宏基因組組裝 | 就現(xiàn)在！做出改變??！
微生態(tài)研究的核心難點是什么！
基因組組裝！
????????從宏基因組數(shù)據(jù)中組裝獲得細菌的完整基因組（complete MAGs）是微生物組研究的長期目標，但基于NGS的宏基因組測序和組裝方法是無法實現(xiàn)完整的細菌基因組組裝的。即便是紅極一時的宏基因組Binning, 依舊存在組裝碎片化，污染率高的問題！
????????伴隨著技術的不斷進步，實現(xiàn)complete MAGs組裝已成為現(xiàn)實！三代長讀長測序大幅度提升了宏基因組的組裝效果，成功解決了NGS宏基因組鑒定種群較少、優(yōu)勢菌種基因組組裝質(zhì)量較差，核心基因組分功能信息分析不全等問題。
????????更準確的微生物物種分類，更全面的功能基因組注釋無疑已成為微生態(tài)研究者的更高目標和追求！
三代測序時代已全面來臨
就現(xiàn)在！期待您的宏組學研究也做出改變！
參考文獻
1.?HiFi metagenomic sequencing enables assembly of accurate and complete genomes from human gut microbiota. Nature Communications, 2022.
2.?Expanded catalogue of metagenome-assembled genomes reveals resistome characteristics and athletic performance-associated microbes in horse. Microbiome, 2023.
3.?Assessing long-read sequencing with Nanopore R9, R10 and PacBio CCS to obtain high-quality metagenome assembled genomes from complex microbial communities. bioRxiv, 2021.
