店，而無動于衷，仍任其侵害用戶利益，則相當(dāng)于助紂為虐，更要承擔(dān)法律責(zé)任。此外，在手機應(yīng)用商店應(yīng)推行“官方軟件標(biāo)志”制度，使之與普通軟件相區(qū)分。